mRNA-seq (NGS) cu genom de referință
RNA-seq este un instrument standard în științele vieții și ale culturilor, reducând decalajul dintre genomuri și proteomi. Punctul său forte constă în descoperirea de noi transcrieri și cuantificarea expresiei acestora într-un singur test. Este utilizat pe scară largă pentru studii transcriptomice comparative, evidențiind genele legate de diverse trăsături sau fenotipuri, cum ar fi compararea mutanților cu tipurile sălbatice sau dezvăluirea expresiei genelor în condiții specifice. Aplicația BMKCloud mRNA (Reference) integrează cuantificarea expresiei, analiza expresiei diferențiale (DEG) și analiza structurii secvențelor în conducta bioinformatică mRNA-seq (NGS) și combină punctele forte ale unor software-uri similare, asigurând confort și ușurință în utilizare. Utilizatorii își pot încărca datele RNA-seq în cloud, unde aplicația oferă o soluție completă de analiză bioinformatică unică. În plus, prioritizează experiența clientului, oferind operațiuni personalizate adaptate nevoilor specifice ale utilizatorilor. Utilizatorii pot seta parametri și pot trimite singuri misiunea conductei, pot verifica raportul interactiv, pot vizualiza date/diagrame și pot finaliza extragerea datelor, cum ar fi: selecția genei țintă, gruparea funcțională, diagrame etc.
Platformă:Illumina, MGI
Strategie:ARN-Seq
Aspect: Paried, date curate.
Tip bibliotecă:fr-necatenar, fr-primul cadru sau fr-al doilea cadru
Lungimea citirii:150 bp
Tip fișier:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz sau *.fq.gz. Sistemul vaasociază automat fișierele .fastq în funcție de numele lor de fișiere,De exemplu, *_1.fastq este asociat cu *._2.fastq.
Număr de eșantioane:Nu există restricții privind numărulde probe, dar timpul de analiză va crește pe măsură ce numărul deprobele cresc.
Cantitate de date recomandată:6G per eșantion
