RNA کوچک

RNAهای کوچک، RNAهای کوتاه غیرکدکننده با طول متوسط ​​۱۸ تا ۳۰ نوکلئوتید هستند که شامل miRNA، siRNA و piRNA می‌شوند و نقش‌های مهمی در فرآیندهای تنظیمی ایفا می‌کنند. خط لوله sRNA BMKCloud، هم تجزیه و تحلیل استاندارد و هم تجزیه و تحلیل سفارشی را برای شناسایی miRNA ارائه می‌دهد. پس از برش و کنترل کیفیت خوانش‌ها، خوانش‌ها در پایگاه‌های داده متعدد تراز می‌شوند تا sRNAها طبقه‌بندی شوند و miRNAها انتخاب شده و به ژنوم مرجع نگاشت شوند. miRNAها بر اساس پایگاه‌های داده miRNA شناخته شده شناسایی می‌شوند و اطلاعاتی در مورد ساختار ثانویه، خانواده miRNA و ژن‌های هدف ارائه می‌دهند. تجزیه و تحلیل بیان افتراقی، miRNAهای با بیان افتراقی را شناسایی می‌کند و ژن‌های هدف مربوطه به صورت عملکردی حاشیه‌نویسی می‌شوند تا دسته‌های غنی‌شده پیدا شوند.