● کاهش rRNA و به دنبال آن آماده سازی کتابخانه mRNA جهت دار.
● توالی در Illumina Novaseq.
●تغییرات جوامع میکروبی پیچیده را مطالعه کنید:این در سطح رونویسی اتفاق می افتد و ژنهای جدید بالقوه را کشف می کند.
●توضیح تعامل جامعه میکروبی با میزبان یا محیط.
●تجزیه و تحلیل جامع بیوانفورماتیک: این بینش در مورد ترکیبات طبقه بندی و عملکردی جامعه و همچنین تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل ارائه می دهد.
●حاشیه نویسی گسترده ژن:با استفاده از پایگاه داده های عملکرد ژن به روز برای اطلاعات بیان ژن آموزنده جوامع میکروبی.
●پشتیبانی پس از فروش:تعهد ما فراتر از اتمام پروژه با یک دوره خدمات 3 ماهه پس از فروش است. در این مدت ، ما پیگیری پروژه ، کمک عیب یابی و جلسات پرسش و پاسخ را برای رسیدگی به هرگونه سؤالات مربوط به نتایج ارائه می دهیم.
بسترهای توالی | استراتژی توالی | داده ها توصیه می شوند | کنترل کیفیت داده ها |
Illumina novaseq | PE150 | 12 گیگابایت | q30≥85 ٪ |
غلظت (ng/μl) | مقدار کل (میکروگرم) | حجم (میکرولیتر) | OD260/280 | OD260/230 | چاک |
≥50 | ≥1.0 | ≥ 20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
شامل تجزیه و تحلیل زیر است:
● توالی کنترل کیفیت داده ها
stance مونتاژ رونوشت
● حاشیه نویسی و فراوانی طبقه بندی
● حاشیه نویسی عملکردی و فراوانی
● اندازه گیری بیان و تجزیه و تحلیل دیفرانسیل
توزیع طبقه بندی هر نمونه:
تجزیه و تحلیل تنوع بتا: UPGMA
حاشیه نویسی عملکردی - به وفور بروید
فراوانی طبقه بندی دیفرانسیل - lefse
پیشرفت های تسهیل شده توسط خدمات توالی Transcriptomics Meta BMKGENE را از طریق مجموعه ای از نشریات مورد نظر کشف کنید.
لو ، ز. و همکاران. (2023) "تحمل اسید باکتریهای با استفاده از لاکتات از باکتری های مرتبه در پیشگیری از اسیدوز شکمبه در بزهای سازگار با رژیم غذایی با غلظت بالا ، کمک می کند.تغذیه حیوانات، 14 ، صص 130-140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
آهنگ ، ز. و همکاران. (2017) "میکروبیوتای عملکردی هسته ای در تخمیر حالت جامد سنتی توسط آمپلیکون های با توان بالا و توالی metatranscriptomics" ،مرزهای میکروبیولوژی، 8 (ژوئیه). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/کامل.
وانگ ، دبلیو و همکاران. (2022) "مایک ویروس های رمان کشف شده از یک بررسی متاترانسکتومیک از قارچ Alternaria phytopathogenic" ،ویروس، 14 (11) ، ص. 2552. doi: 10.3390/v14112552/s1.
وی ، جی. و همکاران. (2022) "تجزیه و تحلیل موازی metatranscriptome تخریب متابولیت های ثانویه گیاه توسط سوسک ها و نمادهای روده آنها را نشان می دهد ،مولکولی بوم شناسی، 31 (15) ، صص 3999-4016. doi: 10.1111/mec.16557.