BMKGENE a furnizat servicii de secvențiere a transcriptomului spațial pentru studiul „STEEL permite delimitarea de înaltă rezoluție a datelor transcriptomice spațiotemporale”, care a fost publicat în Briefings in Bioinformatics.
Acest studiu a propus un algoritm nesupravegheat și multiplu bazat pe învățare, Spatial Transcriptome Cell typE clustering (STEEL), care identifică domeniile din transcriptomul spațial prin gruparea margelelor care prezintă atât profiluri de expresie genetică foarte asemănătoare, cât și distanță spațială apropiată în felul graficelor.
O evaluare cuprinzătoare a STEEL pe seturi de date transcriptomice spațiale de la platforma 10X Visium demonstrează că nu numai că atinge o rezoluție înaltă pentru a caracteriza structurile fine ale creierului șoarecelui, dar permite și integrarea mai multor diapozitive de țesut analizate individual într-una mai mare.
Odată cu progresul tehnologiilor transcriptomului spațial, metoda noastră va avea o mare aplicabilitate în identificarea domeniului și reconstrucția atlasului de expresie genică.
ClicAicipentru a afla mai multe despre acest studiu.
Ora postării: Oct-20-2023