BMKCloud Log in
条形ಬ್ಯಾನರ್-03

ಸುದ್ದಿ

ಜಿನೋಮ್ ಎವಲ್ಯೂಷನ್, ಪ್ಯಾಂಗನೋಮ್

ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ಎಂದರೇನು?

ಸಂಚಿತ ಪುರಾವೆಗಳು ಜಾತಿಯ ವಿವಿಧ ತಳಿಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು ದೊಡ್ಡದಾಗಿರಬಹುದು ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.ಒಂದೇ ಜಾತಿಯ ಆನುವಂಶಿಕ ಮಾಹಿತಿಯ ಸಂಪೂರ್ಣ ಚಿತ್ರವನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಒಂದೇ ಜೀನೋಮ್ ಸಾಕಷ್ಟು ದೂರವಿದೆ.ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ಅಧ್ಯಯನದ ಉದ್ದೇಶವು ಒಂದು ಜಾತಿಯ ಹೆಚ್ಚು ಸಮಗ್ರವಾದ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಗ್ರಾಫ್ ಅನ್ನು ಪಡೆಯುವುದು ಮತ್ತು ಹಲವಾರು ತಳಿಗಳ ಜಿನೋಮ್ ಡಿ ನೊವೊ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ನಡೆಸುವ ಮೂಲಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಮತ್ತು ಜೆನೆಟಿಕ್ ಕೋಡ್‌ಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಡಿಕೋಡ್ ಮಾಡುವುದು, ಇದು ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳ ಆಳವಾದ ಮತ್ತು ವಿಶಾಲವಾದ ಗಣಿಗಾರಿಕೆಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ.

ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ಅಧ್ಯಯನದ ಪ್ರವೃತ್ತಿಗಳು

1

ಚಿತ್ರ 1 ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್‌ನ ಪ್ರಕಟಿತ ಸಂಶೋಧನಾ ಪ್ರಬಂಧಗಳ ಪ್ರವೃತ್ತಿಗಳು.
ಗಮನಿಸಿ: ನೇಚರ್, ಸೆಲ್ ಮತ್ತು ಸೈನ್ಸ್ ಸರಣಿ ನಿಯತಕಾಲಿಕಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟವಾದ ಲೇಖನಗಳ ಶೀರ್ಷಿಕೆಗಳನ್ನು ಹುಡುಕಲು "ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್" ಅನ್ನು ಪ್ರಮುಖ ಪದವಾಗಿ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಫಲಿತಾಂಶವನ್ನು ಅಂಕಿ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ

ಎ.ಬಹು ಮಾದರಿಗಳಿಂದ ರೀಡ್‌ಗಳನ್ನು ಉಲ್ಲೇಖಕ್ಕೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೋಡಿಸದಿರುವವುಗಳನ್ನು ಕಾದಂಬರಿ ಕಾಂಟಿಗ್‌ಗಳಾಗಿ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಈ ಕಾದಂಬರಿ ಕಾಂಟಿಗ್‌ಗಳನ್ನು ಮೂಲ ಉಲ್ಲೇಖ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಸೇರಿಸುವ ಮೂಲಕ, ಪ್ಯಾಂಗನೋಮ್ ಉಲ್ಲೇಖವನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಬಹುದು.ಎಲ್ಲಾ ರೀಡ್‌ಗಳನ್ನು ಪ್ಯಾಂಗನೋಮ್‌ಗೆ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ವಿತರಿಸಬಹುದಾದ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.

ಬಿ.ಬಹು ಪ್ರವೇಶಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ಡಿ ನೊವೊ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯು ವಿತರಿಸಬಹುದಾದ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ.

ಸಿ.ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ಗ್ರಾಫ್ ಅನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಗಳಿಂದ ಅಥವಾ ಡಿ ನೊವೊ ಗ್ರಾಫ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯಿಂದ ನಿರ್ಮಿಸಬಹುದು, ಇದು ಗ್ರಾಫ್ ಮೂಲಕ ಅನನ್ಯ ಮಾರ್ಗಗಳಾಗಿ ವಿತರಿಸಬಹುದಾದ ಪ್ರದೇಶಗಳ ವಿಭಿನ್ನ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸುತ್ತದೆ.

ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ನಿರ್ಮಿಸುವುದು?

2

ಚಿತ್ರ 2 ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ವಿಧಾನಗಳ ಹೋಲಿಕೆ1

ಎ.ಬಹು ಮಾದರಿಗಳಿಂದ ರೀಡ್‌ಗಳನ್ನು ಉಲ್ಲೇಖಕ್ಕೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಜೋಡಿಸದಿರುವವುಗಳನ್ನು ಕಾದಂಬರಿ ಕಾಂಟಿಗ್‌ಗಳಾಗಿ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.ಈ ಕಾದಂಬರಿ ಕಾಂಟಿಗ್‌ಗಳನ್ನು ಮೂಲ ಉಲ್ಲೇಖ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಸೇರಿಸುವ ಮೂಲಕ, ಪ್ಯಾಂಗನೋಮ್ ಉಲ್ಲೇಖವನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಬಹುದು.ಎಲ್ಲಾ ರೀಡ್‌ಗಳನ್ನು ಪ್ಯಾಂಗನೋಮ್‌ಗೆ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮಾಡುವ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ವಿತರಿಸಬಹುದಾದ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.

ಬಿ.ಬಹು ಪ್ರವೇಶಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳ ಡಿ ನೊವೊ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯು ವಿತರಿಸಬಹುದಾದ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ.

ಸಿ.ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ಗ್ರಾಫ್ ಅನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಜೋಡಣೆಗಳಿಂದ ಅಥವಾ ಡಿ ನೊವೊ ಗ್ರಾಫ್ ಅಸೆಂಬ್ಲಿಯಿಂದ ನಿರ್ಮಿಸಬಹುದು, ಇದು ಗ್ರಾಫ್ ಮೂಲಕ ಅನನ್ಯ ಮಾರ್ಗಗಳಾಗಿ ವಿತರಿಸಬಹುದಾದ ಪ್ರದೇಶಗಳ ವಿಭಿನ್ನ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸುತ್ತದೆ.

ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಪ್ರಕಟವಾದ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು

● ರೇಪ್ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು2

3

● ಟೊಮೆಟೊ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು 3

4

● ರೈಸ್ ಪ್ಯಾನ್ -ಜೀನೋಮ್4

5

● ಸೂರ್ಯಕಾಂತಿ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್5

6

● ಸೋಯಾಬೀನ್ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ 6

7

● ರೈಸ್ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್7

8

● ಬಾರ್ಲಿ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್8

9

● ಗೋಧಿ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್9

10

● ಸೋರ್ಗಮ್ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್10

11

● ಫೈಟೊಪ್ಲಾಂಕ್ಟನ್ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್11

12

ಉಲ್ಲೇಖ

1. ಬೇಯರ್ ಪಿಇ, ಗೋಲಿಕ್ಜ್ ಎಎ, ಶೆಬೆನ್ ಎ, ಬ್ಯಾಟ್ಲಿ ಜೆ, ಎಡ್ವರ್ಡ್ಸ್ ಡಿ. ಪ್ಲಾಂಟ್ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು ಹೊಸ ಉಲ್ಲೇಖವಾಗಿದೆ.ನ್ಯಾಟ್ ಸಸ್ಯಗಳು.2020;6(8):914-920.doi:10.1038/s41477-020-0733-0

2. ಸಾಂಗ್ ಜೆಎಮ್, ಗುವಾನ್ ಝಡ್, ಹು ಜೆ, ಮತ್ತು ಇತರರು.ಎಂಟು ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ಆರ್ಕಿಟೆಕ್ಚರ್ ಮತ್ತು ಬ್ರಾಸಿಕಾ ನೇಪಸ್‌ನ ಇಕೋಟೈಪ್ ವಿಭಿನ್ನತೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತವೆ.ನ್ಯಾಟ್ ಸಸ್ಯಗಳು.2020;6(1):34-45.doi:10.1038/s41477-019-0577-7

3. ಗಾವೊ ಎಲ್, ಗೊಂಡಾ I, ಸನ್ ಎಚ್, ಮತ್ತು ಇತರರು.ಟೊಮೆಟೊ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ಹೊಸ ಜೀನ್‌ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಹಣ್ಣಿನ ಪರಿಮಳವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಅಪರೂಪದ ಆಲೀಲ್ ಅನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ.ನ್ಯಾಟ್ ಜೆನೆಟ್.2019;51(6):1044-1051.doi:10.1038/s41588-019-0410-2

4. ಝಾವೋ ಕ್ಯೂ, ಫೆಂಗ್ ಕ್ಯೂ, ಲು ಎಚ್, ಮತ್ತು ಇತರರು.ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಕೃಷಿ ಮತ್ತು ಕಾಡು ಅಕ್ಕಿಯಲ್ಲಿನ ಜೀನೋಮಿಕ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯನ್ನು ಎತ್ತಿ ತೋರಿಸುತ್ತದೆ [ಪ್ರಕಟಿತ ತಿದ್ದುಪಡಿ ನ್ಯಾಟ್ ಜೆನೆಟ್‌ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ.2018 ಆಗಸ್ಟ್;50(8):1196].ನ್ಯಾಟ್ ಜೆನೆಟ್.2018;50(2):278-284.doi:10.1038/s41588-018-0041-z

5. ಹಬ್ನರ್ ಎಸ್, ಬರ್ಕೊವಿಚ್ ಎನ್, ಟೊಡೆಸ್ಕೊ ಎಂ, ಮತ್ತು ಇತರರು.ಸೂರ್ಯಕಾಂತಿ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಹೈಬ್ರಿಡೈಸೇಶನ್ ಜೀನ್ ವಿಷಯ ಮತ್ತು ರೋಗ ನಿರೋಧಕತೆಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ.ನ್ಯಾಟ್ ಸಸ್ಯಗಳು.2019;5(1):54-62.doi:10.1038/s41477-018-0329-0

6. ಲಿಯು ವೈ, ಡು ಎಚ್, ಲಿ ಪಿ, ಮತ್ತು ಇತರರು.ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ಆಫ್ ವೈಲ್ಡ್ ಮತ್ತು ಕಲ್ಟಿವೇಟೆಡ್ ಸೋಯಾಬೀನ್.ಕೋಶ.2020;182(1):162-176.e13.doi:10.1016/j.cell.2020.05.023

7. ಕ್ವಿನ್ ಪಿ, ಲು ಎಚ್, ಡು ಎಚ್, ಮತ್ತು ಇತರರು.33 ತಳೀಯವಾಗಿ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಅಕ್ಕಿ ಸೇರ್ಪಡೆಗಳ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಗುಪ್ತ ಜೀನೋಮಿಕ್ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ [ಮುದ್ರಣಕ್ಕಿಂತ ಮುಂಚಿತವಾಗಿ ಆನ್‌ಲೈನ್‌ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ, 2021 ಮೇ 25].ಕೋಶ.2021;S0092-8674(21)00581-X.doi:10.1016/j.cell.2021.04.046

8. ಜಯಕೋಡಿ ಎಂ, ಪದ್ಮರಸು ಎಸ್, ಹಬೆರರ್ ಜಿ, ಮತ್ತು ಇತರರು.ಬಾರ್ಲಿ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್ ರೂಪಾಂತರದ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿಯ ಗುಪ್ತ ಪರಂಪರೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ.ಪ್ರಕೃತಿ.2020;588(7837):284-289.doi:10.1038/s41586-020-2947-8

9. ವಾಲ್ಕೊವಿಯಾಕ್ ಎಸ್, ಗಾವೊ ಎಲ್, ಮೊನಾಟ್ ಸಿ, ಮತ್ತು ಇತರರು.ಬಹು ಗೋಧಿ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳು ಆಧುನಿಕ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಜಾಗತಿಕ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತವೆ.ಪ್ರಕೃತಿ.2020;588(7837):277-283.doi:10.1038/s41586-020-2961-x

10. ಟಾವೊ ವೈ, ಲುವೊ ಎಚ್, ಕ್ಸು ಜೆ, ಮತ್ತು ಇತರರು.ಕೃಷಿ ಮತ್ತು ಕಾಡು ಸೋರ್ಗಮ್‌ನ ಪ್ಯಾನ್-ಜೀನೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಬದಲಾವಣೆ [ಮುದ್ರಣಕ್ಕಿಂತ ಮುಂಚಿತವಾಗಿ ಆನ್‌ಲೈನ್‌ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ, 2021 ಮೇ 20].ನ್ಯಾಟ್ ಸಸ್ಯಗಳು.2021;10.1038 / s41477-021-00925-x.doi:10.1038/s41477-021-00925-x

11. ಫ್ಯಾನ್ ಎಕ್ಸ್, ಕಿಯು ಎಚ್, ಹ್ಯಾನ್ ಡಬ್ಲ್ಯೂ, ಮತ್ತು ಇತರರು.ಫೈಟೊಪ್ಲಾಂಕ್ಟನ್ ಪ್ಯಾಂಗನೋಮ್ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಕಾರ್ಯಗಳ ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಸಮತಲ ಜೀನ್ ವರ್ಗಾವಣೆಯನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ.ವಿಜ್ಞಾನ ಅಡ್ವ.2020;6(18):eaba0111.2020 ಏಪ್ರಿಲ್ 29 ರಂದು ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ. doi:10.1126/sciadv.aba0111


ಪೋಸ್ಟ್ ಸಮಯ: ಜನವರಿ-04-2022

ನಿಮ್ಮ ಸಂದೇಶವನ್ನು ನಮಗೆ ಕಳುಹಿಸಿ: