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Produits

Re-séquençage du génome entier bactérien et fongique

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Les projets de re-séquençage du génome entier bactérien et fongique sont essentiels pour faire progresser la génomique microbienne en permettant de compléter et de comparer les génomes microbiens. Cela facilite l’ingénierie de la fermentation, l’optimisation des processus industriels et l’exploration des voies métaboliques secondaires. En outre, le re-séquençage fongique et bactérien est crucial pour comprendre l’adaptation environnementale, optimiser les souches et révéler la dynamique de l’évolution génétique, avec de vastes implications en médecine, en agriculture et en sciences de l’environnement.


Détails des services

Bioinformatique

Résultats de la démonstration

Publications en vedette

Avantages des services

L'analyse bioinformatique inclut l'appel de variantes :Fournir des informations fonctionnelles sur les génomes reséquencés.

● Expertise étendue: Avec des milliers de projets de re-séquençage microbien menés chaque année, nous apportons plus d'une décennie d'expérience, une équipe d'analyse hautement qualifiée, un contenu complet et un excellent support après-vente.

Assistance après-vente :Notre engagement s'étend au-delà de l'achèvement du projet avec une période de service après-vente de 3 mois. Pendant cette période, nous proposons un suivi de projet, une assistance au dépannage et des séances de questions-réponses pour répondre à toute question liée aux résultats.

Spécifications des services

Plateforme de séquençage

Stratégie de séquençage

Données recommandées

Contrôle de qualité

Illumina NovaSeq

PE150

Profondeur de 100x

Q30≥85 %

Exemples d'exigences

Concentration (ng/μL)

Montant total (ng)

Volume (µL)

≥1

≥60

≥20

Bactéries : ≥1x107 cellules

Champignons unicellulaires : ≥5x106-1x107 cellules

Macrochampignons : ≥4 g

Flux de travail des services

livraison d'échantillon

Livraison d'échantillon

Préparation de la bibliothèque

Construction d'une bibliothèque

Séquençage

Séquençage

Analyse des données

Analyse des données

Services après-vente

Services après-vente


  • Précédent:
  • Suivant:

  • Jour 11-01

    Comprend l'analyse suivante :

    • Contrôle de la qualité des données de séquençage
    • Alignement sur le génome de référence
    • Appel de variantes : SNP et InDel
    • Annotation de variante

     

    Appel de variantes : types SNP

     

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    Appel de variantes : distribution de longueur InDel

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    Explorez les progrès facilités par les services de re-séquençage du génome microbien de BMKGene à travers une collection organisée de publications.

    Jia, Y. et al. (2023) « Combiner le re-séquençage du transcriptome et du génome entier pour dépister les gènes de résistance aux maladies pour la carie naine du blé »,Revue internationale des sciences moléculaires, 24(24). est ce que je: 10.3390/IJMS242417356.

    Jiang, M. et coll. (2023) « Le métabolisme du glucose contrôlé par l'ampicilline manipule la transition de la tolérance à la résistance chez les bactéries »,Avancées scientifiques, 9(10). est ce que je: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.

    Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., une bactérie haloalcaliphile isolée d'un lac de soude dans la région autonome de Mongolie intérieure, Chine', Int. J. Syst. Évol.Microbiol, 72, p. 5263. est ce que je : 10.1099/ijsem.0.005263.

    Zhu, Z., Wu, R. et Wang, G.-H. (2024) « Séquence génomique de Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, isolée de Nasonia vitripennis »,Annonces de ressources en microbiologie. est ce que je: 10.1128/MRA.00802-23.

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