BMKGENE a fourni des services de séquençage spatial du transcriptome pour l'étude « STEEL permet une délimitation à haute résolution des données transcriptomiques spatio-temporelles », qui a été publiée dans Briefings in Bioinformatics.
Cette étude a proposé un algorithme non supervisé et basé sur l'apprentissage multiple, Spatial Transcriptome cEll typE clustering (STEEL), qui identifie les domaines du transcriptome spatial en regroupant des billes présentant à la fois des profils d'expression génique très similaires et une distance spatiale proche sous forme de graphiques.
Une évaluation complète de STEEL sur des ensembles de données transcriptomiques spatiales de la plateforme 10X Visium démontre qu'il atteint non seulement une haute résolution pour caractériser les structures fines du cerveau de souris, mais permet également l'intégration de plusieurs lames de tissus analysées individuellement dans une plus grande.
Avec l’avancement des technologies du transcriptome spatial, notre méthode aura une grande applicabilité dans l’identification de domaines et la reconstruction d’atlas d’expression génique.
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Heure de publication : 20 octobre 2023