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Produkte

Eukaryotische mRNA-Sequenzierung – Illumina

Die mRNA-Sequenzierung ermöglicht die Profilierung aller mRNAs, die unter bestimmten Bedingungen von Zellen transkribiert wurden.Es ist eine leistungsstarke Technologie zur Aufdeckung von Genexpressionsprofilen, Genstrukturen und molekularen Mechanismen bestimmter biologischer Prozesse.Bisher wurde die mRNA-Sequenzierung in der Grundlagenforschung, der klinischen Diagnostik, der Arzneimittelentwicklung usw. weit verbreitet eingesetzt.

Plattform: Illumina NovaSeq 6000


Servicedetails

Bioinformatik

Demo-Ergebnisse

Vorteile

ØSehr erfahren: Über 200.000 Proben wurden in BMK verarbeitet, die verschiedene Probentypen abdecken, darunter Zellkulturen, Gewebe, Körperflüssigkeiten usw., und über 7.000 abgeschlossene mRNA-Seq-Projekte, die verschiedene Forschungsbereiche abdecken.

ØStrenges Qualitätskontrollsystem: Wichtige Qualitätskontrollpunkte in allen Schritten, einschließlich Probenvorbereitung, Bibliotheksvorbereitung, Sequenzierung und Bioinformatik, werden genau überwacht, um qualitativ hochwertige Ergebnisse zu liefern.

ØMehrere Datenbanken für Funktionsannotationen und Anreicherungsstudien verfügbar, um verschiedene Forschungsziele zu erfüllen.

ØAfter-Sales-Services: After-Sales-Services gültig für 3 Monate nach Projektabschluss, einschließlich Projektnachbereitung, Fehlerbehebung, Fragen und Antworten zu Ergebnissen usw.

Musteranforderungen und Lieferung

Bücherei Sequenzierungsstrategie Daten empfohlen Qualitätskontrolle
Poly A angereichert Illumina PE150

6 GB

Q30≥85%

Beispielanforderungen:

Nukleotide:

Reinheit Integrität Menge
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Begrenzte oder keine Protein- oder DNA-Kontamination auf dem Gel. Für Pflanzen: RIN≥6,5; Für Tiere: RIN≥7;28S/18S≥1,0;begrenzte oder keine Grundlinienerhöhung Konz.≥30 ng/μl;Volumen ≥ 10 μl;Gesamt ≥ 1,5 μg

Gewebe: Gewicht (trocken):≥1g
*Für Gewebe, das kleiner als 5 mg ist, empfehlen wir, eine schockgefrorene (in flüssigem Stickstoff) Gewebeprobe zu versenden.

Zellsuspension:Zellzahl = 3×106- 1×107
*Wir empfehlen, gefrorenes Zelllysat zu versenden.Für den Fall, dass die Zellzahlen kleiner als 5 × 105 sind, wird ein Schockgefrieren in flüssigem Stickstoff empfohlen, was für die Mikroextraktion vorzuziehen ist.

Blutproben:Volumen≥1 ml

Mikroorganismus:Masse ≥ 1 g

Empfohlene Musterlieferung

Behälter: 2 ml Zentrifugenröhrchen (Alufolie wird nicht empfohlen)

Musterbeschriftung: Gruppe+Replikat zB A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Sendung:

  1. Trockeneis: Proben müssen in Beutel verpackt und in Trockeneis vergraben werden.
  2. RNAstable-Röhrchen: RNA-Proben können in RNA-Stabilisierungsröhrchen (z. B. RNAstable®) getrocknet und bei Raumtemperatur versandt werden.

Service-Arbeitsablauf

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Experimentdesign

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Musterlieferung

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RNA-Extraktion

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Bibliotheksbau

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Sequenzierung

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Datenanalyse

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Kundendienst


  • Bisherige:
  • Nächste:

  • Bioinformatik

    2(1)

    Eukaryotisch Ablauf der mRNA-Sequenzanalyse

    Bioinformatik

    ØQualitätskontrolle der Rohdaten

    ØReferenzgenom-Alignment

    ØAnalyse der Transkriptstruktur

    ØAusdrucksquantifizierung

    ØDifferentialausdrucksanalyse

    ØFunktionsannotation und -anreicherung

    1.mRNA-Daten Sättigungskurve

    3(1)

    2.Differentielle Expressionsanalyse – Volcano-Plot

    4(1)

    3.KEGG-Anmerkung auf DEGs

    5(1)

    4.GO-Klassifizierung auf DEGs

    6(1)

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