-
மெட்டாஜெனோமிக் சீக்வென்சிங் -என்ஜிஎஸ்
ஒரு மெட்டஜெனோம் என்பது சுற்றுச்சூழல் மற்றும் மனித மெட்டஜெனோம்கள் போன்ற உயிரினங்களின் கலப்பு சமூகத்தின் மொத்த மரபணு பொருட்களின் தொகுப்பாகும். இது பயிரிடக்கூடிய மற்றும் பயிரிட முடியாத நுண்ணுயிரிகளின் மரபணுக்களைக் கொண்டுள்ளது. NGS உடனான ஷாட்கன் மெட்டஜெனோமிக் சீக்வென்சிங், வகைபிரித்தல் விவரக்குறிப்பை விட அதிகமாக வழங்குவதன் மூலம் சுற்றுச்சூழல் மாதிரிகளில் உட்பொதிக்கப்பட்ட இந்த சிக்கலான மரபணு நிலப்பரப்புகளை ஆய்வு செய்ய உதவுகிறது, மேலும் உயிரினங்களின் பன்முகத்தன்மை, ஏராளமான இயக்கவியல் மற்றும் சிக்கலான மக்கள்தொகை கட்டமைப்புகள் பற்றிய நுண்ணிய நுண்ணறிவுகளையும் வழங்குகிறது. வகைபிரித்தல் ஆய்வுகளுக்கு அப்பால், ஷாட்கன் மெட்டஜெனோமிக்ஸ் ஒரு செயல்பாட்டு மரபியல் முன்னோக்கை வழங்குகிறது, குறியிடப்பட்ட மரபணுக்கள் மற்றும் சுற்றுச்சூழல் செயல்முறைகளில் அவற்றின் தூண்டுதல் பாத்திரங்களை ஆராய்வதற்கு உதவுகிறது. இறுதியாக, மரபியல் கூறுகள் மற்றும் சுற்றுச்சூழல் காரணிகளுக்கு இடையே தொடர்பு நெட்வொர்க்குகளை நிறுவுவது நுண்ணுயிர் சமூகங்கள் மற்றும் அவற்றின் சுற்றுச்சூழல் பின்னணி ஆகியவற்றுக்கு இடையேயான சிக்கலான இடைவினை பற்றிய முழுமையான புரிதலுக்கு பங்களிக்கிறது. முடிவில், பல்வேறு நுண்ணுயிர் சமூகங்களின் மரபணு நுணுக்கங்களை அவிழ்ப்பதற்கான ஒரு முக்கிய கருவியாக மெட்டஜெனோமிக் சீக்வென்சிங் உள்ளது, இந்த சிக்கலான சுற்றுச்சூழல் அமைப்புகளுக்குள் மரபியல் மற்றும் சூழலியலுக்கு இடையிலான பன்முக உறவுகளை விளக்குகிறது.
