Resecvențierea întregului genom bacterian și fungic
Proiectele de resecvențiere a întregului genom bacterian și fungic sunt esențiale pentru avansarea genomicii microbiene, permițând completarea și compararea genomurilor microbiene. Acest lucru facilitează ingineria fermentației, optimizarea proceselor industriale și explorarea căilor metabolice secundare. În plus, resecvențierea fungică și bacteriană este crucială pentru înțelegerea adaptării la mediu, optimizarea tulpinilor și dezvăluirea dinamicii evoluției genetice, cu implicații largi în medicină, agricultură și știința mediului.
Avantajele serviciilor
●Analiza bioinformatică include apelarea variantelor:Oferirea de informații funcționale asupra genomurilor resecvențiate.
● Expertiză vastăCu mii de proiecte de resecvențiere microbiană desfășurate anual, aducem peste un deceniu de experiență, o echipă de analiză extrem de calificată, conținut cuprinzător și asistență post-vânzare excelentă.
●Asistență post-vânzare:Angajamentul nostru se extinde dincolo de finalizarea proiectului, cu o perioadă de service post-vânzare de 3 luni. În acest timp, oferim urmărirea proiectului, asistență pentru depanare și sesiuni de întrebări și răspunsuri pentru a răspunde oricăror întrebări legate de rezultate.
Specificații de service
| Platformă de secvențiere | Strategia de secvențiere | Date recomandate | Controlul calității |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Adâncime de 100x | Q30≥85% |
Cerințe pentru mostre
| Concentrație (ng/µL) | Cantitate totală (ng) | Volum (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bacterii: ≥1x107 celule
Ciuperci unicelulare: ≥5x106-1x107 celule
Macrociuperci: ≥4g
Flux de lucru al serviciului
Livrare de mostre
Construcția bibliotecii
Secvențiere
Analiza datelor
Servicii post-vânzare
Include următoarea analiză:
- Controlul calității datelor de secvențiere
- Alinierea la genomul de referință
- Apelarea variantelor: SNP și InDel
- Adnotare variantă
Apelarea variantelor: tipuri de SNP-uri
Apelarea variantelor: Distribuția lungimii InDel
Explorați progresele facilitate de serviciile de resecvențiere a genomului microbian ale BMKGene prin intermediul unei colecții atent selecționate de publicații.
Jia, Y. și colab. (2023) „Combinarea resecvențierii transcriptomului și a întregului genom pentru a depista genele de rezistență la boli pentru mălăria pitică de grâu”,Revista internațională de științe moleculare, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. și colab. (2023) „Metabolismul glucozei controlat de ampicilină manipulează tranziția de la toleranță la rezistență la bacterii”,Progresele științifice, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. și colab. (2022) „Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., o bacterie haloalcalifilă izolată dintr-un lac de sodă din Regiunea Autonomă Mongolia Interioară, China”, Int. J. Syst. Evol.Microbiologie, 72, p. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. și Wang, G.-H. (2024) „Secvența genomului Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, izolată din Nasonia vitripennis”,Anunțuri privind resursele de microbiologiedoi: 10.1128/MRA.00802-23.
