ஹீட்மேப்
ஹீட்மேப் கருவி ஒரு மேட்ரிக்ஸ் தரவு கோப்பை உள்ளீடாக ஏற்றுக்கொள்கிறது மற்றும் பயனர்கள் தரவை வடிகட்ட, இயல்பாக்க மற்றும் கிளஸ்டர் செய்ய அனுமதிக்கிறது. ஹீட்மேப்களுக்கான முதன்மை பயன்பாட்டு வழக்கு வெவ்வேறு மாதிரிகளுக்கு இடையில் மரபணு வெளிப்பாடு மட்டத்தின் கிளஸ்டர் பகுப்பாய்வு ஆகும்.
மரபணு குறிப்பு
பல்வேறு தரவுத்தளங்களுக்கு எதிராக உள்ளீட்டு FASTA கோப்புகளின் வரிசை சீரமைப்பின் அடிப்படையில் மரபணு குறிப்புக் கருவி மரபணு குறிப்புகளைச் செய்கிறது.
அடிப்படை உள்ளூர் சீரமைப்பு தேடல் கருவி (BLAST)
BLAST கருவி என்பது NCBI BLAST இன் BMKCloud ஒருங்கிணைந்த பதிப்பாகும், மேலும் BMKCloud கணக்கில் பதிவேற்றப்பட்ட தரவைப் பயன்படுத்தி அதே செயல்பாடுகளைச் செய்ய இதைப் பயன்படுத்தலாம்.
CDS_UTR கணிப்பு
அறியப்பட்ட புரத தரவுத்தளங்கள் மற்றும் ORF கணிப்பு விளைவுகளுக்கு எதிரான BLAST முடிவுகளின் அடிப்படையில் கொடுக்கப்பட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்ட் வரிசைகளில் குறியீட்டு பகுதிகள் (CDS) மற்றும் குறியீட்டு அல்லாத பகுதிகள் (UTR) ஆகியவற்றைக் கணிக்க CDS_UTR கணிப்பு கருவி வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது.
மன்ஹாட்டன் சதி
மன்ஹாட்டன் ப்ளாட் கருவி உயர் மாதிரி சோதனைகளைக் காண்பிக்க உதவுகிறது மற்றும் பொதுவாக மரபணு-அளவிலான சங்க ஆய்வுகளில் (GWAS) பயன்படுத்தப்படுகிறது.
சர்கோஸ் வரைபடம்
CIRCOS வரைபடக் கருவி, மரபணு முழுவதும் மரபணு அம்சம் எவ்வாறு விநியோகிக்கப்படுகிறது என்பதைத் திறம்படக் காட்சிப்படுத்துகிறது. பொதுவான அம்சங்களில் அளவு சார்ந்த இடங்கள், SNPகள், InDels, கட்டமைப்பு மற்றும் நகல் எண் மாறுபாடுகள் ஆகியவை அடங்கும்.
மரபணு ஆன்டாலஜி (GO) செறிவூட்டல்
GO Enrichment கருவி செயல்பாட்டு செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வை வழங்குகிறது. இந்த கருவியில் உள்ள முதன்மை மென்பொருள் TopGO-Bioconductor தொகுப்பு ஆகும், இதில் வேறுபட்ட வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு, GO செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு மற்றும் முடிவுகளின் காட்சிப்படுத்தல் ஆகியவை அடங்கும்.
எடையிடப்பட்ட மரபணு இணை வெளிப்பாடு வலையமைப்பு பகுப்பாய்வு (WGCNA)
WGCNA என்பது மரபணு இணை-வெளிப்பாடு தொகுதிகளைக் கண்டறிவதற்கான பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படும் தரவுச் செயலாக்க முறையாகும். இது மைக்ரோஅரே மற்றும் NGS மரபணு வெளிப்பாடு தரவு உள்ளிட்ட பல்வேறு வெளிப்பாடு தரவுத்தொகுப்புகளுக்குப் பொருந்தும்.
இன்டர்ப்ரோஸ்கேன்
இன்டர்ப்ரோஸ்கேன் கருவி இன்டர்ப்ரோ புரத வரிசை பகுப்பாய்வு மற்றும் வகைப்பாட்டை வழங்குகிறது.
GO KEGG செறிவூட்டல்
GO KEGG செறிவூட்டல் கருவி என்பது வழங்கப்பட்ட மரபணு தொகுப்பு மற்றும் தொடர்புடைய குறிப்புகளின் அடிப்படையில் GO செறிவூட்டல் ஹிஸ்டோகிராம், KEGG செறிவூட்டல் ஹிஸ்டோகிராம் மற்றும் KEGG செறிவூட்டல் பாதையை உருவாக்க வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது.