page_head_bg

ସମ୍ବାଦ |

GENOME EVOLUTION, PANGENOME |

ପାନ-ଜେନୋମ କ’ଣ?

ସଂଗୃହିତ ପ୍ରମାଣ ଦର୍ଶାଏ ଯେ ଏକ ପ୍ରଜାତିର ବିଭିନ୍ନ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ମଧ୍ୟରେ ଭିନ୍ନତା ବହୁତ ବଡ ହୋଇପାରେ |ଗୋଟିଏ ପ୍ରଜାତିର ଜେନେଟିକ ତଥ୍ୟର ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଚିତ୍ର ପାଇବା ପାଇଁ ଗୋଟିଏ ଗୋଟିଏ ଜିନୋମ ଯଥେଷ୍ଟ ଦୂରରେ |ପାନ-ଜେନୋମ ଅଧ୍ୟୟନର ଉଦ୍ଦେଶ୍ୟ ହେଉଛି ଏକ ପ୍ରଜାତିର ଅଧିକ ବିସ୍ତୃତ ଜେନୋମିକ୍ ଗ୍ରାଫ୍ ହାସଲ କରିବା ଏବଂ ଅନେକ ଷ୍ଟ୍ରେନ୍ ର ଜେନୋମ ଡି ନୋଭୋ ଆସେମ୍ବଲିଙ୍ଗ୍ କରି ଗୁଣ ଏବଂ ଜେନେଟିକ୍ କୋଡ୍ ମଧ୍ୟରେ ସମ୍ପର୍କକୁ ଡିକୋଡ୍ କରିବା, ଯାହା ବିବିଧତାର ଏକ ଗଭୀର ଏବଂ ବ୍ୟାପକ ଖନନକୁ ଅନୁମତି ଦେଇଥାଏ |

ପାନ୍-ଜେନୋମ୍ ଅଧ୍ୟୟନର ଧାରା |

1

ଚିତ୍ର 1 ପାନ୍-ଜିନୋମର ପ୍ରକାଶିତ ଅନୁସନ୍ଧାନ କାଗଜପତ୍ରର ଧାରା |
ଟିପ୍ପଣୀ: ପ୍ରକୃତି, ସେଲ୍ ଏବଂ ସାଇନ୍ସ ସିରିଜ୍ ଜର୍ଣ୍ଣାଲରେ ପ୍ରକାଶିତ ପ୍ରବନ୍ଧଗୁଡ଼ିକର ଆଖ୍ୟା ଖୋଜିବା ପାଇଁ “ପ୍ୟାନ୍-ଜେନୋମ୍” କୁ ମୁଖ୍ୟ ଶବ୍ଦ ଭାବରେ ଗ୍ରହଣ କରିବାର ଫଳାଫଳ ଦର୍ଶାଏ |

a।ଏକାଧିକ ନମୁନାରୁ ପ Read ଼ା ଏକ ରେଫରେନ୍ସ ସହିତ ସମାନ୍ତରାଳ ଏବଂ ଅଣସଂରକ୍ଷିତଗୁଡ଼ିକ ଉପନ୍ୟାସ କଣ୍ଟିଗ୍ସରେ ଏକତ୍ରିତ |ଏହି ଉପନ୍ୟାସ କଣ୍ଟିଗ୍ଗୁଡ଼ିକୁ ମୂଳ ରେଫରେନ୍ସ କ୍ରମରେ ଯୋଡି ଏକ ପେଙ୍ଗେନୋମ୍ ରେଫରେନ୍ସ ନିର୍ମାଣ କରାଯାଇପାରିବ |ସମସ୍ତ ପ read ଼ାକୁ ପେଙ୍ଗେନୋମକୁ ମ୍ୟାପିଂ କରିବା ଉପରେ ଡିସପେନ୍ସେବଲ୍ ଅଞ୍ଚଳ ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରାଯାଏ |

ଖ।ଏକାଧିକ ଆକ୍ସେସନ୍ସର ଜିନୋମଗୁଡିକର ଡି ନୋଭୋ ଆସେମ୍ବଲି ଡିସପେନସେବଲ୍ ଜେନୋମିକ୍ ଅଞ୍ଚଳଗୁଡ଼ିକୁ ଚିହ୍ନିବା ପାଇଁ ପୁରା ଜିନୋମ ଆଲାଇନ୍ମେଣ୍ଟ ପଦ୍ଧତିକୁ ଅନୁମତି ଦିଏ |

