ஹீட்மேப் வரைவதற்கு ஹீட்மேப் டிராயர் பயன்படுத்தப்படுகிறது. இது மேட்ரிக்ஸ் தரவுகளை வடிகட்டவும், இயல்பாக்கவும் மற்றும் தொகுக்கவும் செய்கிறது. இது பெரும்பாலும் வெவ்வேறு மாதிரிகளுக்கு இடையிலான மரபணு வெளிப்பாட்டு நிலையின் தொகுப்புப் பகுப்பாய்விற்குப் பயன்படுத்தப்படுகிறது.
NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam உள்ளிட்ட தரவுத்தளங்களுடன் வரிசைமுறைகளைச் சீரமைப்பதன் மூலம், FASTA கோப்பில் உள்ள வரிசைமுறைகளுக்கு உயிரியல் செயல்பாடுகளை இணைத்தல்.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) என்பது ஒத்த உயிரியல் வரிசைகளைக் கொண்ட பகுதிகளைக் கண்டறியும் ஒரு வழிமுறை மற்றும் நிரலாகும். இது இந்த வரிசைகளை வரிசைத் தரவுத்தளங்களுடன் ஒப்பிட்டு, புள்ளிவிவர முக்கியத்துவத்தைக் கணக்கிடுகிறது. BLAST, வரிசை வகையின் அடிப்படையில் blastn, lastp, blastx மற்றும் tblastn என நான்கு வகையான கருவிகளைக் கொண்டுள்ளது.