ଲମ୍ବା ଅଣ-କୋଡିଂ କ୍ରମ-ଇଲୁମିନା |
ସେବା ସୁବିଧା
Øସେବା ସୁବିଧା
Øସେଲୁଲାର୍ ଏବଂ ଟିସୁ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ |
Øନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ପର୍ଯ୍ୟାୟ ଗତିଶୀଳ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ପରିବର୍ତ୍ତନକୁ ପ୍ରକାଶ କରେ ଏବଂ ଉପସ୍ଥାପନ କରେ |
Øସମୟ ଏବଂ ସ୍ଥାନ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତିର ସଠିକ୍ ନମୁନା |
ØMRNA ତଥ୍ୟ ସହିତ ମିଳିତ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
ØBMKCloud- ଆଧାରିତ ଫଳାଫଳ ବିତରଣ: ପ୍ଲାଟଫର୍ମରେ କଷ୍ଟୋମାଇଜଡ୍ ଡାଟା-ଖଣି ଉପଲବ୍ଧ |
Øପ୍ରୋଜେକ୍ଟ ସମାପ୍ତ ହେବା ପରେ 3 ମାସ ପାଇଁ ବିକ୍ରୟ ପରେ ସେବା ବ valid ଧ |
ନମୁନା ଆବଶ୍ୟକତା ଏବଂ ବିତରଣ |
ନମୁନା ଆବଶ୍ୟକତା:
ନ୍ୟୁକ୍ଲିଓଟାଇଡ୍:
ଟିସୁ: ଓଜନ (ଶୁଖିଲା): ≥1 ଗ୍ରାମ |
* 5 ମିଗ୍ରା ରୁ କମ୍ ଟିସୁ ପାଇଁ, ଆମେ ଫ୍ଲାସ୍ ଫ୍ରିଜ୍ (ତରଳ ନାଇଟ୍ରୋଜେନରେ) ଟିସୁ ନମୁନା ପଠାଇବାକୁ ସୁପାରିଶ କରୁ |
ସେଲ୍ ନିଲମ୍ବନ: ସେଲ୍ ଗଣନା = 3 × 10 |7
* ଆମେ ଫ୍ରିଜ୍ ହୋଇଥିବା ସେଲ୍ ଲାଇସେଟ୍ ପଠାଇବାକୁ ସୁପାରିଶ କରୁ |ଯଦି ସେହି ସେଲ୍ 5 × 10 ରୁ ଛୋଟ ଗଣନା କରେ |5, ତରଳ ନାଇଟ୍ରୋଜେନରେ ଫ୍ଲାସ୍ ଫ୍ରିଜ୍ ସୁପାରିଶ କରାଯାଏ |
ରକ୍ତ ନମୁନା:
PA × geneBloodRNATube;
6mLTRIzol ଏବଂ 2mL ରକ୍ତ (TRIzol: ରକ୍ତ = 3: 1)
ସୁପାରିଶ କରାଯାଇଥିବା ନମୁନା ବିତରଣ |
ପାତ୍ର: 2 ମିଲି ସେଣ୍ଟ୍ରିଫୁଗ୍ ଟ୍ୟୁବ୍ (ଟିଫିନ୍ ଫଏଲ୍ ସୁପାରିଶ କରାଯାଏ ନାହିଁ)
ନମୁନା ଲେବେଲିଂ: ଗୋଷ୍ଠୀ + ନକଲ ଯଥା A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
ପଠାଇବା:
1. ଶୁଖିଲା ବରଫ: ନମୁନାଗୁଡ଼ିକୁ ବ୍ୟାଗରେ ପ୍ୟାକ୍ କରି ଶୁଖିଲା ବରଫରେ ପୋତି ଦିଆଯିବା ଆବଶ୍ୟକ |
3. ଆରଏନ୍ଏଷ୍ଟେବଲ୍ ଟ୍ୟୁବ୍: RNA ନମୁନାଗୁଡିକ RNA ସ୍ଥିରତା ଟ୍ୟୁବରେ ଶୁଖାଯାଇପାରିବ (ଯଥା RNAstable®) ଏବଂ କୋଠରୀ ତାପମାତ୍ରାରେ ପଠାଯାଇପାରିବ |
ସେବା କାର୍ଯ୍ୟ ପ୍ରବାହ |
ପରୀକ୍ଷଣ ଡିଜାଇନ୍ |
ନମୁନା ବିତରଣ |
RNA ନିଷ୍କାସନ |
ଲାଇବ୍ରେରୀ ନିର୍ମାଣ
କ୍ରମ
ତଥ୍ୟ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
ବିକ୍ରୟ ପରେ ସେବା |
ବାୟୋନ୍ଫର୍ମାଟିକ୍ସ |
 |
 |
1.LncRNA ବର୍ଗୀକରଣ |
ଉପରୋକ୍ତ ଚାରୋଟି ସଫ୍ଟୱେର୍ ଦ୍ୱାରା ପୂର୍ବାନୁମାନ କରାଯାଇଥିବା LncRNA କୁ 4 ଶ୍ରେଣୀରେ ବିଭକ୍ତ କରାଯାଇଥିଲା: lincRNA, anti-sense-LncRNA, ଇଣ୍ଟ୍ରୋନିକ୍- LncRNA;ଅର୍ଥ- LncRNA |ନିମ୍ନରେ ଥିବା ହିଷ୍ଟୋଗ୍ରାମ୍ ରେ LncRNA ବର୍ଗୀକରଣ ଦେଖାଗଲା |
LncRNA ବର୍ଗୀକରଣ |
2. DE-lncRNA ସମୃଦ୍ଧ ବିଶ୍ଳେଷଣର ସିସ୍-ଟାର୍ଗେଟ୍ ଜିନ୍ |
ଜ bi ବିକ ପ୍ରକ୍ରିୟା, ମଲିକୁଲାର କାର୍ଯ୍ୟ ଏବଂ ସେଲୁଲାର୍ ଉପାଦାନଗୁଡ଼ିକରେ ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ଭାବରେ ପ୍ରକାଶିତ lncRNA (DE-lncRNA) ର ସିସ୍-ଟାର୍ଗେଟେଡ୍ ଜିନ୍ ଉପରେ GO ସମୃଦ୍ଧ ବିଶ୍ଳେଷଣରେ କ୍ଲଷ୍ଟର ପ୍ରୋଫାଇଲର୍ ନିୟୋଜିତ ହୋଇଥିଲା |GO ସମୃଦ୍ଧ ବିଶ୍ଳେଷଣ ହେଉଛି ସମଗ୍ର ଜିନୋମ ତୁଳନାରେ DEG- ନିର୍ଦ୍ଦେଶିତ ଯଥେଷ୍ଟ ସମୃଦ୍ଧ GO ଶବ୍ଦଗୁଡ଼ିକୁ ଚିହ୍ନିବା ପାଇଁ ଏକ ପ୍ରକ୍ରିୟା |ନିମ୍ନରେ ଦେଖାଯାଇଥିବା ପରି ହିଷ୍ଟୋଗ୍ରାମ୍, ବବୁଲ୍ ଚାର୍ଟ ଇତ୍ୟାଦିରେ ସମୃଦ୍ଧ ଶବ୍ଦଗୁଡ଼ିକ ଉପସ୍ଥାପିତ ହେଲା |
DE-lncRNA ସମୃଦ୍ଧ ବିଶ୍ଳେଷଣ-ବବଲ୍ ଚାର୍ଟର ସିସ୍-ଟାର୍ଗେଟେଡ୍ ଜିନ୍ |
BMK କେସ୍ |
KRAS - G12D ମ୍ୟୁଟେସନ୍ ଏବଂ P53 ନକ୍ଆଉଟ୍ ସହିତ ମାଉସ୍ ଫୁସଫୁସ ଆଡେନୋକାର୍କିନୋମାସରେ ଡିରେଗୁଲେଟେଡ୍ lncRNA ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ |
ପ୍ରକାଶିତ:ସେଲୁଲାର୍ ଏବଂ ମଲିକୁଲାର୍ ମେଡିସିନ୍ ଜର୍ନାଲ୍2019
ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ ରଣନୀତି |
ଇଲୁମିନା |
ନମୁନା ସଂଗ୍ରହ
ଏକ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ଭାଇରାଲ୍ ସଂକ୍ରମଣର 6 ଦିନରେ NONMMUT015812-knockdown KP (shRNA-2) କୋଷ ଏବଂ ନକାରାତ୍ମକ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ (sh-Scr) କୋଷଗୁଡ଼ିକ ମିଳିଲା |
ମୁଖ୍ୟ ଫଳାଫଳଗୁଡିକ
ଏହି ଅଧ୍ୟୟନଟି P53 ନକ୍ଆଉଟ୍ ଏବଂ KrasG12D ମ୍ୟୁଟେସନ୍ ସହିତ ମାଉସ୍ ଫୁସଫୁସ ଆଡେନୋକାର୍କିନୋମା ରେ ଅତିଶୟ ଭାବରେ ପ୍ରକାଶିତ lncRNA ଗୁଡ଼ିକୁ ଅନୁସନ୍ଧାନ କରେ |
1.6424 lncRNA ଗୁଡ଼ିକୁ ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ଭାବରେ ପ୍ରକାଶ କରାଯାଇଥିଲା (fold 2 ଗୁଣ ପରିବର୍ତ୍ତନ, P <0.05) |
2. ସମସ୍ତ 210 lncRNAs (FC≥8) ମଧ୍ୟରେ, 11 lncRNA ର ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ଯଥାକ୍ରମେ ପ୍ରାଥମିକ KP କୋଷଗୁଡ଼ିକରେ ହାଇପୋକ୍ସିଆ ଦ୍ P ାରା P53, 33 lncRNAs ଏବଂ 13 lncRNAs ଦ୍ୱାରା ନିୟନ୍ତ୍ରିତ ହୋଇଥିଲା |
3.NONMMUT015812, ଯାହା ମାଉସ୍ ଫୁସଫୁସ୍ ଆଡେନୋକାର୍କିନୋମା ରେ ଉଲ୍ଲେଖନୀୟ ଭାବରେ ନିୟନ୍ତ୍ରିତ ହୋଇଥିଲା ଏବଂ P53 ପୁନ - ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ଦ୍ୱାରା ନକାରାତ୍ମକ ଭାବରେ ନିୟନ୍ତ୍ରିତ ହୋଇଥିଲା, ଏହାର ସେଲୁଲାର୍ କାର୍ଯ୍ୟକୁ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରିବା ପାଇଁ ଚିହ୍ନଟ କରାଯାଇଥିଲା |
4. shRNAs ଦ୍ୱାରା NONMMUT015812 ର ନକଡାଉନ୍ KP କୋଷଗୁଡ଼ିକର ବିସ୍ତାର ଏବଂ ସ୍ଥାନାନ୍ତରଣ କ୍ଷମତା ହ୍ରାସ କଲା |NONMMUT015812 ଏକ ସମ୍ଭାବ୍ୟ ଅନକୋଜେନ ଥିଲା |
 NONMMUT015812- ନକଡାଉନ୍ KP କୋଷଗୁଡ଼ିକରେ ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ଭାବରେ ପ୍ରକାଶିତ ଜିନ୍ ଗୁଡିକର KEGG ପଥ ବିଶ୍ଳେଷଣ | |  NONMMUT015812-knockdown KP କୋଷଗୁଡ଼ିକରେ ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ଭାବରେ ପ୍ରକାଶିତ ଜିନ୍ଗୁଡ଼ିକର ଜିନ୍ ଅନ୍ଟୋଲୋଜି ବିଶ୍ଳେଷଣ | |
ସନ୍ଦର୍ଭ
KRAS - G12D ମ୍ୟୁଟେସନ୍ ଏବଂ P53 ନକ୍ଆଉଟ୍ ସହିତ ମାଉସ୍ ଫୁସଫୁସ ଆଡେନୋକାର୍କିନୋମାସରେ ଡିରେଗୁଲେଟେଡ୍ lncRNA ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ |ଜର୍ଣ୍ଣାଲ୍ ଅଫ୍ ସେଲୁଲାର୍ ଏବଂ ମଲିକୁଲାର ମେଡିସିନ୍, 2019, 23 (10) |DOI ： 10.1111 / jcmm.14584 |
