BMKGENE teikė erdvinio transkripto sekos nustatymo paslaugas tyrimui „STEEL leidžia didelės skiriamosios gebos nubrėžti erdvinius transkriptominius duomenis“, kuris buvo paskelbtas „Biefings in Bioinformatics“.
Šiame tyrime buvo pasiūlytas neprižiūrimas ir įvairiapusiškai mokymusi paremtas algoritmas, erdvinio transkripto ląstelių tipo klasterizavimas (STEEL), kuris identifikuoja erdvinio transkripto domenus, sugrupuodamas karoliukus, turinčius labai panašius genų ekspresijos profilius ir artimą erdvinį atstumą grafikų būdu.
Išsamus STEEL įvertinimas erdvinių transkriptominių duomenų rinkiniuose iš 10X Visium platformos rodo, kad jis ne tik pasiekia didelę skiriamąją gebą, kad būtų galima apibūdinti smulkias pelės smegenų struktūras, bet ir leidžia integruoti kelis atskirai analizuojamus audinių skaidres į didesnę.
Tobulėjant erdvinio transkripto technologijoms, mūsų metodas bus puikiai pritaikomas domenų identifikavimui ir genų ekspresijos atlaso rekonstrukcijai.
SpustelėkitečiaNorėdami sužinoti daugiau apie šį tyrimą.
Paskelbimo laikas: 2023-10-20