ଗ।ପୁରା ଜିନୋମ ଆଲାଇନ୍ମେଣ୍ଟରୁ କିମ୍ବା ଡି ନୋଭୋ ଗ୍ରାଫ୍ ଆସେମ୍ବଲି ଦ୍ୱାରା ଏକ ପ୍ୟାନ୍-ଜେନୋମ୍ ଗ୍ରାଫ୍ ନିର୍ମାଣ କରାଯାଇପାରିବ, ଯାହା ଗ୍ରାଫ୍ ମାଧ୍ୟମରେ ଅନନ୍ୟ ପଥ ଭାବରେ ବିତରଣ ଯୋଗ୍ୟ ଅଞ୍ଚଳର ବିବିଧ ସୂଚନାକୁ ଦକ୍ଷତାର ସହିତ ସଂରକ୍ଷଣ କରିଥାଏ |

ଏକ ପ୍ୟାନ୍-ଜେନୋମ୍ କିପରି ନିର୍ମାଣ କରିବେ?

2

ଚିତ୍ର 2 ପ୍ୟାନ-ଜେନୋମ ପଦ୍ଧତିର ତୁଳନା |1

a।ଏକାଧିକ ନମୁନାରୁ ପ Read ଼ା ଏକ ରେଫରେନ୍ସ ସହିତ ସମାନ୍ତରାଳ ଏବଂ ଅଣସଂରକ୍ଷିତଗୁଡ଼ିକ ଉପନ୍ୟାସ କଣ୍ଟିଗ୍ସରେ ଏକତ୍ରିତ |ଏହି ଉପନ୍ୟାସ କଣ୍ଟିଗ୍ଗୁଡ଼ିକୁ ମୂଳ ରେଫରେନ୍ସ କ୍ରମରେ ଯୋଡି ଏକ ପେଙ୍ଗେନୋମ୍ ରେଫରେନ୍ସ ନିର୍ମାଣ କରାଯାଇପାରିବ |ସମସ୍ତ ପ read ଼ାକୁ ପେଙ୍ଗେନୋମକୁ ମ୍ୟାପିଂ କରିବା ଉପରେ ଡିସପେନ୍ସେବଲ୍ ଅଞ୍ଚଳ ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରାଯାଏ |

ଖ।ଏକାଧିକ ଆକ୍ସେସନ୍ସର ଜିନୋମଗୁଡିକର ଡି ନୋଭୋ ଆସେମ୍ବଲି ଡିସପେନସେବଲ୍ ଜେନୋମିକ୍ ଅଞ୍ଚଳଗୁଡ଼ିକୁ ଚିହ୍ନିବା ପାଇଁ ପୁରା ଜିନୋମ ଆଲାଇନ୍ମେଣ୍ଟ ପଦ୍ଧତିକୁ ଅନୁମତି ଦିଏ |

ଗ।ପୁରା ଜିନୋମ ଆଲାଇନ୍ମେଣ୍ଟରୁ କିମ୍ବା ଡି ନୋଭୋ ଗ୍ରାଫ୍ ଆସେମ୍ବଲି ଦ୍ୱାରା ଏକ ପ୍ୟାନ୍-ଜେନୋମ୍ ଗ୍ରାଫ୍ ନିର୍ମାଣ କରାଯାଇପାରିବ, ଯାହା ଗ୍ରାଫ୍ ମାଧ୍ୟମରେ ଅନନ୍ୟ ପଥ ଭାବରେ ବିତରଣ ଯୋଗ୍ୟ ଅଞ୍ଚଳର ବିବିଧ ସୂଚନାକୁ ଦକ୍ଷତାର ସହିତ ସଂରକ୍ଷଣ କରିଥାଏ |

ସମ୍ପ୍ରତି ପ୍ରକାଶିତ ପାନ-ଜେନୋମଗୁଡିକ |

● ବଳାତ୍କାର ପ୍ୟାନ-ଜେନୋମ |2

3

● ଟମାଟୋ ପ୍ୟାନ-ଜେନୋମ | 3

4

ରାଇସ୍ ପାନ୍-ଜେନୋମ୍ |4

5

● ସୂର୍ଯ୍ୟମୁଖୀ ପାନ-ଜେନୋମ |5

6

● ସୋୟାବିନ୍ ପାନ୍-ଜେନୋମ୍ | 6

7

ରାଇସ୍ ପାନ୍-ଜେନୋମ୍ |7

8

● ବାର୍ଲି ପାନ୍-ଜେନୋମ୍ |8

9

● ଗହମ ପ୍ୟାନ-ଜେନୋମ |9

10

● ସୋରିମ୍ ପାନ-ଜେନୋମ |10

11

Yt ଫାଇଟୋପ୍ଲାକ୍ଟନ୍ ପାନ୍-ଜିନୋମ୍ |11

12

ସନ୍ଦର୍ଭ

1. ବାଇର୍ ପି, ଗୋଲିଜ୍ ଏଏ, ସ୍କେବେନ୍ ଏ, ବ୍ୟାଟଲି ଜେ, ଏଡୱାର୍ଡସ୍ ଡି।ନାଟ୍ ଉଦ୍ଭିଦ |2020; 6 (8): 914-920 |doi: 10.1038 / s41477-020-0733-0

2. ଗୀତ ଜେଏମ୍, ଗୁଆନ୍ ଜେ, ହୁ ଜେ, ଇତ୍ୟାଦି |ଆଠଟି ଉଚ୍ଚ-ଗୁଣାତ୍ମକ ଜିନୋମ ପ୍ୟାନ-ଜିନୋମ ସ୍ଥାପତ୍ୟ ଏବଂ ବ୍ରାସିକା ନାପସର ଇକୋଟାଇପ୍ ଭିନ୍ନତାକୁ ପ୍ରକାଶ କରେ |ନାଟ୍ ଉଦ୍ଭିଦ |2020; 6 (1): 34-45doi: 10.1038 / s41477-019-0577-7

3. ଗାଓ ଏଲ୍, ଗୋଣ୍ଡା I, ସନ୍ ଏଚ୍, ଇତ୍ୟାଦି |ଟମାଟୋ ପ୍ୟାନ-ଜିନୋମ ନୂତନ ଜିନ୍ ଏବଂ ଫଳର ସ୍ବାଦକୁ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ କରୁଥିବା ଏକ ବିରଳ ଆଲେଲେ ଆବିଷ୍କାର କରେ |ନାଟ୍ ଜେନେଟ୍ |2019; 51 (6): 1044-1051doi: 10.1038 / s41588-019-0410-2

4. ଜାଓ Q, ଫେଙ୍ଗ୍ Q, ଲୁ ଏଚ୍, ଇତ୍ୟାଦି |ପାନ-ଜିନୋମ ବିଶ୍ଳେଷଣରେ ଚାଷ ଏବଂ ବଣୁଆ ଚାଉଳରେ ଜେନୋମିକ୍ ପରିବର୍ତ୍ତନର ପରିମାଣ ଆଲୋକିତ ହୁଏ [ପ୍ରକାଶିତ ସଂଶୋଧନ ନାଟ ଜେନେଟରେ ଦେଖାଯାଏ |2018 ଅଗଷ୍ଟ; 50 (8): 1196] |ନାଟ୍ ଜେନେଟ୍ |2018; 50 (2): 278-284 |doi: 10.1038 / s41588-018-0041-z

5. ହୁବନର୍ ଏସ୍, ବର୍କୋଭିଚ୍ ଏନ, ଟୋଡେସ୍କୋ ଏମ୍, ଇତ୍ୟାଦି |ସୂର୍ଯ୍ୟମୁଖୀ ପ୍ୟାନ-ଜେନୋମ ବିଶ୍ଳେଷଣ ଦର୍ଶାଏ ଯେ ହାଇବ୍ରିଡାଇଜେସନ୍ ପରିବର୍ତ୍ତିତ ଜେନ ବିଷୟବସ୍ତୁ ଏବଂ ରୋଗ ପ୍ରତିରୋଧକ |ନାଟ୍ ଉଦ୍ଭିଦ |2019; 5 (1): 54-62 |doi: 10.1038 / s41477-018-0329-0

6. ଲିୟୁ Y, Du H, Li P, et al।ୱାଇଲ୍ଡ ଏବଂ ଚାଷ ହୋଇଥିବା ସୋୟାବିନର ପାନ୍-ଜେନୋମ୍ |କକ୍ଷ2020; 182 (1): 162-176.e13 |doi: 10.1016 / j.cell.2020.05.023 |

7. କିନ୍ ପି, ଲୁ ଏଚ୍, ଡୁ ଏଚ୍, ଇତ୍ୟାଦି |33 ଟି ଜେନେଟିକ୍ ବିବିଧ ଚାଉଳ ଆକ୍ସେସନଗୁଡିକର ପ୍ୟାନ୍-ଜେନୋମ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣରେ ଲୁକ୍କାୟିତ ଜେନୋମିକ୍ ଭିନ୍ନତା ପ୍ରକାଶ ପାଇଥାଏ [ମୁଦ୍ରଣ ପୂର୍ବରୁ 2021 ମେ 25 ରେ ଅନଲାଇନରେ ପ୍ରକାଶିତ] |କକ୍ଷ2021; S0092-8674 (21) 00581-X |doi: 10.1016 / j.cell.2021.04.046 |

8. ଜୟକୋଡି ମି, ପଦ୍ମାରସୁ ଏସ୍, ହାବେରର୍ ଜି, ଇତ୍ୟାଦି |ବାର୍ଲୀ ପ୍ୟାନ-ଜେନୋମ ପରିବର୍ତ୍ତନର ପ୍ରଜନନ ର ଲୁକ୍କାୟିତ ପରମ୍ପରାକୁ ପ୍ରକାଶ କରେ |ପ୍ରକୃତି |2020; 588 (7837): 284-289 |doi: 10.1038 / s41586-020-2947-8

9. ୱାକୋଭିଆକ୍ ଏସ୍, ଗାଓ ଏଲ୍, ମୋନାଟ୍ ସି, ଇତ୍ୟାଦି |ଏକାଧିକ ଗହମ ଜିନୋମ ଆଧୁନିକ ପ୍ରଜନନରେ ବିଶ୍ global ର ପରିବର୍ତ୍ତନକୁ ପ୍ରକାଶ କରେ |ପ୍ରକୃତି |2020; 588 (7837): 277-283 |doi: 10.1038 / s41586-020-2961-x

10. Tao Y, Luo H, Xu J, et al।ଚାଷ ଏବଂ ବଣୁଆ ସୋରିଷର ପ୍ୟାନ-ଜିନୋମ ମଧ୍ୟରେ ବ୍ୟାପକ ପରିବର୍ତ୍ତନ [ମୁଦ୍ରଣ ପୂର୍ବରୁ 2021 ମେ 20 ରେ ଅନଲାଇନରେ ପ୍ରକାଶିତ] |ନାଟ୍ ଉଦ୍ଭିଦ |2021; 10.1038 / s41477-021-00925-xdoi: 10.1038 / s41477-021-00925-x

11. ଫ୍ୟାନ୍ ଏକ୍ସ, କ୍ୟୁୟୁ ଏଚ୍, ହାନ୍ ଡବ୍ଲୁ, ଇତ୍ୟାଦି |Phytoplankton pangenome ବିଭିନ୍ନ କାର୍ଯ୍ୟଗୁଡ଼ିକର ବ୍ୟାପକ ପ୍ରୋକାରିଓଟିକ୍ ଭୂସମାନ୍ତର ଜିନ୍ ସ୍ଥାନାନ୍ତରଣକୁ ପ୍ରକାଶ କରିଥାଏ |ବିଜ୍ଞାନ ଆଡଭ।2020; 6 (18): eaba0111 |ପ୍ରକାଶିତ 2020 ଏପ୍ରିଲ 29. doi: 10.1126 / sciadv.aba0111


ପୋଷ୍ଟ ସମୟ: ଜାନୁଆରୀ -04-2022 |

ତୁମର ବାର୍ତ୍ତା ଆମକୁ ପଠାନ୍ତୁ: