Ang BMKGENE ay nagbigay ng spatial transcriptome sequencing services para sa pag-aaral na "STEEL ay nagbibigay-daan sa mataas na resolution ng delineation ng spatiotemporal transcriptomic data", na na-publish sa Briefings in Bioinformatics.
Iminungkahi ng pag-aaral na ito ang isang unsupervised at manifold learning-based algorithm, Spatial Transcriptome cEll typE clustering (STEEL), na kinikilala ang mga domain mula sa spatial transcriptome sa pamamagitan ng clustering beads na nagpapakita ng parehong magkatulad na mga profile ng expression ng gene at malapit na spatial na distansya sa paraan ng mga graph.
Ang isang komprehensibong pagsusuri ng STEEL sa spatial transcriptomic datasets mula sa 10X Visium platform ay nagpapakita na hindi lamang ito nakakamit ng isang mataas na resolusyon upang makilala ang mga pinong istruktura ng utak ng mouse ngunit nagbibigay-daan din sa pagsasama ng maraming mga slide ng tissue na indibidwal na nasuri sa isang mas malaki.
Sa pagsulong ng mga spatial transcriptome na teknolohiya, ang aming pamamaraan ay magkakaroon ng mahusay na kakayahang magamit sa pagkakakilanlan ng domain at muling pagtatayo ng gene expression atlas.
I-clickditoupang matuto nang higit pa tungkol sa pag-aaral na ito.
Oras ng post: Okt-20-2023