Séquençage long non codant-Illumina
Avantages des services
●Analyse conjointe de l'ARNm et de l'ARNnc: en combinant la quantification des transcrits d'ARNm avec l'étude des ARNnc et de leurs cibles, il est possible d'avoir un aperçu approfondi du mécanisme de régulation qui sous-tend la réponse cellulaire.
●Une expertise étendue: Notre équipe apporte une richesse d'expérience à chaque projet, avec un historique de traitement de plus de 23 000 échantillons chez BMK couvrant divers types d'échantillons et projets lncRNA.
●Contrôle qualité rigoureux: Nous mettons en œuvre des points de contrôle de base à toutes les étapes, de la préparation des échantillons et des bibliothèques au séquençage et à la bioinformatique. Ce suivi méticuleux garantit la fourniture de résultats constants de haute qualité.
●Assistance après-vente: Notre engagement s'étend au-delà de la réalisation du projet avec une période de service après-vente de 3 mois. Pendant cette période, nous proposons un suivi de projet, une assistance au dépannage et des séances de questions-réponses pour répondre à toute question liée aux résultats.
Exigences et livraison des échantillons
| Bibliothèque | Plate-forme | Données recommandées | CQ des données |
| Bibliothèque directionnelle appauvrie en ARNr | Illumina PE150 | 10-16 Go | Q30≥85 % |
Nucléotides :
| Conc. (ng/μl) | Quantité (μg) | Pureté | Intégrité |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 Contamination limitée ou inexistante en protéines ou en ADN indiquée sur le gel. | RIN≥6,0 ; 5,0≥28S/18S≥1,0 ; élévation de la ligne de base limitée ou inexistante |
● Plantes :
Racine, tige ou pétale : 450 mg
Feuille ou graine : 300 mg
Fruits : 1,2 g
●Animal :
Coeur ou Intestin : 450 mg
Viscères ou Cerveau : 240 mg
Muscles : 600 mg
Os, cheveux ou peau : 1,5 g
● Arthropodes :
Insectes : 9g
Crustacés : 450 mg
● Sang total :2 tubes
● Cellules: 106 cellules
● Sérum et Plasma: 6 ml
Livraison d’échantillon recommandée
Récipient : tube à centrifuger de 2 ml (le papier d'aluminium n'est pas recommandé)
Étiquetage des échantillons : Groupe + répétition, par exemple A1, A2, A3 ; B1, B2, B3.
Expédition:
1. Glace sèche : Les échantillons doivent être emballés dans des sacs et enterrés dans de la neige carbonique.
2. Tubes RNAstable : les échantillons d'ARN peuvent être séchés dans un tube de stabilisation d'ARN (par exemple RNAstable®) et expédiés à température ambiante.
Flux de travail des services
Conception d'expériences
Livraison d'échantillon
Extraction d'ARN
Construction d'une bibliothèque
Séquençage
Analyse des données
Services après-vente
Bioinformatique
Analyse de l'expression génique différentielle (DEG)
Quantification de l’expression de lncRNA – clustering
Enrichissement des gènes cibles lncRNA
Analyse conjointe de la position de l'ARNm et de l'ARNlnc – Tracé Circos (le cercle du milieu est l'ARNm et le cercle interne est l'ARNlnc)
Explorez les progrès facilités par les services de séquençage lncRNA de BMKGene à travers une collection organisée de publications.
Ji, H. et al. (2020) « Identification, prédiction fonctionnelle et vérification clé des ARNlnc liés au stress dû au froid dans le foie de rat », Rapports scientifiques 2020 10 : 1, 10(1), pp. est ce que je: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) « L'analyse transcriptomique intégrative révèle le mécanisme immunitaire d'une souche de carpe commune résistante au CyHV-3 », Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. est ce que je : 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et coll. (2022) « Priorisation basée sur l'intégration multi-omique des réseaux de régulation d'ARN endogènes concurrents dans le cancer du poumon à petites cellules : caractéristiques moléculaires et candidats médicaments », Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. est ce que je : 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et coll. (2020) « Dissection génétique du réseau de coexpression génique sous-jacent à la photosynthèse chez Populus », Plant Biotechnology Journal, 18(4), pp. est ce que je : 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) « Un réseau mondial de réglementation de l'expression génique dérégulée et de la signalisation métabolique anormale dans les cellules immunitaires du microenvironnement de la maladie de Basedow et de la thyroïdite de Hashimoto », Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. est ce que je : 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
