-
BMKMANU S3000_இடஞ்சார்ந்த டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்
இடஞ்சார்ந்த டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் என்பது திசுக்களுக்குள் மரபணு வெளிப்பாட்டைப் பதிவுசெய்து காட்சிப்படுத்த உதவும் ஒரு நுட்பமாகும். செல்கள் எவ்வாறு ஒன்றோடொன்று தொடர்பு கொள்கின்றன என்பதைப் புரிந்துகொள்வதற்கு இது மிகவும் முக்கியமானதாக இருக்கலாம்.
இந்த அணுகுமுறைக்கு வெவ்வேறு தளங்கள் உள்ளன. இது தொடர்பாக, BMKGene நிறுவனம் BMKManu 3000 ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சிப் என்ற தளத்தை உருவாக்கியுள்ளது. இது இந்த நுட்பத்தின் செயல்திறனை மேம்படுத்தி, துணை-செல்லுலார் தெளிவுத்திறனை அடைவதோடு, பல-நிலை தெளிவுத்திறன் அமைப்பையும் செயல்படுத்துகிறது.
இந்த சிப், இடஞ்சார்ந்த பார்கோடு கொண்ட ஆய்வுக் கருவிகள் ஏற்றப்பட்ட மணிகளால் அடுக்கப்பட்ட நுண்கிணறுகளின் காப்புரிமை பெற்ற தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்தி 4.2 மில்லியன் புள்ளிகளை உள்ளடக்கியுள்ளது. இந்த முறையின் மூலம், கைப்பற்றல் மற்றும் பெருக்கத்திற்குப் பிறகு, பார்கோடு செய்யப்பட்ட மாதிரிகளால் செறிவூட்டப்பட்ட மற்றும் இல்லுமினாவுடன் இணக்கமான ஒரு cDNA நூலகத்தை நாம் பெறுகிறோம்.
தரவில், இடஞ்சார்ந்த பார்கோடு மற்றும் UMI-களின் ஒருங்கிணைப்பு, உருவாக்கப்படும் தரவின் துல்லியத்தையும் தனித்தன்மையையும் உறுதி செய்கிறது. மேற்கூறிய அனைத்தையும் ஒருங்கிணைத்து, BMKManu மிகவும் பன்முகத்தன்மை வாய்ந்த ஒரு தரவு அமைப்பை வழங்குகிறது.
-
ஒற்றை உட்கரு ஆர்.என்.ஏ வரிசைப்படுத்தல்
ஒற்றை-செல் பிடிப்பு மற்றும் தனிப்பயன் லைப்ரரி கட்டுமான நுட்பங்களின் வளர்ச்சி, உயர்-செயல்திறன் வரிசைப்படுத்தலுடன் இணைந்து, செல் மட்டத்தில் மரபணு வெளிப்பாடு ஆய்வுகளில் ஒரு புரட்சியை ஏற்படுத்தியுள்ளது. இந்த முன்னேற்றம், சிக்கலான செல் தொகுதிகளின் ஆழமான மற்றும் விரிவான பகுப்பாய்வை அனுமதிக்கிறது; இது அனைத்து செல்களிலும் மரபணு வெளிப்பாட்டைச் சராசரியாகக் கணக்கிடுவதில் உள்ள வரம்புகளைக் கடந்து, இந்தத் தொகுதிகளுக்குள் இருக்கும் உண்மையான பன்முகத்தன்மையைப் பாதுகாக்கிறது. ஒற்றை-செல் ஆர்.என்.ஏ வரிசைப்படுத்தலுக்கு (scRNA-seq) மறுக்க முடியாத நன்மைகள் இருந்தாலும், சில திசுக்களில் இது சவால்களை எதிர்கொள்கிறது; அங்கு ஒற்றை-செல் சஸ்பென்ஷனை உருவாக்குவது கடினமாக உள்ளது மற்றும் புதிய மாதிரிகள் தேவைப்படுகின்றன. BMKGene-இல், அதிநவீன 10X Genomics Chromium தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்தி ஒற்றை-நியூக்ளியஸ் ஆர்.என்.ஏ வரிசைப்படுத்தலை (snRNA-seq) வழங்குவதன் மூலம் இந்தத் தடையை நாங்கள் தீர்க்கிறோம். இந்த அணுகுமுறை, ஒற்றை-செல் மட்டத்தில் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வுக்கு ஏற்ற மாதிரிகளின் வரம்பை விரிவுபடுத்துகிறது.
இரட்டைக் குறுக்கீடுகளைக் கொண்ட எட்டு-சேனல் நுண் பாய்மவியல் அமைப்பைக் கொண்டுள்ள புதுமையான 10X ஜெனோமிக்ஸ் குரோமியம் சிப் மூலம் உட்கருக்கள் தனிமைப்படுத்தப்படுகின்றன. இந்த அமைப்பில், பார்கோடுகள், பிரைமர்கள், நொதிகள் மற்றும் ஒரு தனி உட்கரு ஆகியவற்றைக் கொண்ட ஜெல் மணிகள், நானோலிட்டர் அளவுள்ள எண்ணெய் துளிகளில் அடைக்கப்பட்டு, ஜெல் பீட்-இன்-எமல்ஷன் (GEM) உருவாக்கப்படுகிறது. GEM உருவானதைத் தொடர்ந்து, ஒவ்வொரு GEM-இலும் செல் சிதைவும் பார்கோடு வெளியீடும் நிகழ்கின்றன. அதைத் தொடர்ந்து, mRNA மூலக்கூறுகள் தலைகீழ் படியெடுத்தலுக்கு உட்பட்டு, 10X பார்கோடுகள் மற்றும் தனித்துவமான மூலக்கூறு அடையாளங்காட்டிகளை (UMIs) உள்ளடக்கிய cDNA-க்களாக மாறுகின்றன. இந்த cDNA-க்கள் பின்னர் வழக்கமான வரிசைப்படுத்தல் நூலக உருவாக்கத்திற்கு உட்படுத்தப்படுகின்றன, இது ஒற்றை-செல் மட்டத்தில் மரபணு வெளிப்பாட்டு விவரங்களின் வலுவான மற்றும் விரிவான ஆய்வை எளிதாக்குகிறது.
தளம்: 10× ஜெனோமிக்ஸ் குரோமியம் மற்றும் இல்லுமினா நோவாசீக் தளம்
