BMKCloud Log in
条形பேனர்-03

தயாரிப்புகள்

குறிப்பிட்ட-உள்ளூர் பெருக்கப்பட்ட துண்டு வரிசைமுறை (SLAF-Seq)

உயர்-செயல்திறன் மரபணு வகைப்படுத்தல், குறிப்பாக பெரிய அளவிலான மக்கள்தொகையில், மரபணு தொடர்பு ஆய்வுகளில் ஒரு அடிப்படை படியாகும், இது செயல்பாட்டு மரபணு கண்டுபிடிப்பு, பரிணாம பகுப்பாய்வு போன்றவற்றுக்கு மரபணு அடிப்படையை வழங்குகிறது. ஆழமான முழு மரபணு மறு வரிசைமுறைக்கு பதிலாக, குறைக்கப்பட்ட பிரதிநிதித்துவ மரபணு வரிசைமுறை (RRGS ) ஒரு மாதிரிக்கான வரிசைமுறை செலவைக் குறைக்க அறிமுகப்படுத்தப்பட்டது, அதே நேரத்தில் மரபணு மார்க்கர் கண்டுபிடிப்பில் நியாயமான செயல்திறனைப் பராமரிக்கிறது.குறைக்கப்பட்ட பிரதிநிதித்துவ நூலகம் (RRL) எனப் பெயரிடப்பட்ட அளவு வரம்பிற்குள் கட்டுப்பாட்டுப் பகுதியைப் பிரித்தெடுப்பதன் மூலம் இது பொதுவாக அடையப்படுகிறது.ஸ்பெசிஃபிக்-லோகஸ் ஆம்ப்ளிஃபைட் ஃபிராக்மென்ட் சீக்வென்சிங் (SLAF-Seq) என்பது குறிப்பு மரபணுவுடன் அல்லது இல்லாமல் SNP மரபணு வகைப்படுத்தலுக்கான ஒரு சுய-வளர்ச்சியடைந்த உத்தி ஆகும்.
இயங்குதளம்: இல்லுமினா நோவாசெக் இயங்குதளம்


சேவை விவரங்கள்

டெமோ முடிவுகள்

சிறப்பு வெளியீடுகள்

சேவை விவரங்கள்

தொழில்நுட்ப திட்டம்

111

வேலை ஓட்டம்

流程图

சேவை நன்மைகள்

உயர் மார்க்கர் கண்டுபிடிப்பு திறன்- உயர்-செயல்திறன் வரிசைமுறை தொழில்நுட்பம் முழு மரபணுவிற்குள்ளும் நூறாயிரக்கணக்கான குறிச்சொற்களைக் கண்டறிய SLAF-Seq க்கு உதவுகிறது.

மரபணுவில் குறைந்த சார்பு- இது ஒரு குறிப்பு மரபணுவுடன் அல்லது இல்லாமல் இனங்களுக்குப் பயன்படுத்தப்படலாம்.

நெகிழ்வான திட்ட வடிவமைப்பு- ஒற்றை-நொதி, இரட்டை-நொதி, பல-நொதி செரிமானம் மற்றும் பல்வேறு வகையான நொதிகள், அனைத்தும் வெவ்வேறு ஆராய்ச்சி இலக்கு அல்லது இனங்களைப் பூர்த்தி செய்ய தேர்ந்தெடுக்கப்படலாம்.சிலிகோவில் முன் மதிப்பீடு ஒரு உகந்த நொதி வடிவமைப்பை உறுதிப்படுத்த பயன்படுகிறது.

திறமையான நொதி செரிமானம்- நிபந்தனைகளை மேம்படுத்துவதற்கு முன் பரிசோதனை மேற்கொள்ளப்பட்டது, இது முறையான பரிசோதனையை நிலையானதாகவும் நம்பகமானதாகவும் ஆக்குகிறது.துண்டு சேகரிப்பு திறன் 95% க்கும் மேல் அடையலாம்.

சமமாக விநியோகிக்கப்படும் SLAF குறிச்சொற்கள்- SLAF குறிச்சொற்கள் அனைத்து குரோமோசோம்களிலும் மிகப் பெரிய அளவில் சமமாக விநியோகிக்கப்படுகின்றன, 4 kb க்கு சராசரியாக 1 SLAF ஐ அடைகிறது.

மறுநிகழ்வுகளை திறம்பட தவிர்ப்பது- SLAF-Seq தரவுகளில் மீண்டும் மீண்டும் வரும் வரிசை 5%க்கும் குறைவாகக் குறைக்கப்படுகிறது, குறிப்பாக கோதுமை, மக்காச்சோளம் போன்ற அதிக அளவிலான ரிபீட்களைக் கொண்ட இனங்களில்.

விரிவான அனுபவம்தாவரங்கள், பாலூட்டிகள், பறவைகள், பூச்சிகள், நீர்வாழ் உயிரினங்கள் போன்றவற்றை உள்ளடக்கிய நூற்றுக்கணக்கான உயிரினங்களில் 2000-க்கும் மேற்பட்ட மூடப்பட்ட SLAF-Seq திட்டங்கள்.

சுய-வளர்ச்சியடைந்த உயிர் தகவலியல் பணிப்பாய்வு- SLAF-Seq க்கான ஒருங்கிணைந்த பயோ-இன்ஃபர்மேடிக் பணிப்பாய்வு BMKGENE ஆல் இறுதி வெளியீட்டின் நம்பகத்தன்மை மற்றும் துல்லியத்தை உறுதிப்படுத்த உருவாக்கப்பட்டது.

 

சேவை விவரக்குறிப்புகள்

 

நடைமேடை

Conc.(ng/gl)

மொத்தம் (ug)

OD260/280

இல்லுமினா நோவாசெக்

>35

>1.6(தொகுதி>15μl)

1.6-2.5

குறிப்பு: மூன்று மாதிரிகள், ஒவ்வொன்றும் மூன்று என்சைம் திட்டங்களுடன், முன் பரிசோதனைக்காகச் செய்யப்படும்.

பரிந்துரைக்கப்பட்ட வரிசைமுறை உத்தி

வரிசைமுறை ஆழம்: 10X/டேக்

மரபணு அளவு

பரிந்துரைக்கப்பட்ட SLAF குறிச்சொற்கள்

< 500 Mb

100K அல்லது WGS

500 எம்பி- 1 ஜிபி

100 கே

1 ஜிபி -2 ஜிபி

200 கே

மாபெரும் அல்லது சிக்கலான மரபணுக்கள்

300 - 400K

 

விண்ணப்பங்கள்

 

பரிந்துரைக்கப்படுகிறது

மக்கள் தொகை அளவு

 

வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி மற்றும் ஆழம்

 

ஆழம்

 

குறி எண்

 

GWAS

 

மாதிரி எண் ≥ 200

 

10X

 

 

 

 

 

படி

மரபணு அளவு

 

மரபணு பரிணாமம்

 

ஒவ்வொருவரின் தனி நபர்கள்

துணைக்குழு ≥ 10;

மொத்த மாதிரிகள் ≥30

 

10X

 

பரிந்துரைக்கப்பட்ட மாதிரி விநியோகம்

கொள்கலன்: 2 மில்லி மையவிலக்கு குழாய்

பெரும்பாலான மாதிரிகளுக்கு, எத்தனாலில் சேமிக்க வேண்டாம் என்று பரிந்துரைக்கிறோம்.

மாதிரி லேபிளிங்: மாதிரிகள் தெளிவாக லேபிளிடப்பட வேண்டும் மற்றும் சமர்ப்பிக்கப்பட்ட மாதிரி தகவல் படிவத்துடன் ஒத்ததாக இருக்க வேண்டும்.

ஏற்றுமதி: உலர்-பனி: மாதிரிகளை முதலில் பைகளில் அடைத்து உலர் பனியில் புதைக்க வேண்டும்.

சேவை பணிப்பாய்வு

மாதிரி QC
பைலட் பரிசோதனை
SLAF சோதனை
நூலக தயாரிப்பு
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பின் சேவைகள்

மாதிரி QC

பைலட் பரிசோதனை

SLAF-சோதனை

நூலக தயாரிப்பு

வரிசைப்படுத்துதல்

தரவு பகுப்பாய்வு

விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்


  • முந்தைய:
  • அடுத்தது:

  • 1. வரைபட முடிவின் புள்ளிவிவரங்கள்

    படம்1

    A1

    2. SLAF மார்க்கர் மேம்பாடு

    A2

    3. மாறுபாடு சிறுகுறிப்பு

    A3

    ஆண்டு

    இதழ்

    IF

    தலைப்பு

    விண்ணப்பங்கள்

    2022

    இயற்கை தொடர்பு

    17.694

    ட்ரீ பியோனியின் கிகா-குரோமோசோம்கள் மற்றும் ஜிகா-ஜீனோம் ஆகியவற்றின் மரபணு அடிப்படை

    பியோனியா ஆஸ்டி

    SLAF-GWAS

    2015

    புதிய பைட்டாலஜிஸ்ட்

    7.433

    வேளாண்மை முக்கியத்துவம் வாய்ந்த மரபியல் பகுதிகளை வீட்டுத் தடங்கள் நங்கூரமிடுகின்றன

    சோயாபீன்ஸ்

    SLAF-GWAS

    2022

    மேம்பட்ட ஆராய்ச்சி இதழ்

    12.822

    ஜி. ஹிர்சுட்டமுக்குள் கோசிபியம் பார்படென்ஸின் மரபணு அளவிலான செயற்கையான ஊடுருவல்கள்

    பருத்தி இழையின் தரம் மற்றும் விளைச்சலை ஒரே நேரத்தில் மேம்படுத்துவதற்கான உயர்ந்த இடத்தை வெளிப்படுத்துகிறது

    பண்புகள்

    SLAF- பரிணாம மரபியல்

    2019

    மூலக்கூறு ஆலை

    10.81

    மக்கள்தொகை மரபணு பகுப்பாய்வு மற்றும் டி நோவோ அசெம்பிளி ஆகியவை வீடியின் தோற்றத்தை வெளிப்படுத்துகின்றன

    ஒரு பரிணாம விளையாட்டாக அரிசி

    SLAF- பரிணாம மரபியல்

    2019

    இயற்கை மரபியல்

    31.616

    பொதுவான கெண்டை, சைப்ரினஸ் கார்பியோவின் மரபணு வரிசை மற்றும் மரபணு வேறுபாடு

    SLAF-இணைப்பு வரைபடம்

    2014

    இயற்கை மரபியல்

    25.455

    பயிரிடப்பட்ட வேர்க்கடலையின் மரபணு பருப்பு வகை காரியோடைப், பாலிப்ளோயிட் பற்றிய நுண்ணறிவை வழங்குகிறது

    பரிணாமம் மற்றும் பயிர் வளர்ப்பு.

    SLAF-இணைப்பு வரைபடம்

    2022

    தாவர பயோடெக்னாலஜி ஜர்னல்

    9.803

    ST1 ஐ அடையாளம் காண்பது, விதை உருவ அமைப்பைப் பற்றிய ஒரு தேர்வை வெளிப்படுத்துகிறது

    மற்றும் சோயாபீன் வளர்ப்பின் போது எண்ணெய் உள்ளடக்கம்

    SLAF-மார்க்கர் வளர்ச்சி

    2022

    மூலக்கூறு அறிவியல் சர்வதேச இதழ்

    6.208

    கோதுமை-லேமஸ் மோலிஸ் 2Ns (2D)க்கான அடையாளம் மற்றும் DNA குறிப்பான் மேம்பாடு

    டிசோமிக் குரோமோசோம் மாற்று

    SLAF-மார்க்கர் வளர்ச்சி

    ஒரு மேற்கோள் கிடைக்கும்

    உங்கள் செய்தியை இங்கே எழுதி எங்களுக்கு அனுப்பவும்

    உங்கள் செய்தியை எங்களுக்கு அனுப்பவும்: