BMKCloud Log in
条形banner-03

محصولات

توالی یابی ژنوم کل گیاه/حیوان

توالی‌یابی مجدد کل ژنوم، که به عنوان WGS نیز شناخته می‌شود، امکان آشکارسازی جهش‌های رایج و نادر را در کل ژنوم از جمله پلی‌مورفیسم تک نوکلئوتیدی (SNP)، حذف درج (InDel)، تنوع ساختار (SV) و تنوع تعداد کپی (CNV) فراهم می‌کند. ).SV ها نسبت به SNP ها بخش بزرگ تری از پایه تغییرات را تشکیل می دهند و تأثیر بیشتری روی ژنوم دارند که تأثیر قابل توجهی بر موجودات زنده دارد.توالی خوانی طولانی امکان شناسایی دقیق تر قطعات بزرگ و تغییرات پیچیده را فراهم می کند، زیرا خواندن طولانی، عبور کروموزومی از مناطق پیچیده مانند تکرارهای پشت سر هم، مناطق غنی از GC/AT و مناطق بیش از حد متغیر را بسیار آسان تر می کند.

پلتفرم: Illumina، PacBio، Nanopore


جزئیات خدمات

نتیجه نمایشی

انتشارات ویژه

1. مزایای خدمات

تجربه گسترده در تعیین توالی ژنوم برای بیش از 1000 گونه.

بیش از 800 مورد منتشر شده با ضریب تأثیر تجمعی بیش از 4000.

تجزیه و تحلیل جامع بیوانفورماتیک در فراخوانی تغییرات و تجزیه و تحلیل تابع.

2. مشخصات خدمات

سکو

کتابخانه

عمق دنباله توصیه شده

ایلومینا

PE 150

برای SNP، تماس InDel ≥ 10x

برای SV، CNY تماس ≥ 30x

 

 

نانوپور

 

8 کیلوبایت

برای SV، CNY تماس ≥ 20x

پاکبیو

CCS

15 کیلوبایت

برای تماس SNP، InDel، SV، CNY ≥ 10x

3. نمونه مورد نیاز

سکو

Conc.(ng/μL)

 

مقدار (ng)

 

خلوص

 

ژل آگارز

 

OD260/280

OD260/230

1. پاک کردن باند اصلی بدون یا محدودتخریب روی ژل مشاهده شد.

2. آلودگی RNA یا پروتئین وجود ندارد یا محدود است

 

ایلومینا

≥1

≥30

 

-

-

نانوپور

 

≥30

بستگی به بازده داده دارد

10 میکروگرم در سلول

1.7-2.2

≥1.5

پاکبیو

CCS

≥50

1.7-2.2

1.8-2.5

4. تجزیه و تحلیل اطلاعات زیستی

wps_doc_3

5. جریان کار خدمات

تحویل نمونه

تحویل نمونه

آزمایش آزمایشی

استخراج DNA

آماده سازی کتابخانه

ساخت کتابخانه

ترتیب دهی

ترتیب دهی

تحلیل داده ها

تحلیل داده ها

数据上传-03

تحویل داده ها


  • قبلی:
  • بعد:

  • 1) آمار نقشه برداری ژنوم

    جدول 1 آمار نتیجه نقشه برداری

    wps_doc_5

    شکل 1 توزیع اندازه درج و پوشش خوانده شده.

    wps_doc_14 wps_doc_6

     

    2) تشخیص متغیر

    شکل 2 آمار و حاشیه نویسی SNP/INDEL/SV در بین نمونه ها

    wps_doc_7 wps_doc_8

     

    شکل 3 توزیع کل ژنوم واتاسیون ها

    wps_doc_9

    3) حاشیه نویسی عملکردی تغییرات

    wps_doc_10 wps_doc_11 wps_doc_12

     

    2019

    ارتباطات طبیعت

    توالی یابی مجدد کل ژنوم منشا Brassica napus و مکان های ژنتیکی دخیل در بهبود آن را نشان می دهد.

    2020

    PNAS

    منشا تکاملی و تاریخچه اهلی شدن ماهی قرمز (Carassius auratus)

    2021

    مجله بیوتکنولوژی گیاهی

    ژنوم مرجع دو گونه جوت کشت شده

    2021

    مجله بیوتکنولوژی گیاهی

    امضاهای ژنومی آلوپلیپلوئید گیاهی و دانه های روغنی Brassicajuncea و جایگاه های ژنتیکی کنترل کننده تجمع گلوکوزینولات ها

    2019

    گیاه مولکولی

    توالی‌یابی مجدد کل ژنوم مجموعه‌ای از کلزا در سراسر جهان، مبنای ژنتیکی واگرایی اکوتیپ آن‌ها را نشان می‌دهد.

    2022

    تحقیقات باغبانی

    تجزیه و تحلیل ارتباط گسترده ژنوم، بینش مولکولی را در مورد تغییرات طبیعی اندازه دانه هندوانه ارائه می دهد

    2021

    مجله گیاه شناسی تجربی

    مطالعه ارتباط گسترده ژنوم، انواع GhSAD1 را شناسایی می کند که تحمل سرما را در پنبه ایجاد می کند.

    2021

    مجله گیاه شناسی تجربی

    مطالعه ارتباط گسترده ژنوم و مقایسه رونویسی QTL جدید و ژن‌های کاندید را نشان می‌دهد که اندازه گلبرگ را در کلزا کنترل می‌کنند.

    یک نقل قول دریافت کنید

    پیام خود را اینجا بنویسید و برای ما ارسال کنید

    پیام خود را برای ما ارسال کنید: