மெட்டாஜெனோமிக் வரிசைமுறை - NGS
மெட்டாஜீனோம் என்பது சுற்றுச்சூழல் மற்றும் மனித மெட்டாஜீனோம்கள் போன்ற, உயிரினங்களின் ஒரு கலப்பு சமூகத்தின் மொத்த மரபணுப் பொருட்களின் தொகுப்பாகும். இது வளர்க்கக்கூடிய மற்றும் வளர்க்க முடியாத நுண்ணுயிரிகளின் ஜீனோம்களைக் கொண்டுள்ளது. NGS உடனான ஷாட்கன் மெட்டாஜீனோமிக் வரிசைமுறை, வகைப்பாட்டு விவரக்குறிப்புக்கு மேலாக, சிற்றினப் பன்முகத்தன்மை, பெருக்க இயக்கவியல் மற்றும் சிக்கலான இனக்கூட்டக் கட்டமைப்புகள் பற்றிய நுணுக்கமான நுண்ணறிவுகளையும் வழங்குவதன் மூலம், சுற்றுச்சூழல் மாதிரிகளில் பொதிந்துள்ள இந்த சிக்கலான ஜீனோம் நிலப்பரப்புகளைப் பற்றிய ஆய்வைச் சாத்தியமாக்குகிறது. வகைப்பாட்டு ஆய்வுகளுக்கு அப்பால், ஷாட்கன் மெட்டாஜீனோமிக்ஸ் ஒரு செயல்பாட்டு ஜீனோம் கண்ணோட்டத்தையும் வழங்குகிறது, இது குறியிடப்பட்ட மரபணுக்களையும் சூழலியல் செயல்முறைகளில் அவற்றின் சாத்தியமான பங்குகளையும் ஆராய உதவுகிறது. இறுதியாக, மரபணுக் கூறுகளுக்கும் சுற்றுச்சூழல் காரணிகளுக்கும் இடையிலான தொடர்பு வலைப்பின்னல்களை நிறுவுவது, நுண்ணுயிரி சமூகங்களுக்கும் அவற்றின் சூழலியல் பின்னணிக்கும் இடையிலான சிக்கலான இடைவினையைப் பற்றிய ஒரு முழுமையான புரிதலுக்குப் பங்களிக்கிறது. முடிவாக, மெட்டாஜீனோமிக் வரிசைமுறையானது, பல்வேறு நுண்ணுயிரி சமூகங்களின் ஜீனோம் சிக்கல்களை அவிழ்ப்பதற்கும், இந்த சிக்கலான சூழல் அமைப்புகளுக்குள் மரபியல் மற்றும் சூழலியலுக்கு இடையிலான பன்முக உறவுகளை வெளிச்சம் போடுவதற்கும் ஒரு முக்கிய கருவியாக விளங்குகிறது.
தளங்கள்: இல்லுமினா நோவாசீக் மற்றும் டிஎன்பிஎஸ்ஈக்-டி7
சேவை நன்மைகள்
●நுண்ணுயிர் சமூக சுயவிவரத்தை உருவாக்குவதற்கான தனிமைப்படுத்தல் மற்றும் வளர்ப்பு இல்லாத முறைவளர்க்க முடியாத உயிரினங்களின் மரபணுப் பொருட்களை வரிசைப்படுத்துவதை சாத்தியமாக்குதல்.
●உயர் தெளிவுத்திறன்சுற்றுச்சூழல் மாதிரிகளில் குறைந்த எண்ணிக்கையில் உள்ள உயிரினங்களைக் கண்டறியவும்.
●விரிவான உயிரித் தகவல் பகுப்பாய்வு:வகைப்பாட்டுப் பன்முகத்தன்மையில் மட்டுமல்லாமல், சமூகத்தின் செயல்பாட்டுப் பன்முகத்தன்மையிலும் கவனம் செலுத்துகிறது.
●விரிவான அனுபவம்:பல்வேறு ஆராய்ச்சித் துறைகளில் பல மெட்டாஜீனோமிக்ஸ் திட்டங்களை வெற்றிகரமாக முடித்து, 200,000-க்கும் மேற்பட்ட மாதிரிகளைப் பதப்படுத்திய அனுபவத்துடன், எங்கள் குழு ஒவ்வொரு திட்டத்திற்கும் தனது பரந்த அனுபவத்தைக் கொண்டுவருகிறது.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| வரிசைப்படுத்தல் தளம் | வரிசைப்படுத்தும் உத்தி | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு | தரக் கட்டுப்பாடு |
| இலுமினா நோவாசீக் அல்லது டிஎன்பிசீக்-டி7 | PE150 | 6-20ஜிபி | Q30≥85% |
சேவை தேவைகள்
| செறிவு (ng/µL) | மொத்த அளவு (ng) | கன அளவு (µL) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● மண்/கசடு: 2-3 கிராம்
● விலங்கின் குடல் உள்ளடக்கம்: 0.5-2 கிராம்
● பூச்சியின் குடல் உள்ளடக்கங்கள்: 0.1-0.25 கிராம்
● தாவர மேற்பரப்பு (செறிவூட்டப்பட்ட வண்டல்): 0.5-1கி
● நொதித்தல் சாறு செறிவூட்டப்பட்ட வண்டல்): 0.2-0.5கி
● மலம் (பெரிய விலங்குகள்): 0.5-2 கிராம்
● எலியின் மலம்: 3-5 மணிகள்
● நுரையீரல் காற்றுப்பை கழுவுதல் திரவம்: வடிகட்டித் தாள்
● யோனிவழி மாதிரி எடுத்தல்: 5-6 மாதிரிகள்
● தோல்/பிறப்புறுப்பு மாதிரி/உமிழ்நீர்/வாய் மென்திசு/தொண்டை மாதிரி/மலக்குடல் மாதிரி: 2-3 மாதிரிகள்
