Re-secvențierea întregului genom bacterian și fungic
Proiectele de re-secvențiere a întregului genom bacteriene și fungice sunt esențiale pentru avansarea genomicii microbiene, permițând finalizarea și compararea genomilor microbieni. Acest lucru facilitează ingineria fermentației, optimizarea proceselor industriale și explorarea căilor secundare de metabolism. În plus, resecvențierea fungică și bacteriană este crucială pentru înțelegerea adaptării la mediu, optimizarea tulpinilor și dezvăluirea dinamicii evoluției genetice, cu implicații largi în medicină, agricultură și știința mediului.
Avantajele serviciului
●Analiza bioinformatică include apelarea variantelor:Furnizarea de informații funcționale asupra genomilor re-secvențializați.
● Experiență extinsă: Cu mii de proiecte de re-secvențiere microbiană desfășurate anual, aducem peste un deceniu de experiență, o echipă de analiză cu înaltă calificare, conținut cuprinzător și asistență post-vânzare excelentă.
●Asistență post-vânzare:Angajamentul nostru se extinde dincolo de finalizarea proiectului cu o perioadă de service post-vânzare de 3 luni. În acest timp, oferim urmărire a proiectului, asistență pentru depanare și sesiuni de întrebări și răspunsuri pentru a răspunde oricăror întrebări legate de rezultate.
Specificații de service
| Platformă de secvențiere | Strategia de secvențiere | Date recomandate | Controlul calității |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Adâncime de 100x | Q30≥85% |
Cerințe pentru mostre
| Concentrație (ng/µL) | Suma totală (ng) | Volumul (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bacterii: ≥1x107 celule
Ciuperci unicelulare: ≥5x106-1x107 celule
Macro ciuperci: ≥4g
Fluxul de lucru al serviciului
Livrare mostre
Construcția bibliotecii
Secvențierea
Analiza datelor
Servicii post-vânzare
Include următoarea analiză:
- Secvențierea controlului calității datelor
- Alinierea la genomul de referință
- Varianta de apelare: SNP și InDel
- Adnotare variantă
Varianta de apelare: tipuri SNP
Varianta de apelare: distribuția lungimii InDel
Explorați progresele facilitate de serviciile de resecvențiere a genomului microbian de la BMKGene printr-o colecție de publicații organizată.
Jia, Y. şi colab. (2023) „Combinarea transcriptomului și re-secvențierii întregului genom pentru a analiza genele de rezistență la boli pentru Wheat Dwarf Bunt”,Jurnalul internațional de științe moleculare, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. şi colab. (2023) „Metabolismul glucozei controlat de ampicilină manipulează tranziția de la toleranță la rezistență la bacterii”,Progresele științei, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. şi colab. (2022) „Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., o bacterie haloalcalifilă izolată dintr-un lac de sifon din Regiunea Autonomă Mongolia Interioară, China', Int. J. Syst. Evol.Microbiol, 72, p. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. şi Wang, G.-H. (2024) „Secvența genomică a Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, izolată din Nasonia vitripennis”,Anunțuri privind resursele de microbiologie. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