இயங்குதளங்கள்: Illumina NovaSeq மற்றும் DNBSEQ-T7
-
மெட்டஜெனோமிக் சீக்வென்சிங்-டிஜிஎஸ்
ஒரு மெட்டஜெனோம் என்பது சுற்றுச்சூழல் மற்றும் மனித மெட்டஜெனோம்கள் போன்ற உயிரினங்களின் கலப்பு சமூகத்தின் மரபணுப் பொருட்களின் தொகுப்பாகும். இது பயிரிடக்கூடிய மற்றும் பயிரிட முடியாத நுண்ணுயிரிகளின் மரபணுக்களைக் கொண்டுள்ளது. மெட்டாஜெனோமிக் சீக்வென்சிங், வகைபிரித்தல் விவரக்குறிப்பை விட அதிகமானவற்றை வழங்குவதன் மூலம் சூழலியல் மாதிரிகளில் உட்பொதிக்கப்பட்ட இந்த சிக்கலான மரபணு நிலப்பரப்புகளை ஆய்வு செய்ய உதவுகிறது. குறியிடப்பட்ட மரபணுக்கள் மற்றும் சுற்றுச்சூழல் செயல்முறைகளில் அவற்றின் தூண்டுதல் பாத்திரங்களை ஆராய்வதன் மூலம் இது செயல்பாட்டு மரபியல் முன்னோக்கை வழங்குகிறது. இலுமினா வரிசைமுறையுடன் கூடிய பாரம்பரிய ஷாட்கன் அணுகுமுறைகள் மெட்டஜெனோமிக் ஆய்வுகளில் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்பட்டாலும், நானோபோர் மற்றும் பேக்பியோ லாங்-ரீட் சீக்வென்சிங்கின் வருகை களத்தை மாற்றியுள்ளது. நானோபோர் மற்றும் பேக்பியோ தொழில்நுட்பம் கீழ்நிலை பயோ-இன்ஃபர்மேடிக் பகுப்பாய்வுகளை மேம்படுத்துகிறது, குறிப்பாக மெட்டஜெனோம் அசெம்பிளி, மேலும் தொடர்ச்சியான கூட்டங்களை உறுதி செய்கிறது. நானோபூர் அடிப்படையிலான மற்றும் பேக்பயோ அடிப்படையிலான மெட்டஜெனோமிக்ஸ் சிக்கலான நுண்ணுயிரிகளிலிருந்து முழுமையான மற்றும் மூடிய பாக்டீரியா மரபணுக்களை வெற்றிகரமாக உருவாக்கியுள்ளது என்று அறிக்கைகள் குறிப்பிடுகின்றன (பாசி, EL, மற்றும் பலர்., நேச்சர் பயோடெக், 2020). இலுமினா ரீட்களுடன் நானோபோர் வாசிப்புகளை ஒருங்கிணைப்பது பிழை திருத்தத்திற்கான ஒரு மூலோபாய அணுகுமுறையை வழங்குகிறது, நானோபோரின் உள்ளார்ந்த குறைந்த துல்லியத்தை குறைக்கிறது. இந்த சினெர்ஜிஸ்டிக் கலவையானது ஒவ்வொரு சீக்வென்சிங் தளத்தின் பலத்தையும் மேம்படுத்துகிறது, சாத்தியமான வரம்புகளை கடக்க ஒரு வலுவான தீர்வை வழங்குகிறது மற்றும் மெட்டஜெனோமிக் பகுப்பாய்வுகளின் துல்லியம் மற்றும் நம்பகத்தன்மையை மேம்படுத்துகிறது.
இயங்குதளம்: நானோபூர் ப்ரோமேதியான் 48, இல்லுமியா மற்றும் பேக்பியோ ரெவியோ
-
16S/18S/ITS ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங்-PacBio
16S மற்றும் 18S ஆர்ஆர்என்ஏ மரபணுக்கள், இன்டர்னல் டிரான்ஸ்கிரிப்டு ஸ்பேசர் (ஐடிஎஸ்) பகுதியுடன் இணைந்து, அவை மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்ட மற்றும் மிகை-மாறும் பகுதிகளின் கலவையின் காரணமாக முக்கிய மூலக்கூறு கைரேகை குறிப்பான்களாக செயல்படுகின்றன. இந்தப் பகுதிகளின் பெருக்கம் மற்றும் வரிசைப்படுத்துதல் பல்வேறு சுற்றுச்சூழல் அமைப்புகளில் நுண்ணுயிர் கலவை மற்றும் பன்முகத்தன்மையை ஆராய்வதற்கான தனிமைப்படுத்தப்படாத அணுகுமுறையை வழங்குகிறது. இல்லுமினா சீக்வென்சிங் பொதுவாக 16S மற்றும் ITS1 இன் V3-V4 போன்ற குறுகிய ஹைபர்வேரியபிள் பகுதிகளை குறிவைக்கும் போது, 16S, 18S மற்றும் ITS இன் முழு நீளத்தையும் வரிசைப்படுத்துவதன் மூலம் உயர்ந்த வகைபிரித்தல் சிறுகுறிப்பு அடையக்கூடியது என்பது நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளது. இந்த விரிவான அணுகுமுறை துல்லியமாக வகைப்படுத்தப்பட்ட வரிசைகளின் அதிக சதவீதத்தை விளைவிக்கிறது, இனங்கள் அடையாளம் காணும் வரையிலான தீர்மானத்தின் அளவை அடைகிறது. PacBio இன் ஒற்றை-மூலக்கூறு நிகழ்நேர (SMRT) வரிசைமுறை இயங்குதளமானது, இலுமினா வரிசைமுறையின் துல்லியத்திற்குப் போட்டியாக, முழு நீள ஆம்பிளிகான்களை உள்ளடக்கிய மிகத் துல்லியமான நீண்ட வாசிப்புகளை (HiFi) வழங்குவதன் மூலம் தனித்து நிற்கிறது. இந்த திறன் ஆராய்ச்சியாளர்களை ஒப்பிடமுடியாத நன்மையை அடைய அனுமதிக்கிறது - மரபணு நிலப்பரப்பின் பரந்த பார்வை. நீட்டிக்கப்பட்ட கவரேஜ் இனங்கள் சிறுகுறிப்பில், குறிப்பாக பாக்டீரியா அல்லது பூஞ்சை சமூகங்களுக்குள் உள்ள தீர்மானத்தை கணிசமாக உயர்த்துகிறது, இது நுண்ணுயிர் மக்கள்தொகையின் நுணுக்கங்களை ஆழமாகப் புரிந்துகொள்ள உதவுகிறது.
-
16S/18S/ITS ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங்-NGS
குறிப்பாக 16S, 18S மற்றும் ITS மரபணு குறிப்பான்களை இலக்காகக் கொண்ட இல்லுமினா தொழில்நுட்பத்துடன் ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங், நுண்ணுயிர் சமூகங்களுக்குள் உள்ள பைலோஜெனி, வகைபிரித்தல் மற்றும் இனங்கள் ஏராளமாக இருப்பதை அவிழ்ப்பதற்கான ஒரு சக்திவாய்ந்த முறையாகும். இந்த அணுகுமுறை வீட்டு பராமரிப்பு மரபணு குறிப்பான்களின் மிகை மாறக்கூடிய பகுதிகளை வரிசைப்படுத்துவதை உள்ளடக்கியது. முதலில் மூலக்கூறு கைரேகையாக அறிமுகப்படுத்தப்பட்டதுவோசஸ் மற்றும் பலர்1977 இல், இந்த நுட்பம் தனிமைப்படுத்தப்படாத பகுப்பாய்வுகளை இயக்குவதன் மூலம் நுண்ணுயிர் விவரக்குறிப்பில் புரட்சியை ஏற்படுத்தியது. 16S (பாக்டீரியா), 18S (பூஞ்சைகள்) மற்றும் இன்டர்னல் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் ஸ்பேசர் (ITS, பூஞ்சை) ஆகியவற்றின் வரிசைமுறை மூலம், ஆராய்ச்சியாளர்கள் ஏராளமான உயிரினங்களை மட்டுமல்ல, அரிதான மற்றும் அடையாளம் காணப்படாத உயிரினங்களையும் அடையாளம் காண முடியும். ஒரு முக்கிய கருவியாக பரவலாக ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்டது, மனித வாய், குடல், மலம் மற்றும் அதற்கு அப்பால் உள்ள பல்வேறு சூழல்களில் வேறுபட்ட நுண்ணுயிர் கலவைகளைக் கண்டறிவதில் ஆம்ப்ளிகான் வரிசைமுறை கருவியாக உள்ளது.
