வெப்ப வரைபடம்
ஹீட்மேப் கருவியானது ஒரு மேட்ரிக்ஸ் தரவுக் கோப்பை உள்ளீடாக ஏற்றுக்கொண்டு, தரவை வடிகட்டவும், இயல்பாக்கவும் மற்றும் தொகுக்கவும் பயனர்களை அனுமதிக்கிறது. வெவ்வேறு மாதிரிகளுக்கு இடையிலான மரபணு வெளிப்பாட்டு நிலையின் தொகுப்புப் பகுப்பாய்வு செய்வதே ஹீட்மேப்களின் முதன்மைப் பயன்பாடாகும்.
மரபணு குறிப்புரை
மரபணு விளக்கக் கருவியானது, உள்ளீட்டு FASTA கோப்புகளின் வரிசைகளை பல்வேறு தரவுத்தளங்களுடன் சீரமைப்பதன் அடிப்படையில் மரபணு விளக்கத்தை மேற்கொள்கிறது.
அடிப்படை உள்ளூர் சீரமைப்பு தேடல் கருவி (BLAST)
BLAST கருவியானது, NCBI BLAST-இன் BMKCloud ஒருங்கிணைக்கப்பட்ட பதிப்பாகும். மேலும், BMKCloud கணக்கில் பதிவேற்றப்பட்ட தரவைப் பயன்படுத்தி அதே செயல்பாடுகளைச் செய்ய இதனைப் பயன்படுத்தலாம்.
CDS_UTR கணிப்பு
CDS_UTR முன்கணிப்புக் கருவியானது, அறியப்பட்ட புரதத் தரவுத்தளங்களுக்கு எதிரான BLAST முடிவுகள் மற்றும் ORF முன்கணிப்பு முடிவுகளின் அடிப்படையில், கொடுக்கப்பட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்ட் வரிசைகளில் உள்ள குறியீட்டுப் பகுதிகள் (CDS) மற்றும் குறியீடற்ற பகுதிகளை (UTR) முன்கணிக்க வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது.
மன்ஹாட்டன் ப்ளாட்
மன்ஹாட்டன் ப்ளாட் கருவியானது அதிக மாதிரி சோதனைகளைக் காட்சிப்படுத்த உதவுகிறது மற்றும் மரபணுத்தொகுதி-பரவல் தொடர்பு ஆய்வுகளில் (GWAS) பொதுவாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது.
சர்க்கோஸ் வரைபடம்
CIRCOS வரைபடக் கருவியானது, மரபணுத்தொகுதி முழுவதும் மரபணு அம்சங்கள் எவ்வாறு பரவியுள்ளன என்பதைத் திறம்படக் காட்சிப்படுத்துகிறது. பொதுவான அம்சங்களில் அளவுசார் இடங்கள், SNPs, InDels, கட்டமைப்பு மற்றும் நகல் எண் மாறுபாடுகள் ஆகியவை அடங்கும்.
மரபணு ஆன்காலஜி (GO) செறிவூட்டல்
GO செறிவூட்டல் கருவியானது செயல்பாட்டு செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வை வழங்குகிறது. இந்தக் கருவியில் உள்ள முதன்மை மென்பொருள் TopGO-Bioconductor தொகுப்பாகும், இது வேறுபட்ட வெளிப்பாட்டுப் பகுப்பாய்வு, GO செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு மற்றும் முடிவுகளின் காட்சிப்படுத்தல் ஆகியவற்றை உள்ளடக்கியுள்ளது.
எடையிடப்பட்ட மரபணு இணை வெளிப்பாட்டு வலையமைப்பு பகுப்பாய்வு (WGCNA)
WGCNA என்பது மரபணு இணை வெளிப்பாட்டுத் தொகுதிகளைக் கண்டறிவதற்காகப் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படும் ஒரு தரவுச் சுரண்டல் முறையாகும். இது மைக்ரோஅரே மற்றும் NGS மரபணு வெளிப்பாட்டுத் தரவு உள்ளிட்ட பல்வேறு வெளிப்பாட்டுத் தரவுத்தொகுப்புகளுக்குப் பொருந்தும்.
இன்டர்ப்ரோஸ்கேன்
இன்டர்ப்ரோஸ்கேன் கருவியானது, இன்டர்ப்ரோ புரத வரிசைப் பகுப்பாய்வு மற்றும் வகைப்பாட்டை வழங்குகிறது.
கோ கெக் செறிவூட்டல்
GO KEGG செறிவூட்டல் கருவியானது, வழங்கப்பட்ட மரபணுத் தொகுப்பு மற்றும் அதனுடன் தொடர்புடைய விளக்கக்குறிப்புகளின் அடிப்படையில் ஒரு GO செறிவூட்டல் வரைபடம், KEGG செறிவூட்டல் வரைபடம் மற்றும் KEGG செறிவூட்டல் வழித்தடம் ஆகியவற்றை உருவாக்குவதற்காக வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது.
