توالی mRNA یوکاریوتی - ایلومینا
مزایای
Øبا تجربه بالا: بیش از 200000 نمونه در BMK پردازش شده است که انواع مختلف نمونه از جمله کشت سلولی، بافت، مایع بدن و غیره را پوشش می‌دهد و بیش از 7000 پروژه mRNA-Seq بسته شده است که حوزه‌های تحقیقاتی مختلف را پوشش می‌دهند.
Øسیستم کنترل کیفیت دقیق: نقاط اصلی کنترل کیفیت در تمام مراحل از جمله آماده سازی نمونه، آماده سازی کتابخانه، توالی یابی و بیوانفورماتیک تحت نظارت دقیق قرار دارند تا نتایج با کیفیت بالا ارائه شود.
Øپایگاه‌های اطلاعاتی متعددی برای حاشیه‌نویسی عملکرد و مطالعات غنی‌سازی برای تحقق اهداف تحقیقاتی متنوع موجود است.
Øخدمات پس از فروش: خدمات پس از فروش با اعتبار 3 ماه پس از اتمام پروژه، شامل پیگیری پروژه، عیب یابی، پرسش و پاسخ نتایج و غیره.
نمونه مورد نیاز و تحویل
| کتابخانه | استراتژی توالی | داده ها توصیه می شود | کنترل کیفیت |
| پلی A غنی شده است | ایلومینا PE150 | 6 گیگ | Q30≥85% |
نمونه مورد نیاز:
نوکلئوتیدها:
| خلوص | تمامیت | میزان |
| OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5آلودگی پروتئین یا DNA محدود یا بدون آلودگی روی ژل نشان داده شده است. | برای گیاهان: RIN≥6.5؛ برای حیوانات: RIN≥7؛ 28S/18S≥1.0؛ ارتفاع خط پایه محدود یا بدون ارتفاع | Conc.≥30 نانوگرم در میکرولیتر؛حجم ≥ 10 میکرولیتر.مجموع ≥ 1.5 میکروگرم |
بافت: وزن (خشک):≥1 گرم
*برای بافت کوچکتر از 5 میلی گرم، توصیه می کنیم نمونه بافت منجمد فلاش (در نیتروژن مایع) ارسال شود.
تعلیق سلولی:تعداد سلول = 3×106- 1×107
*توصیه می کنیم لیز سلولی منجمد را ارسال کنید.در صورتی که تعداد سلول های کوچکتر از 105×5 باشد، فلاش منجمد در نیتروژن مایع توصیه می شود که برای استخراج میکرو ارجح است.
نمونه های خون:حجم ≥1 میلی لیتر
میکروارگانیسم:جرم ≥ 1 گرم
تحویل نمونه توصیه شده
ظرف: لوله سانتریفیوژ 2 میلی لیتری (فیل قلع توصیه نمی شود)
برچسب زدن نمونه: گروه + تکرار به عنوان مثال A1، A2، A3.B1، B2، B3...
حمل و نقل:
- یخ خشک: نمونه ها باید در کیسه های بسته بندی شده و در یخ خشک دفن شوند.
- لوله های پایدار RNA: نمونه های RNA را می توان در لوله تثبیت کننده RNA (به عنوان مثال RNAstable®) خشک کرد و در دمای اتاق حمل کرد.
جریان کار خدمات
طراحی آزمایش
تحویل نمونه
استخراج RNA
ساخت کتابخانه
ترتیب دهی
تحلیل داده ها
خدمات پس از فروش
بیوانفورماتیک
یوکاریوتی گردش کار تجزیه و تحلیل توالی mRNA
بیوانفورماتیک
Øکنترل کیفیت داده های خام
Øهمترازی ژنوم مرجع
Øتحلیل ساختار رونوشت
Øکمی سازی بیان
Øتجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل
Øحاشیه نویسی و غنی سازی عملکرد
1.منحنی اشباع داده mRNA
2.تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل - نمودار آتشفشان
3.حاشیه نویسی KEGG در DEG
4.طبقه بندی GO در DEG ها
