-
Sekvenciranje enojedrne RNA
Napredek pri zajemanju posamezne celice in tehniki gradnje posamezne knjižnice v kombinaciji z visoko zmogljivim sekvenciranjem omogoča študije izražanja genov na podlagi celice za celico.Omogoča globljo in popolno sistemsko analizo na kompleksnih celičnih populacijah, pri čemer se v veliki meri izogne maskiranju njihove heterogenosti z jemanjem povprečja vseh celic.
Nekatere celice pa niso primerne za pripravo enocelične suspenzije, zato so potrebne druge metode priprave vzorcev – ekstrakcija jedra iz tkiv, to pomeni, da se jedro ekstrahira neposredno iz tkiva ali celice in se pripravi v enojedrno suspenzijo za enojedrno suspenzijo. sekvenciranje celic.
BMK zagotavlja 10× storitev zaporedja enocelične RNA na podlagi Genomics ChromiumTM.Ta storitev se pogosto uporablja v študijah o študijah, povezanih z boleznijo, kot je diferenciacija imunskih celic, heterogenost tumorja, razvoj tkiva itd.
Čip prostorskega transkriptoma: 10 × Genomics
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
BMKMANU S1000 prostorski transkriptom
Prostorska transkriptomika je v ospredju znanstvenih inovacij in omogoča raziskovalcem, da se poglobijo v zapletene vzorce izražanja genov v tkivih, hkrati pa ohranjajo njihov prostorski kontekst.Med različnimi platformami je BMKGene razvil prostorski transkriptomski čip BMKManu S1000, ki se ponaša zizboljšana ločljivost5 µM, doseganje podceličnega območja in omogočanjevečnivojske nastavitve ločljivosti.Čip S1000, ki ima približno 2 milijona točk, uporablja mikrovdolbinice, prekrite s kroglicami, naloženimi s prostorsko črtno kodiranimi sondami za zajemanje.Knjižnica cDNA, obogatena s prostorskimi črtnimi kodami, je pripravljena iz čipa S1000 in nato sekvencirana na platformi Illumina NovaSeq.Kombinacija prostorsko kodiranih vzorcev in UMI zagotavlja točnost in specifičnost generiranih podatkov.Edinstvena lastnost čipa BMKManu S1000 je v njegovi vsestranskosti, ki ponuja nastavitve ločljivosti na več ravneh, ki jih je mogoče natančno prilagoditi različnim tkivom in stopnjam podrobnosti.Ta prilagodljivost postavlja čip kot izjemno izbiro za raznolike študije prostorske transkriptomike, kar zagotavlja natančno prostorsko združevanje v gruče z minimalnim šumom.
Z uporabo čipa BMKManu S1000 in drugih tehnologij prostorske transkriptomike lahko raziskovalci bolje razumejo prostorsko organizacijo celic in kompleksne molekularne interakcije, ki se pojavljajo v tkivih, kar zagotavlja neprecenljiv vpogled v mehanizme, na katerih temeljijo biološki procesi na številnih področjih, vključno z onkologija, nevroznanost, razvojna biologija, imunologija in botanične študije.
Platforma: BMKManu S1000 čip in Illumina NovaSeq
-
10x prostorski transkriptom Genomics Visium
Prostorska transkriptomika je vrhunska tehnologija, ki raziskovalcem omogoča raziskovanje vzorcev izražanja genov v tkivih, hkrati pa ohranja njihov prostorski kontekst.Ena zmogljiva platforma na tem področju je 10x Genomics Visium skupaj s sekvenciranjem Illumina.Načelo 10X Visium temelji na specializiranem čipu z določenim območjem za zajemanje, kjer so nameščeni deli tkiva.To območje zajemanja vsebuje točke s črtno kodo, od katerih vsaka ustreza edinstveni prostorski lokaciji v tkivu.Zajete molekule RNA iz tkiva so nato med procesom reverzne transkripcije označene z edinstvenimi molekulskimi identifikatorji (UMI).Te točke s črtno kodo in UMI omogočajo natančno prostorsko kartiranje in kvantifikacijo izražanja genov pri ločljivosti ene celice.Kombinacija prostorsko kodiranih vzorcev in UMI zagotavlja točnost in specifičnost generiranih podatkov.Z uporabo te tehnologije Spatial Transcriptomics lahko raziskovalci pridobijo globlje razumevanje prostorske organizacije celic in zapletenih molekularnih interakcij, ki se pojavljajo v tkivih, kar ponuja neprecenljiv vpogled v mehanizme, na katerih temeljijo biološki procesi na več področjih, vključno z onkologijo, nevroznanostjo, razvojno biologijo, imunologijo , in botanične študije.
Platforma: 10X Genomics Visium in Illumina NovaSeq
