மொத்தமாக பிரிக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வு
சேவை நன்மைகள்
தகாகி மற்றும் பலர்., தாவர இதழ், 2013
● துல்லியமான உள்ளூர்மயமாக்கல்: பின்னணி இரைச்சலைக் குறைக்க 30+30 முதல் 200+200 நபர்களுடன் மொத்தமாக கலத்தல்;ஒத்த பெயர் அல்லாத பிறழ்வுகள் அடிப்படையிலான வேட்பாளர் பிராந்திய கணிப்பு.
● விரிவான பகுப்பாய்வு: NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG , போன்றவை உட்பட ஆழமான வேட்பாளர் மரபணு செயல்பாடு குறிப்பு.
● விரைவான திருப்ப நேரம்: 45 வேலை நாட்களுக்குள் விரைவான மரபணு உள்ளூர்மயமாக்கல்.
● விரிவான அனுபவம்: பயிர்கள், நீர்வாழ் பொருட்கள், காடுகள், பூக்கள், பழங்கள் போன்ற பல்வேறு வகைகளை உள்ளடக்கிய ஆயிரக்கணக்கான பண்புகளை உள்ளூர்மயமாக்குவதில் BMK பங்களித்துள்ளது.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
மக்கள் தொகை:
எதிரெதிர் பினோடைப்களுடன் பெற்றோரின் சந்ததியைப் பிரித்தல்.
எ.கா. F2 வம்சாவளி, பேக் கிராசிங் (BC), ரீகாம்பினன்ட் இன்பிரெட் லைன்(RIL)
கலவை குளம்
தரமான பண்புகளுக்கு: 30 முதல் 50 நபர்கள் (குறைந்தபட்சம் 20)/மொத்தம்
அளவு tratis க்கான: முழு மக்கள்தொகையில் (குறைந்தபட்சம் 30+30) தீவிர பினோடைப்களைக் கொண்ட முதல் 5% முதல் 10% நபர்கள்.
பரிந்துரைக்கப்பட்ட வரிசைமுறை ஆழம்
குறைந்தபட்சம் 20X/பெற்றோர் மற்றும் 1X/சந்ததி தனிநபர்கள் (எ.கா. 30+30 தனிநபரின் சந்ததி கலப்புக் குளத்திற்கு, மொத்தத்திற்கு 30X வரிசை ஆழம் இருக்கும்)
உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு
● முழு மரபணு ஒத்திசைவு
● தரவு செயலாக்கம்
● SNP/Indel அழைப்பு
● வேட்பாளர் பிராந்திய திரையிடல்
● வேட்பாளர் மரபணு செயல்பாடு சிறுகுறிப்பு
மாதிரி தேவைகள் மற்றும் விநியோகம்
மாதிரி தேவைகள்:
நியூக்ளியோடைடுகள்:
| gDNA மாதிரி | திசு மாதிரி |
| செறிவு: ≥30 ng/μl | தாவரங்கள்: 1-2 கிராம் |
| தொகை: ≥2 μg (தொகுதி ≥15 μl) | விலங்குகள்: 0.5-1 கிராம் |
| தூய்மை: OD260/280= 1.6-2.5 | முழு இரத்தம்: 1.5 மி.லி |
சேவை வேலை ஓட்டம்
சோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
ஆர்என்ஏ பிரித்தெடுத்தல்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
1. வேட்பாளரின் பிராந்தியத்தை அடையாளம் காண யூக்ளிடியன் தொலைவில் (ED) அசோசியேஷன் பகுப்பாய்வு அடிப்படை.பின்வரும் படத்தில்
X-அச்சு: குரோமோசோம் எண்;ஒவ்வொரு புள்ளியும் ஒரு SNP இன் ED மதிப்பைக் குறிக்கிறது.கருப்பு கோடு பொருத்தப்பட்ட ED மதிப்புக்கு ஒத்திருக்கிறது.அதிக ED மதிப்பு, தளத்திற்கும் பினோடைப்பிற்கும் இடையே மிகவும் குறிப்பிடத்தக்க தொடர்பைக் குறிக்கிறது.சிவப்பு கோடு கோடு குறிப்பிடத்தக்க இணைப்பின் நுழைவாயிலைக் குறிக்கிறது.