-
பாக்டீரியா மற்றும் பூஞ்சை முழு ஜீனோம் மறு வரிசைமுறை
நுண்ணுயிர் மரபணுக்களின் நிறைவு மற்றும் ஒப்பீட்டை செயல்படுத்துவதன் மூலம் நுண்ணுயிர் மரபியலை முன்னேற்றுவதற்கு பாக்டீரியா மற்றும் பூஞ்சை முழு-மரபணு மறு வரிசைப்படுத்துதல் திட்டங்கள் முக்கியமாகும். இது நொதித்தல் பொறியியல், தொழில்துறை செயல்முறைகளை மேம்படுத்துதல் மற்றும் இரண்டாம் நிலை வளர்சிதை மாற்ற பாதைகளை ஆராய்தல் ஆகியவற்றை எளிதாக்குகிறது. மேலும், மருத்துவம், விவசாயம் மற்றும் சுற்றுச்சூழல் அறிவியல் ஆகியவற்றில் பரந்த தாக்கங்களுடன், சுற்றுச்சூழல் தழுவலைப் புரிந்துகொள்வதற்கும், விகாரங்களை மேம்படுத்துவதற்கும், மரபணு பரிணாம இயக்கவியலை வெளிப்படுத்துவதற்கும் பூஞ்சை மற்றும் பாக்டீரியா மறு வரிசைமுறை மிகவும் முக்கியமானது.
-
புரோகாரியோடிக் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை
ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையானது குறிப்பிட்ட நிபந்தனைகளின் கீழ் செல்களுக்குள் உள்ள அனைத்து ஆர்என்ஏ டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளின் விரிவான விவரக்குறிப்பை மேம்படுத்துகிறது. இந்த அதிநவீன தொழில்நுட்பம் ஒரு சக்திவாய்ந்த கருவியாக செயல்படுகிறது, சிக்கலான மரபணு வெளிப்பாடு சுயவிவரங்கள், மரபணு கட்டமைப்புகள் மற்றும் பல்வேறு உயிரியல் செயல்முறைகளுடன் தொடர்புடைய மூலக்கூறு வழிமுறைகளை வெளிப்படுத்துகிறது. அடிப்படை ஆராய்ச்சி, மருத்துவ நோயறிதல் மற்றும் மருந்து மேம்பாடு ஆகியவற்றில் பரவலாக ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்ட ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையானது செல்லுலார் இயக்கவியல் மற்றும் மரபணு ஒழுங்குமுறையின் நுணுக்கங்களைப் பற்றிய நுண்ணறிவுகளை வழங்குகிறது. எங்களின் புரோகாரியோடிக் ஆர்என்ஏ மாதிரி செயலாக்கமானது புரோகாரியோடிக் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்களுக்கு ஏற்ப வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது, இதில் ஆர்ஆர்என்ஏ குறைப்பு மற்றும் திசை நூலக தயாரிப்பு ஆகியவை அடங்கும்.
இயங்குதளம்: இல்லுமினா நோவாசெக்
-
மெட்டாட்ரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை
இல்லுமினா சீக்வென்சிங் தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்தி, BMKGENE இன் மெட்டாட்ரான்ஸ்கிரிப்டோம் சீக்வென்சிங் சேவையானது, மண், நீர், கடல், மலம் மற்றும் குடல் போன்ற இயற்கைச் சூழல்களுக்குள், புரோகாரியோட்டுகள் மற்றும் வைரஸ்கள் வரை பரவி, பலவிதமான நுண்ணுயிரிகளின் மாறும் மரபணு வெளிப்பாட்டை வெளிப்படுத்துகிறது. எங்கள் விரிவான சேவையானது சிக்கலான நுண்ணுயிர் சமூகங்களின் முழுமையான மரபணு வெளிப்பாடு சுயவிவரங்களை ஆராய ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு அதிகாரம் அளிக்கிறது. வகைபிரித்தல் பகுப்பாய்விற்கு அப்பால், எங்களின் மெட்டாட்ரான்ஸ்கிரிப்டோம் சீக்வென்சிங் சேவையானது செயல்பாட்டு செறிவூட்டலுக்கு ஆராய்வதற்கு உதவுகிறது, வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்கள் மற்றும் அவற்றின் பாத்திரங்கள் மீது வெளிச்சம் போடுகிறது. இந்த மாறுபட்ட சுற்றுச்சூழல் இடங்களுக்குள் மரபணு வெளிப்பாடு, வகைபிரித்தல் பன்முகத்தன்மை மற்றும் செயல்பாட்டு இயக்கவியல் ஆகியவற்றின் சிக்கலான நிலப்பரப்புகளுக்கு நீங்கள் செல்லும்போது உயிரியல் நுண்ணறிவுகளின் செல்வத்தைக் கண்டறியவும்.
-
டி நோவோ ஃபங்கல் ஜீனோம் அசெம்பிளி
BMKGENE பூஞ்சை மரபணுக்களுக்கான பல்துறை தீர்வுகளை வழங்குகிறது, பல்வேறு ஆராய்ச்சி தேவைகள் மற்றும் விரும்பிய மரபணு முழுமை ஆகியவற்றை வழங்குகிறது. குறுகிய வாசிப்பு இல்லுமினா வரிசைமுறையைப் பயன்படுத்துவது வரைவு மரபணுவை உருவாக்க அனுமதிக்கிறது. நானோபோர் அல்லது பேக்பியோவைப் பயன்படுத்தி குறுகிய-வாசிப்புகள் மற்றும் நீண்ட வாசிப்பு வரிசைமுறை ஆகியவை நீண்ட கான்டிஜ்களுடன் மிகவும் சுத்திகரிக்கப்பட்ட பூஞ்சை மரபணுவிற்கு இணைக்கப்படுகின்றன. மேலும், ஹை-சி வரிசைமுறையை ஒருங்கிணைப்பது திறன்களை மேலும் மேம்படுத்துகிறது, இது ஒரு முழுமையான குரோமோசோம்-நிலை மரபணுவை அடைய உதவுகிறது.
-
டி நோவோ பாக்டீரியா ஜீனோம் அசெம்பிளி
0 இடைவெளிகளுக்கு உத்தரவாதம் அளிக்கும் முழுமையான பாக்டீரியல் ஜீனோம் அசெம்பிளி சேவையை நாங்கள் வழங்குகிறோம். நானோபோர் மற்றும் பேக்பியோ போன்ற நீண்ட வாசிப்பு வரிசைமுறை தொழில்நுட்பங்களை ஒருங்கிணைப்பதன் மூலம் இது சாத்தியமாகும். எங்கள் சேவையானது, குறிப்பிட்ட ஆராய்ச்சி இலக்குகளை நிறைவேற்றும், அசெம்பிளி, செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் மேம்பட்ட உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றிலிருந்து முழுமையான உயிர் தகவலியல் பணிப்பாய்வுகளை வழங்குகிறது. இந்த சேவையானது பல்வேறு மரபணு மற்றும் மரபணு ஆய்வுகளுக்கான துல்லியமான குறிப்பு மரபணுக்களை உருவாக்க உதவுகிறது. கூடுதலாக, இது ஸ்ட்ரெய்ன் ஆப்டிமைசேஷன், மரபணு பொறியியல் மற்றும் நுண்ணுயிர் தொழில்நுட்ப மேம்பாடு போன்ற பயன்பாடுகளுக்கு அடிப்படையாக அமைகிறது, அறிவியல் நுண்ணறிவு மற்றும் உயிரி தொழில்நுட்ப கண்டுபிடிப்புகளை முன்னேற்றுவதற்கு முக்கியமான நம்பகமான மற்றும் இடைவெளி இல்லாத மரபணு தரவுகளை உறுதி செய்கிறது.
