BMKGENE, Brifings in Bioinformatics'te yayınlanan "STEEL, uzay-zamansal transkriptomik verilerin yüksek çözünürlüklü tanımlanmasını sağlar" çalışması için uzaysal transkriptom dizileme hizmetleri sağladı.
Bu çalışma, hem oldukça benzer gen ekspresyon profilleri hem de grafikler şeklinde yakın uzamsal mesafe sergileyen boncukları kümeleyerek uzamsal transkriptomdan alanları tanımlayan, denetimsiz ve çok yönlü öğrenmeye dayalı bir algoritma olan Uzamsal Transkriptom hücre tipi kümelemeyi (STEEL) önermiştir.
10X Visium platformundan alınan uzamsal transkriptomik veri kümeleri üzerinde STEEL'in kapsamlı bir değerlendirmesi, yalnızca fare beyninin ince yapılarını karakterize etmek için yüksek bir çözünürlük elde etmekle kalmayıp, aynı zamanda ayrı ayrı analiz edilen birden fazla doku slaytının daha büyük bir slayta entegrasyonunu da mümkün kıldığını göstermektedir.
Uzamsal transkriptom teknolojilerinin gelişmesiyle birlikte, yöntemimiz alan tanımlama ve gen ekspresyonu atlasının yeniden yapılandırılmasında büyük uygulanabilirliğe sahip olacaktır.
TıklamakBuradaBu çalışma hakkında daha fazla bilgi edinmek için.
Gönderim zamanı: 20 Ekim 2023