2.அசோசியேஷன் பகுப்பாய்வு SNP-இண்டெக்ஸ் இல்லை
X-அச்சு: குரோமோசோம் எண்;ஒவ்வொரு புள்ளியும் SNP-இண்டெக்ஸ் மதிப்பைக் குறிக்கிறது.கருப்பு கோடு என்பது பொருத்தப்பட்ட SNP-இண்டெக்ஸ் மதிப்பைக் குறிக்கிறது.பெரிய மதிப்பு, சங்கம் மிகவும் குறிப்பிடத்தக்கது.
BMK வழக்கு
முக்கிய-விளைவு அளவு குணவியல்பு லோகஸ் Fnl7.1 வெள்ளரியில் பழ கழுத்து நீளத்துடன் தொடர்புடைய தாமதமான கரு உருவாக்கம் நிறைந்த புரதத்தை குறியாக்குகிறது.
வெளியிடப்பட்டது: தாவர பயோடெக்னாலஜி ஜர்னல், 2020
வரிசைப்படுத்தும் உத்தி:
பெற்றோர்கள் (Jin5-508, YN): 34× மற்றும் 20×க்கு முழு மரபணு ஒத்திருக்கிறது.
டிஎன்ஏ குளங்கள் (50 நீண்ட கழுத்து மற்றும் 50 குட்டை கழுத்து): 61× மற்றும் 52×க்கு ஒத்திருக்கிறது
முக்கிய முடிவுகள்
இந்த ஆய்வில், நீண்ட கழுத்து வெள்ளரிக் கோடு Jin5-508 மற்றும் குறுகிய கழுத்து YN ஆகியவற்றைக் கடப்பதன் மூலம் மக்கள்தொகையை (F2 மற்றும் F2:3) பிரிப்பது உருவாக்கப்பட்டது.இரண்டு டிஎன்ஏ குளங்கள் 50 தீவிர நீண்ட கழுத்து நபர்கள் மற்றும் 50 தீவிர குறுகிய கழுத்து நபர்களால் கட்டப்பட்டன.BSA பகுப்பாய்வு மற்றும் பாரம்பரிய QTL மேப்பிங் மூலம் Chr07 இல் முக்கிய விளைவு QTL அடையாளம் காணப்பட்டது.சிறந்த மேப்பிங், மரபணு வெளிப்பாடு அளவீடு மற்றும் டிரான்ஸ்ஜெனிக் சோதனைகள் மூலம் வேட்பாளர் பகுதி மேலும் சுருக்கப்பட்டது, இது கழுத்து நீளத்தை கட்டுப்படுத்துவதில் முக்கிய மரபணுவை வெளிப்படுத்தியது, CsFnl7.1.கூடுதலாக, CsFnl7.1 ஊக்குவிப்பாளர் பகுதியில் உள்ள பாலிமார்பிசம் தொடர்புடைய வெளிப்பாட்டுடன் தொடர்புடையதாகக் கண்டறியப்பட்டது.மேலும் பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வு Fnl7.1 லோகஸ் இந்தியாவில் இருந்து தோன்றியிருக்கலாம் என்று பரிந்துரைத்தது.
 வெள்ளரி கழுத்து நீளத்துடன் தொடர்புடைய வேட்பாளர் பகுதியை அடையாளம் காண BSA பகுப்பாய்வில் QTL-மேப்பிங் |  Chr07 இல் அடையாளம் காணப்பட்ட வெள்ளரிக்காய் கழுத்து நீள QTL இன் LOD சுயவிவரங்கள் |
Xu, X. மற்றும் பலர்."பெரிய-விளைவு அளவு பண்பு லோகஸ் Fnl7.1 வெள்ளரியில் பழ கழுத்து நீளத்துடன் தொடர்புடைய ஒரு தாமதமான கரு உருவாக்கம் நிறைந்த புரதத்தை குறியீடாக்குகிறது."தாவர பயோடெக்னாலஜி ஜர்னல் 18.7(2020).
