متاژنومیکس (NGS)

متاژنومیکس شاتگان با Illumina ابزاری محبوب برای مطالعه میکروبیوم‌ها با تعیین توالی مستقیم DNA از نمونه‌های پیچیده است که امکان مطالعه تنوع طبقه‌بندی و عملکردی را فراهم می‌کند. خط لوله متاژنومیک BMKCloud (NGS) با کنترل کیفیت و مونتاژ متاژنوم آغاز می‌شود که از آن ژن‌ها پیش‌بینی شده و در مجموعه داده‌های غیر تکراری که برای عملکرد و طبقه‌بندی با استفاده از چندین پایگاه داده حاشیه‌نویسی شده‌اند، خوشه‌بندی می‌شوند. این اطلاعات برای تجزیه و تحلیل تنوع طبقه‌بندی درون نمونه‌ای (تنوع آلفا) و تنوع بین نمونه‌ای (تنوع بتا) استفاده می‌شود. تجزیه و تحلیل افتراقی بین گروه‌ها، واحدهای عملکردی و عملکردهای بیولوژیکی را که بین دو گروه متفاوت هستند، با استفاده از آزمون‌های پارامتری و ناپارامتری پیدا می‌کند، در حالی که تجزیه و تحلیل همبستگی این تفاوت‌ها را به عوامل محیطی مرتبط می‌کند.