Petit ARN

Les petits ARN (sRNA) sont de courts ARN non codants d'une longueur moyenne de 18 à 30 nucléotides, incluant les miRNA, siRNA et piRNA, qui jouent un rôle important dans les processus de régulation. Le pipeline BMKCloud sRNA propose des analyses standard et personnalisées pour l'identification des miRNA. Après l'élimination des séquences de mauvaise qualité et le contrôle qualité, les lectures sont alignées sur plusieurs bases de données afin de classifier les sRNA et de sélectionner les miRNA, puis alignées sur le génome de référence. L'identification des miRNA repose sur des bases de données de miRNA connues, fournissant des informations sur leur structure secondaire, leur famille et leurs gènes cibles. L'analyse d'expression différentielle identifie les miRNA exprimés de manière différentielle et les gènes cibles correspondants sont annotés fonctionnellement afin de déterminer les catégories enrichies.