-
تجزیه و تحلیل انجمن گسترده ژنوم
هدف مطالعه انجمن گسترده ژنوم (GWAS) شناسایی انواع ژنتیکی (ژنوتیپ) که با صفات خاص (فنوتیپ) مرتبط هستند.مطالعه GWAS نشانگرهای ژنتیکی را بر روی کل ژنوم تعداد زیادی از افراد بررسی می کند و با تجزیه و تحلیل آماری در سطح جمعیت، ارتباط ژنوتیپ- فنوتیپ را پیش بینی می کند.این به طور گسترده ای در تحقیقات در مورد بیماری های انسانی و استخراج ژن عملکردی بر روی صفات پیچیده حیوانات یا گیاهان استفاده شده است.
-
توالی یابی RNA تک هسته ای
پیشرفت در تک سلولی و تکنیک ساخت کتابخانه انفرادی که با توالی یابی با توان بالا ترکیب می شود، امکان مطالعات بیان ژن را بر اساس سلول به سلول فراهم می کند.این یک تجزیه و تحلیل سیستم عمیق تر و کامل را بر روی جمعیت های سلولی پیچیده امکان پذیر می کند، که در آن تا حد زیادی از پوشاندن ناهمگنی آنها با در نظر گرفتن میانگین همه سلول ها جلوگیری می کند.
با این حال، برخی از سلول ها برای تبدیل شدن به سوسپانسیون تک سلولی مناسب نیستند، بنابراین روش های دیگر آماده سازی نمونه - استخراج هسته از بافت ها مورد نیاز است، یعنی هسته مستقیماً از بافت یا سلول استخراج می شود و به سوسپانسیون تک هسته ای برای تک هسته آماده می شود. توالی یابی سلولی
BMK سرویس توالی یابی RNA تک سلولی مبتنی بر ژنومیکس کرومیوم TM 10 را ارائه می دهد.این سرویس به طور گسترده ای در مطالعات مربوط به مطالعات مربوط به بیماری مانند تمایز سلول های ایمنی، ناهمگنی تومور، توسعه بافت و غیره استفاده شده است.
تراشه رونویسی فضایی: 10× ژنومیک
پلتفرم: پلتفرم Illumina NovaSeq
-
توالی یابی ژنوم کل گیاه/حیوان
توالی‌یابی مجدد کل ژنوم، که به عنوان WGS نیز شناخته می‌شود، امکان آشکارسازی جهش‌های رایج و نادر را در کل ژنوم از جمله پلی‌مورفیسم تک نوکلئوتیدی (SNP)، حذف درج (InDel)، تنوع ساختار (SV) و تنوع تعداد کپی (CNV) فراهم می‌کند. ).SV ها نسبت به SNP ها بخش بزرگ تری از پایه تغییرات را تشکیل می دهند و تأثیر بیشتری روی ژنوم دارند که تأثیر قابل توجهی بر موجودات زنده دارد.توالی خوانی طولانی امکان شناسایی دقیق تر قطعات بزرگ و تغییرات پیچیده را فراهم می کند، زیرا خواندن طولانی، عبور کروموزومی از مناطق پیچیده مانند تکرارهای پشت سر هم، مناطق غنی از GC/AT و مناطق بیش از حد متغیر را بسیار آسان تر می کند.
پلتفرم: Illumina، PacBio، Nanopore
-
رونوشت فضایی BMKMANU S1000
سازماندهی فضایی سلول ها در فرآیندهای بیولوژیکی مختلف، مانند نفوذ ایمنی، رشد جنین، و غیره نقش حیاتی ایفا می کند. توالی رونویسی فضایی، که نمایانگر پروفایل بیان ژن در حالی که اطلاعات موقعیت مکانی را حفظ می کند، بینش بزرگی را در مورد معماری بافت در سطح رونوشت ارائه کرده است.با توسعه فناوری، مورفولوژی بافت فوق العاده شفاف و تفاوت ساختاری واقعی بیان مولکولی فضایی باید با وضوح بالاتر مورد مطالعه قرار گیرد.BMKGENE خدمات جامع و یک مرحله ای توالی رونویسی فضایی را از نمونه ها تا بینش های بیولوژیکی ارائه می دهد.
فن‌آوری‌های رونویسی فضایی با حل نمایه بیان ژن با محتوای فضایی در نمونه‌های ناهمگن، دیدگاه‌های جدیدی را در عرصه‌های تحقیقاتی متنوع تقویت کرد.
تراشه رونویسی فضایی: BMKMANU S1000
پلتفرم: پلتفرم Illumina NovaSeq
-
رونوشت فضایی 10x Genomics Visium
Visium Spatial Gene Expression یک فناوری اصلی توالی‌یابی رونوشت فضایی برای طبقه‌بندی بافت بر اساس mRNA کل است.کل رونوشت را با زمینه مورفولوژیکی نقشه برداری کنید تا بینش های جدیدی در مورد رشد طبیعی، آسیب شناسی بیماری و تحقیقات ترجمه بالینی کشف کنید.BMKGENE خدمات جامع و یک مرحله ای توالی رونویسی فضایی را از نمونه ها تا بینش های بیولوژیکی ارائه می دهد.
فناوری‌های رونویسی فضایی با حل نمایه بیان ژن با محتوای فضایی در نمونه‌های ناهمگن، دیدگاه‌های جدیدی را در عرصه‌های تحقیقاتی متنوع تقویت کرد..
تراشه رونویسی فضایی: 10x Genomics Visium
سکو:پلتفرم Illumina NovaSeq
-
توالی mRNA تمام طول - نانوحفره
توالی یابی RNA ابزار ارزشمندی برای تجزیه و تحلیل جامع رونوشت بوده است.بدون شک، توالی خوانی کوتاه سنتی در اینجا به پیشرفت های مهم متعددی دست یافت.با این وجود، اغلب با محدودیت هایی در شناسایی ایزوفرم های تمام قد، کمی سازی، بایاس PCR مواجه می شود.
توالی یابی نانوحفره خود را از سایر پلتفرم های توالی یابی متمایز می کند، زیرا نوکلئوتیدها مستقیماً بدون سنتز DNA خوانده می شوند و خواندن طولانی در ده ها کیلو باز ایجاد می کنند.این امکان را می‌دهد تا رونوشت‌های تمام‌قد را با خواندن مستقیم تلاقی کند و با چالش‌های موجود در مطالعات سطح ایزوفرم مقابله کند.
سکو：پرومتیون نانوپور
کتابخانه:cDNA-PCR
-
توالی یابی mRNA تمام طول - PacBio
نوتوالی رونویسی تمام قد که به آن نیز می گویندنوIso-Seq از مزایای توالی‌سنجی PacBio در طول خواندن استفاده می‌کند، که توالی‌یابی مولکول‌های cDNA تمام طول را بدون هیچ گونه شکستی امکان‌پذیر می‌سازد.این به طور کامل از هرگونه خطای ایجاد شده در مراحل مونتاژ رونوشت جلوگیری می کند و مجموعه های unigene را با وضوح در سطح ایزوفرم می سازد.این مجموعه یونیژن اطلاعات ژنتیکی قدرتمندی را به عنوان "ژنوم مرجع" در سطح رونوشت ارائه می کند.علاوه بر این، ترکیب با داده های توالی یابی نسل بعدی، این سرویس یک کمی سازی دقیق بیان سطح ایزوفرم را امکان پذیر می کند.
پلتفرم: PacBio Sequel IIکتابخانه: کتابخانه زنگ SMRT -
توالی mRNA یوکاریوتی-Illumina
توالی یابی mRNA، پروفایل تمام mRNA های رونویسی شده از سلول ها را در شرایط خاص امکان پذیر می کند.این یک فناوری قدرتمند برای آشکار کردن مشخصات بیان ژن، ساختارهای ژنی و مکانیسم‌های مولکولی فرآیندهای بیولوژیکی خاص است.تا به امروز، توالی یابی mRNA به طور گسترده در تحقیقات بنیادی، تشخیص بالینی، توسعه دارو و غیره استفاده شده است.
پلتفرم: پلتفرم Illumina NovaSeq
-
توالی mRNA مبتنی بر غیر مرجع-Illumina
توالی یابی mRNA از تکنیک توالی یابی نسل بعدی (NGS) برای گرفتن RNA پیام رسان (mRNA) از یوکاریوت در دوره خاصی که برخی از عملکردهای خاص فعال می شوند، استفاده می کند.طولانی‌ترین رونوشت پیوند شده «Unigene» نام داشت و به عنوان دنباله مرجع برای تجزیه و تحلیل بعدی استفاده شد، که وسیله‌ای مؤثر برای مطالعه مکانیسم مولکولی و شبکه تنظیمی گونه‌ها بدون مرجع است.
پس از مونتاژ داده رونوشت و حاشیه نویسی عملکردی یونیژن
(1) تجزیه و تحلیل SSR، پیش‌بینی CDS و ساختار ژن از قبل انجام خواهد شد.
(2) کمی سازی بیان یونیژن در هر نمونه انجام خواهد شد.
(3) یونی ژن های متفاوت بیان شده بین نمونه ها (یا گروه ها) بر اساس بیان یونی ژن کشف خواهند شد.
(4) خوشه بندی، حاشیه نویسی عملکردی و تجزیه و تحلیل غنی سازی یونیژن های بیان شده متفاوت انجام خواهد شد
-
توالی بدون کدگذاری طولانی-Illumina
RNA های طولانی غیر کد کننده (lncRNAs) نوعی مولکول RNA با طول بیش از 200 nt هستند که با پتانسیل کدگذاری بسیار کم مشخص می شوند.LncRNA، به عنوان یک عضو کلیدی در RNA های غیر کدکننده، عمدتاً در هسته و پلاسما یافت می شود.توسعه فناوری توالی یابی و بیوانفورمتیک شناسایی تعداد زیادی lncRNA جدید و مرتبط ساختن آنها با عملکردهای بیولوژیکی را امکان پذیر می کند.شواهد انباشته نشان می دهد که lncRNA به طور گسترده در تنظیم اپی ژنتیک، تنظیم رونویسی و تنظیم پس از رونویسی نقش دارد.
-
توالی RNA کوچک-Illumina
RNA کوچک به دسته‌ای از مولکول‌های RNA غیرکدکننده اطلاق می‌شود که معمولاً طولی کمتر از 200nt دارند، از جمله micro RNA (miRNA)، RNA تداخلی کوچک (siRNA)، و RNA برهمکنش piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) یک کلاس از RNA های کوچک درون زا با طول حدود 20-24nt است که انواع نقش های تنظیمی مهمی را در سلول ها ایفا می کند.miRNA در بسیاری از فرآیندهای حیاتی نقش دارد که بیانگر بافت - خاص و مرحله‌ای - خاص است و در گونه‌های مختلف بسیار حفظ شده است.
-
توالی یابی circRNA-Illumina
CircRNA ها (RNA های دایره ای) یک دسته از مولکول های RNA غیر کد کننده هستند که دارای 5' انتهای کلاهک و 3' انتهای پلی (A) دم هستند.CircRNA ها ساختار دایره ای را توسط پیوند کووالانسی انجام می دهند که در برابر هضم اگزونوکلئاز RNA است.circRNA نقش مهمی در رشد و نمو موجودات و مقاومت آنها در برابر محیط خارجی دارد.
CircRNA عملکردهای زیادی دارد که می تواند به صورت رقابتی miRNA را متصل کند، عملکرد تنظیمی ceRNA را برای تنظیم بیان ژن اعمال کند.در سال های اخیر نیز مشخص شده است که ارتباط تنگاتنگی با بروز و توسعه بیماری ها دارد و چشم انداز کاربردی زیادی در جهت نشانگرهای تشخیص بیماری و غیره دارد.