● மேற்பரப்பு நுண்ணுயிரி: 5-6 மாதிரிகள்
● நீர்நிலைகள்/காற்று/உயிர்ப்படலம்: வடிகட்டித் தாள்
● எண்டோஃபைட்டுகள்: 2-3 கிராம்
● பல் தகடு: 0.5-1 கிராம்
சேவை பணிப்பாய்வு
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
பின்வரும் பகுப்பாய்வை உள்ளடக்கியது:
● வரிசைப்படுத்தல் தரவு தரக் கட்டுப்பாடு
● மெட்டாஜீனோம் தொகுப்பு மற்றும் மரபணு முன்கணிப்பு
● மரபணு குறிப்புரை
● வகைப்பாட்டு ஆல்பா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு
● சமூகத்தின் செயல்பாட்டுப் பகுப்பாய்வு: உயிரியல் செயல்பாடு, வளர்சிதை மாற்றம், நுண்ணுயிர் எதிர்ப்புத்திறன்
● செயல்பாட்டு மற்றும் வகைப்பாட்டுப் பன்முகத்தன்மை ஆகிய இரண்டின் மீதான பகுப்பாய்வு:
பீட்டா பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு
குழுக்களுக்கு இடையேயான பகுப்பாய்வு
தொடர்புப் பகுப்பாய்வு: சுற்றுச்சூழல் காரணிகளுக்கும் OUT-இன் அமைப்பு மற்றும் பன்முகத்தன்மைக்கும் இடையே
செயல்பாட்டுப் பகுப்பாய்வு: CARD நுண்ணுயிர் எதிர்ப்புத்திறன்
KEGG வளர்சிதை மாற்றப் பாதைகளின் வேறுபாட்டுப் பகுப்பாய்வு: முக்கியப் பாதைகளின் வெப்ப வரைபடம்
வகைப்பாட்டுப் பரவலின் ஆல்பா பன்முகத்தன்மை: ACE குறியீடு
வகைப்பாட்டுப் பரவலின் பீட்டா பன்முகத்தன்மை: PCoA
தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம், இல்லுமினாவுடன் இணைந்து BMKGene வழங்கும் மெட்டாஜீனோம் வரிசைப்படுத்தல் சேவைகளால் ஏற்பட்டுள்ள முன்னேற்றங்களை ஆராய்ந்து பாருங்கள்.
ஹாய், கியூ. மற்றும் பலர் (2023) 'வெவ்வேறு வளர்ப்பு நீர் வெப்பநிலைகளில் தொற்று ஹெமடோபாய்டிக் நெக்ரோசிஸ் வைரஸால் பாதிக்கப்பட்ட ரெயின்போ டிரவுட் (Oncorhynchus mykiss) மீன்களின் குடல் உள்ளடக்கங்களில் ஏற்படும் மாற்றங்களின் மெட்டாஜெனாமிக் மற்றும் மெட்டபாலோமிக் பகுப்பாய்வு',நுண்ணுயிரியலில் எல்லைகள், 14, ப. 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
மாவோ, சி. மற்றும் பலர் (2023) 'பல்வேறு ஊட்டமட்டங்களைக் கொண்ட நகர்ப்புற ஏரிகளில் உள்ள நுண்ணுயிர் சமூகங்கள், எதிர்ப்பு மரபணுக்கள் மற்றும் எதிர்ப்புத்தொகுதி அபாயங்கள்: அகத் தொடர்புகளும் புறத் தாக்கங்களும்',அபாயகரமான பொருட்கள் முன்னேற்றங்கள் இதழ், 9, பக். 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.
சு, எம். மற்றும் பலர். (2022) 'செம்மறி ஆடுகளின் இரைப்பையில் உள்ள திரவத்துடன் தொடர்புடைய மற்றும் திடப்பொருளுடன் தொடர்புடைய நுண்ணுயிரிகளுக்கு இடையேயான அமைப்பு மற்றும் செயல்பாட்டில் உள்ள வேறுபாடுகளை மெட்டாஜீனமிக் பகுப்பாய்வு வெளிப்படுத்தியது',நுண்ணுயிரியலில் எல்லைகள், 13, ப. 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.
யின், ஜே. மற்றும் பலர். (2023) 'உடல் பருமன் கொண்ட நிங்சியாங் பன்றியிலிருந்து பெறப்பட்ட நுண்ணுயிரிக் கூட்டமானது, மெலிந்த DLY பன்றிகளில் தசை கொழுப்பு அமிலப் படிவை ஊக்குவிப்பதற்காக கார்னிடைன் வளர்சிதை மாற்றத்தை மறுசீரமைக்கிறது',புதுமை, 4(5), ப. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.
ஜாவோ, எக்ஸ். மற்றும் பலர். (2023) 'சீனாவின் ஹைஹே முகத்துவாரத்தின் மேல் மற்றும் கீழ் பகுதிகளில் உள்ள பிரதிநிதித்துவ உயிரி/சிதைவடையாத நெகிழி மற்றும் நெகிழி அல்லாத கழிவுகளால் ஏற்படக்கூடிய அபாயங்கள் குறித்த மெட்டாஜீனமிக் நுண்ணறிவுகள்',மொத்த சுற்றுச்சூழல் அறிவியல், 887, ப. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.
