条形banner-03

محصولات

توالی mRNA تمام طول - نانوحفره

در حالی که توالی یابی mRNA مبتنی بر NGS یک ابزار همه کاره برای تعیین کمیت بیان ژن است، اتکای آن به خواندن کوتاه، کارایی آن را در آنالیزهای پیچیده ترانسکریپتومی محدود می کند. از سوی دیگر، توالی‌یابی نانوحفره از فناوری خواندن طولانی استفاده می‌کند و توالی‌یابی رونوشت‌های mRNA تمام‌قد را امکان‌پذیر می‌سازد. این رویکرد یک کاوش جامع از پیوند جایگزین، همجوشی ژن، پلی آدنیلاسیون، و کمی سازی ایزوفرم های mRNA را تسهیل می کند.

توالی‌یابی نانوحفره، روشی که بر سیگنال‌های الکتریکی تک مولکولی نانوحفره تکیه دارد، نتایج را در زمان واقعی ارائه می‌کند. DNA دو رشته‌ای با هدایت پروتئین‌های موتور به پروتئین‌های نانوحفره‌ای که در یک بیوفیلم تعبیه شده‌اند متصل می‌شود و در حین عبور از کانال نانوحفره تحت اختلاف ولتاژ باز می‌شود. سیگنال های الکتریکی متمایز تولید شده توسط پایگاه های مختلف در رشته DNA در زمان واقعی شناسایی و طبقه بندی می شوند و توالی نوکلئوتیدی دقیق و پیوسته را تسهیل می کنند. این رویکرد نوآورانه بر محدودیت‌های خواندن کوتاه غلبه می‌کند و بستری پویا برای تجزیه و تحلیل ژنومی پیچیده، از جمله مطالعات پیچیده رونویسی، با نتایج فوری فراهم می‌کند.

پلتفرم: نانوپور PromethION 48


جزئیات خدمات

بیوانفورماتیک

نتایج نسخه ی نمایشی

انتشارات برگزیده

ویژگی ها

● گرفتن mRNA poly-A به دنبال سنتز cDNA و آماده سازی کتابخانه

● توالی رونوشت های تمام قد

● تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک بر اساس تراز با ژنوم مرجع

تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک نه تنها شامل بیان در سطح ژن و ایزوفرم بلکه تجزیه و تحلیل lncRNA، همجوشی ژن، پلی آدنیلاسیون و ساختار ژن می شود.

مزایای خدمات

کمی سازی بیان در سطح ایزوفرم: امکان تجزیه و تحلیل بیان دقیق و دقیق، آشکار کردن تغییری که ممکن است هنگام تجزیه و تحلیل بیان کل ژن پنهان شود.

کاهش تقاضای داده:در مقایسه با توالی‌یابی نسل بعدی (NGS)، توالی‌یابی نانوحفره نیازهای داده کمتری را نشان می‌دهد، که اجازه می‌دهد سطوح معادل اشباع کمی بیان ژن با داده‌های کوچک‌تر را فراهم کند.

دقت بالاتر کمی سازی بیان: هم در سطح ژن و هم در سطح ایزوفرم

شناسایی اطلاعات ترانسکریپتومی اضافی: پلی آدنیلاسیون جایگزین، ژن های همجوشی و lcnRNA و ژن های هدف آنها

تخصص گسترده: تیم ما با تکمیل بیش از 850 پروژه رونویسی تمام قد Nanopore و پردازش بیش از 8000 نمونه، تجربه زیادی را برای هر پروژه به ارمغان می آورد.

پشتیبانی پس از فروش: تعهد ما فراتر از اتمام پروژه با یک دوره خدمات پس از فروش 3 ماهه است. در طول این مدت، ما پیگیری پروژه، کمک عیب‌یابی، و جلسات پرسش و پاسخ را برای پاسخگویی به هرگونه سؤال مرتبط با نتایج ارائه می‌دهیم.

نمونه مورد نیاز و تحویل

کتابخانه

استراتژی توالی

داده ها توصیه می شود

کنترل کیفیت

پلی A غنی شده است

ایلومینا PE150

6/12 گیگابایت

میانگین امتیاز کیفیت: Q10

نمونه مورد نیاز:

نوکلئوتیدها:

Conc.(ng/μl)

مقدار (μg)

خلوص

صداقت

≥ 100

≥ 1.0

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

آلودگی پروتئین یا DNA محدود یا بدون آلودگی روی ژل نشان داده شده است.

برای گیاهان: RIN≥7.0;

برای حیوانات: RIN≥7.5;

5.0≥28S/18S≥1.0;

ارتفاع پایه محدود یا بدون ارتفاع

● گیاهان:

ریشه، ساقه یا گلبرگ: 450 میلی گرم

برگ یا دانه: 300 میلی گرم

میوه: 1.2 گرم

● حیوان:

قلب یا روده: 300 میلی گرم

احشاء یا مغز: 240 میلی گرم

عضله: 450 میلی گرم

استخوان، مو یا پوست: 1 گرم

● بندپایان:

حشرات: 6 گرم

سخت پوستان: 300 میلی گرم

● خون کامل: 1 لوله

● سلول ها: 106 سلول ها

تحویل نمونه توصیه شده

ظرف: لوله سانتریفیوژ 2 میلی لیتری (فیل قلع توصیه نمی شود)

برچسب زدن نمونه: گروه + تکرار به عنوان مثال A1، A2، A3. B1، B2، B3.

حمل و نقل:

1. یخ خشک: نمونه ها باید در کیسه های بسته بندی شده و در یخ خشک دفن شوند.

2. لوله های پایدار RNA: نمونه های RNA را می توان در لوله تثبیت کننده RNA (به عنوان مثال RNAstable®) خشک کرد و در دمای اتاق حمل کرد.

جریان کار خدمات

نوکلئوتیدها:

تحویل نمونه

تحویل نمونه

آماده سازی کتابخانه

ساخت کتابخانه

توالی یابی

توالی یابی

تجزیه و تحلیل داده ها

تجزیه و تحلیل داده ها

خدمات پس از فروش

خدمات پس از فروش

جریان کار خدمات

بافت:

QC نمونه

طراحی آزمایش

تحویل نمونه

تحویل نمونه

آزمایش آزمایشی

استخراج RNA

آماده سازی کتابخانه

ساخت کتابخانه

توالی یابی

توالی یابی

تجزیه و تحلیل داده ها

تجزیه و تحلیل داده ها

خدمات پس از فروش

خدمات پس از فروش


  • قبلی:
  • بعدی:

  • تمام قد

    ● پردازش داده های خام

    ● شناسایی رونوشت

    ● پیوند جایگزین

    ● تعیین کمیت بیان در سطح ژن و سطح ایزوفرم

    ● تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل

    ● حاشیه نویسی و غنی سازی عملکرد (DEG و DET)

     

    آنالیز اسپلایسینگ جایگزین图片20 آنالیز جایگزین پلی آدنیلاسیون (APA)

     

    图片21

     

    پیش بینی lncRNA

     图片22

     

    حاشیه نویسی ژن های جدید

     图片23

     

     

     خوشه بندی DET ها

     

     图片24

     

     

    شبکه های پروتئین-پروتئین در DEG

     

      图片25 

    پیشرفت‌های تسهیل‌شده توسط سرویس‌های توالی‌یابی mRNA تمام‌قد Nanopore BMKGene را از طریق مجموعه‌ای از نشریات مدیریت شده کاوش کنید.

     

    گونگ، بی و همکاران. (2023) "فعال سازی اپی ژنتیکی و رونویسی کیناز ترشحی FAM20C به عنوان یک انکوژن در گلیوما"، مجله ژنتیک و ژنومیکس، 50(6)، صفحات 422-433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.

    او، ز و همکاران. (2023) "توالی نویسی تمام قد لنفوسیت ها به IFN-γ پاسخ ایمنی Th1-swowed را در دست و پا کردن (Paralichthys olivaceus) نشان می دهد"، Fish & Shellfish Immunology، 134، ص. 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.

    Ma، Y. و همکاران. (2023) "تحلیل مقایسه ای روش های توالی یابی RNA PacBio و ONT برای شناسایی سم Nemopilema Nomurai"، Genomics، 115(6)، ص. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.

    یو، دی و همکاران (2023) "تحلیل نانو توالی گرایش عملکردی متفاوت بین اگزوزوم ها و میکرووزیکول های مشتق شده از hUMSC"، تحقیقات و درمان سلول های بنیادی، 14(1)، صفحات 1-13 را نشان می دهد. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TABLES/6.

     

    دریافت یک نقل قول

    پیام خود را اینجا بنویسید و برای ما ارسال کنید

    پیام خود را برای ما ارسال کنید: