ARNnc
ARN-urile lungi necodificatoare (ARNnc) sunt ARN-uri mai lungi de 200 de nucleotide cu potențial de codificare scăzut, dar cu funcții de reglare critice. Canalul BMKCloud lncRNA este conceput pentru a analiza bibliotecile cu conținut scăzut de ARNr, cu un genom de referință de înaltă calitate și bine adnotat, prin analizarea împreună a expresiei ARNnc și ARNm. După ajustarea citirilor și controlul calității, citirile sunt aliniate la genomul de referință pentru a asambla transcrieri, iar analiza ulterioară a structurii genelor relevă splicing alternativ și gene noi. Transcrierile sunt identificate ca ARNm sau ARNnc, iar analiza expresiei diferențiale identifică ARNnc exprimate diferențial, țintele acestora și genele exprimate diferențial (DEGS). Atât DEG-urile, cât și țintele ARNnc exprimate diferențial sunt adnotate funcțional pentru a găsi categorii funcționale îmbogățite.
Bioinformatică
