Séquençage de petits ARN-Illumina
Caractéristiques
● Sélection de la taille de l'ARN avant la préparation de la bibliothèque
● Analyse bioinformatique centrée sur la prédiction des miARN et de leurs cibles
Avantages des services
●Analyse bioinformatique complète :permettant l'identification de miARN connus et nouveaux, l'identification de cibles de miARN et l'annotation fonctionnelle correspondante et l'enrichissement avec de multiples bases de données (KEGG, GO)
●Contrôle qualité rigoureux: nous mettons en œuvre des points de contrôle de base à toutes les étapes, de la préparation des échantillons et des bibliothèques au séquençage et à la bioinformatique.Ce suivi méticuleux garantit la fourniture de résultats constants de haute qualité.
●Assistance après-vente: Notre engagement s'étend au-delà de la réalisation du projet avec une période de service après-vente de 3 mois.Pendant cette période, nous proposons un suivi de projet, une assistance au dépannage et des séances de questions-réponses pour répondre à toute question liée aux résultats.
●Une expertise étendue: avec une expérience dans la clôture réussie de plusieurs projets ARNs couvrant plus de 100 espèces dans divers domaines de recherche, notre équipe apporte une richesse d'expérience à chaque projet.
Exigences et livraison des échantillons
| Bibliothèque | Plate-forme | Données recommandées | CQ des données |
| Taille sélectionnée | Illumina SE50 | 10 à 20 millions de lectures | Q30≥85 % |
Exigences de l'échantillon :
Nucléotides :
| Conc. (ng/μl) | Quantité (μg) | Pureté | Intégrité |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 Contamination limitée ou inexistante en protéines ou en ADN indiquée sur le gel. | RIN≥6,5 ; 5,0≥28S/18S≥1,0 ; élévation de la ligne de base limitée ou inexistante |
● Plantes :
Racine, tige ou pétale : 450 mg
Feuille ou graine : 300 mg
Fruits : 1,2 g
●Animal :
Coeur ou Intestin : 450 mg
Viscères ou Cerveau : 240 mg
Muscles : 600 mg
Os, cheveux ou peau : 1,5 g
● Arthropodes :
Insectes : 9g
Crustacés : 450 mg
● Sang total: 2 tubes
● Cellules : 106 cellules
● Sérum et Plasma :6 ml
Livraison d’échantillon recommandée
Récipient:
Tube à centrifuger de 2 ml (le papier d’aluminium n’est pas recommandé)
Étiquetage des échantillons : Groupe + répétition, par exemple A1, A2, A3 ;B1, B2, B3... ...
Expédition:
1. Glace sèche : Les échantillons doivent être emballés dans des sacs et enterrés dans de la glace carbonique.
2.Tubes RNAstable : les échantillons d'ARN peuvent être séchés dans un tube de stabilisation d'ARN (par exemple RNAstable®) et expédiés à température ambiante.
Flux de travail des services
Conception d'expériences
Livraison d'échantillon
Extraction d'ARN
Construction d'une bibliothèque
Séquençage
L'analyse des données
Services après-vente
Bioinformatique
Identification des miARN : structure et profondeur
Expression différentielle des miARN – regroupement hiérarchique
Annotation fonctionnelle de la cible des miARN exprimés différentiellement
Explorez les progrès de la recherche facilités par les services de séquençage d’ARNs de BMKGene à travers une collection organisée de publications.
Chen, H. et al.(2023) « Les infections virales inhibent la biosynthèse et la photosynthèse de la saponine chez Panax notoginseng », Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038. est ce que je : 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et coll.(2023) « La protéine FREE1 contenant le domaine FYVE de la plante s'associe à des composants de microprocesseur pour réprimer la biogenèse des miARN », rapporte EMBO, 24(1).est ce que je: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) « Le microARN Ame-Bantam-3p contrôle le développement des pupes larvaires en ciblant le gène 8 de plusieurs domaines de type facteur de croissance épidermique (megf8) chez l'abeille domestique, Apis mellifera », International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p .5726. est ce que je : 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et coll.(2018) « L'analyse intégrée des miARN et des gènes associés à la qualité de la viande révèle que le Gga-MiR-140-5p affecte le dépôt de graisse intramusculaire chez les poulets », Physiologie cellulaire et biochimie, 46(6), pp. 2421-2433.est ce que je: 10.1159/000489649.
