வெப்ப வரைபடம்
மேட்ரிக்ஸ் தரவுக் கோப்பு வெப்ப வரைபட வரைவதற்குப் பயன்படுத்தப்படுகிறது, இது மேட்ரிக்ஸ் தரவை வடிகட்டலாம், இயல்பாக்கலாம் மற்றும் கிளஸ்டர் செய்யலாம்.இது பெரும்பாலும் வெவ்வேறு மாதிரிகளுக்கு இடையில் மரபணு வெளிப்பாடு நிலையின் கிளஸ்டர் பகுப்பாய்விற்குப் பயன்படுத்தப்படுகிறது.
மரபணு சிறுகுறிப்பு
பல்வேறு தரவுத்தளங்களுக்கு எதிராக ஃபாஸ்டா கோப்பில் வரிசைகளை மேப்பிங் செய்வதன் மூலம் மரபணு செயல்பாடு சிறுகுறிப்பு செய்யப்படுகிறது.
மரபணு சிறுகுறிப்பு
அடிப்படை உள்ளூர் சீரமைப்பு தேடல் கருவி
CDS_UTR_Prediction
அறியப்பட்ட புரோட்டீன் தரவுத்தளம் மற்றும் ORF கணிப்பு ஆகியவற்றின் அடிப்படையில் கொடுக்கப்பட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்ட் வரிசைகளில் குறியீட்டு பகுதிகள் (CDS) மற்றும் குறியீட்டு அல்லாத பகுதிகள் (UTR) ஆகியவற்றைக் கணிக்க இந்தக் கருவி வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது.
மன்ஹாட்டன் ப்ளாட்
மன்ஹாட்டன் ப்ளாட் அதிக எண்ணிக்கையிலான தரவுப் புள்ளிகளுடன் தரவைக் காண்பிக்க உதவுகிறது.இது பொதுவாக மரபணு அளவிலான சங்க ஆய்வுகளில் (GWAS) பயன்படுத்தப்படுகிறது.
சர்கோஸ்
CIRCOS வரைபடம் மரபணுவில் SNP, InDeL, SV, CNV விநியோகங்களின் நேரடி விளக்கத்தை செயல்படுத்துகிறது.
GO_செறிவூட்டல்
TopGO என்பது செயல்பாட்டு செறிவூட்டலுக்காக வடிவமைக்கப்பட்ட ஒரு கருவியாகும்.TopGO-Bioconductor தொகுப்பு வேறுபட்ட வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு, GO செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு மற்றும் முடிவுகளின் காட்சிப்படுத்தல் ஆகியவற்றைக் கொண்டுள்ளது.இது topGO_BP, topGO_CC மற்றும் topGO_MF க்கான முடிவுகளைக் கொண்ட "வரைபடம்" என்ற பெயரில் ஒரு கோப்புறையை உருவாக்கும்.
WGCNA
WGCNA என்பது மரபணு இணை வெளிப்பாடு தொகுதிகளைக் கண்டறிய பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படும் தரவுச் செயலாக்க முறையாகும்.மைக்ரோஅரே தரவு மற்றும் அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறையிலிருந்து உருவான மரபணு வெளிப்பாடு தரவு உள்ளிட்ட பல்வேறு வெளிப்பாடு தரவுத்தொகுப்புகளுக்கு இது பொருந்தும்.
InterProScan
InterPro புரத வரிசை பகுப்பாய்வு மற்றும் வகைப்பாடு
GO_KEGG_செறிவூட்டல்
இந்தக் கருவியானது GO செறிவூட்டல் ஹிஸ்டோகிராம், KEGG செறிவூட்டல் ஹிஸ்டோகிராம் மற்றும் KEGG செறிவூட்டல் பாதை ஆகியவற்றை வழங்கிய மரபணு தொகுப்பு மற்றும் தொடர்புடைய சிறுகுறிப்பு ஆகியவற்றின் அடிப்படையில் உருவாக்க வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது.