குறிப்பு அடிப்படையற்ற mRNA வரிசைமுறைப்படுத்தல்-NGS
அம்சங்கள்
● லைப்ரரி தயாரிப்பிற்கு முன் பாலி mRNA-ஐப் பிடித்தல்
● எந்தவொரு குறிப்பு மரபணுத்தொகுதியையும் சாராமல்: படியெடுப்புகளின் டி நோவோ தொகுப்பின் அடிப்படையில், பல தரவுத்தளங்களைக் (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG) கொண்டு விளக்கக்குறிப்பிடப்பட்ட யூனிஜீன்களின் பட்டியலை உருவாக்குகிறது.
● மரபணு வெளிப்பாடு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் கட்டமைப்பின் விரிவான பயோஇன்ஃபார்மேடிக் பகுப்பாய்வு
சேவை நன்மைகள்
●விரிவான நிபுணத்துவம்BMKGENE-இல், செல் வளர்ப்புகள், திசுக்கள் மற்றும் உடல் திரவங்கள் போன்ற பல்வேறு மாதிரி வகைகளை உள்ளடக்கிய 600,000-க்கும் மேற்பட்ட மாதிரிகளைச் செயலாக்கிய அனுபவத்துடன், எங்கள் குழு ஒவ்வொரு திட்டத்திற்கும் மிகுந்த அனுபவத்தைக் கொண்டுவருகிறது. நாங்கள் பல்வேறு ஆராய்ச்சித் துறைகளில் 100,000-க்கும் மேற்பட்ட mRNA-Seq திட்டங்களை வெற்றிகரமாக முடித்துள்ளோம்.
●கடுமையான தரக் கட்டுப்பாடுமாதிரி மற்றும் லைப்ரரி தயாரிப்பு முதல் சீக்வென்சிங் மற்றும் பயோஇன்ஃபர்மேட்டிக்ஸ் வரை அனைத்து நிலைகளிலும் நாங்கள் முக்கிய கட்டுப்பாட்டுப் புள்ளிகளைச் செயல்படுத்துகிறோம். இந்த நுணுக்கமான கண்காணிப்பு, தொடர்ச்சியாக உயர்தரமான முடிவுகள் வழங்கப்படுவதை உறுதி செய்கிறது.
● விரிவான குறிப்புரைடிரான்ஸ்கிரிப்டோம் மறுமொழிக்கு அடிப்படையாக உள்ள செல்லுலார் மற்றும் மூலக்கூறு செயல்முறைகள் குறித்த நுண்ணறிவுகளை வழங்கும் வகையில், வேறுபட்ட முறையில் வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்களை (DEGs) செயல்பாட்டு ரீதியாகக் குறிப்பதற்கும், அதற்கேற்ற செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வை மேற்கொள்வதற்கும் நாங்கள் பல தரவுத்தளங்களைப் பயன்படுத்துகிறோம்.
●விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவுதிட்டம் நிறைவடைந்த பிறகும், 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன் எங்கள் அர்ப்பணிப்பு தொடர்கிறது. இந்தக் காலகட்டத்தில், திட்டத்தின் தொடர் கண்காணிப்பு, பழுது நீக்கும் உதவி மற்றும் முடிவுகள் தொடர்பான எந்தவொரு கேள்விகளுக்கும் பதிலளிக்கும் கேள்வி-பதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
மாதிரி தேவை மற்றும் விநியோகம்
| நூலகம் | வரிசைப்படுத்தும் உத்தி | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு | தரக் கட்டுப்பாடு |
| பாலி ஏ செறிவூட்டப்பட்ட | இல்லுமினா PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 ஜிபி | Q30≥85% |
மாதிரித் தேவைகள்:
நியூக்ளியோடைடுகள்:
| செறிவு (ng/μl) | அளவு (மைக்ரோகிராம்) | தூய்மை | நேர்மை |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ஜெல் மீது புரதம் அல்லது டிஎன்ஏ கலப்படம் குறைவாகவோ அல்லது இல்லாமலோ இருப்பது தெரிகிறது. | தாவரங்களுக்கு: RIN≥4.0; விலங்குகளுக்கு: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; குறைந்த அல்லது அடிப்படை உயர்வு இல்லை |
● தாவரங்கள்:
வேர், தண்டு அல்லது இதழ்: 450 மி.கி.
இலை அல்லது விதை: 300 மி.கி.
பழம்: 1.2 கிராம்
● விலங்கு:
இதயம் அல்லது குடல்: 300 மி.கி.
உள்ளுறுப்புகள் அல்லது மூளை: 240 மி.கி.
தசை: 450 மி.கி.
எலும்புகள், முடி அல்லது தோல்: 1 கிராம்
● கணுக்காலிகள்:
பூச்சிகள்: 6 கிராம்
க்ரஸ்டேசியா: 300 மி.கி.
● முழு இரத்தம்: 1 குழாய்
● செல்கள்: 106 செல்கள்
பரிந்துரைக்கப்பட்ட மாதிரி விநியோகம்
கலன்: 2 மில்லி சென்ட்ரிஃபியூஜ் குழாய் (தகரத் தகடு பரிந்துரைக்கப்படவில்லை)
மாதிரி குறியிடல்: குழு+பிரதி, எ.கா. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
சரக்கு அனுப்புதல்:
1. உலர் பனிக்கட்டி: மாதிரிகளைப் பைகளில் அடைத்து, உலர் பனிக்கட்டியில் புதைக்க வேண்டும்.
2. ஆர்.என்.ஏ ஸ்டேபிள் குழாய்கள்: ஆர்.என்.ஏ மாதிரிகளை, ஆர்.என்.ஏ நிலைப்படுத்தும் குழாயில் (எ.கா. ஆர்.என்.ஏ ஸ்டேபிள்®) உலர்த்தி, அறை வெப்பநிலையில் அனுப்பலாம்.
சேவை பணிப்பாய்வு
பரிசோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
ஆர்.என்.ஏ பிரித்தெடுத்தல்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
உயிரித் தகவல் அறிவியல்
டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் தொகுப்பு மற்றும் யூனிஜீன் தேர்வு
யூனிஜெனின் குறிப்புரை
மாதிரி தொடர்பு மற்றும் உயிரியல் பிரதிகளின் மதிப்பீடு
மாறுபட்ட முறையில் வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்கள் (DEGs)
வேறுபட்ட வெளிப்பாட்டு மரபணுக்களின் (DEGs) செயல்பாட்டு விளக்கக்குறிப்பு
வேறுபட்ட வெளிப்பாட்டு மரபணுக்களின் (DEGs) செயல்பாட்டு செறிவூட்டல்
BMKGene-இன் யூகேரியோடிக் NGS mRNA வரிசைப்படுத்தல் சேவைகளால் சாத்தியமாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை, கவனமாகத் தொகுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் ஆராய்ந்து பாருங்கள்.
ஷென், எஃப். மற்றும் பலர். (2020) 'அமூர் கெளுத்தி மீனின் (Silurus asotus) இனப்பெருக்க உறுப்புகளில் டி நோவோ டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் அசெம்பிளி மற்றும் பாலின சார்புடைய மரபணு வெளிப்பாடு', ஜீனோமிக்ஸ், 112(3), பக். 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
ஜாங், சி. மற்றும் பலர். (2016) 'வெங்காயத்தில் (Allium cepa L.) கிழங்கு வீக்கம் மற்றும் வளர்ச்சியின் போது சுக்ரோஸ் வளர்சிதை மாற்றத்தின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு', ஃபிரான்டியர்ஸ் இன் பிளான்ட் சயின்ஸ், 7(செப்டம்பர்), ப. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
ஜு, சி. மற்றும் பலர். (2017) 'சர்கோசெய்லிச்திஸ் சினென்சிஸின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிற்கான டி நோவோ அசெம்பிளி, பண்புக்கூறு மற்றும் குறிப்புரை', பிஎல்ஓஎஸ் ஒன், 12(2). டோய்: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
ஸோ, எல். மற்றும் பலர். (2021) 'உப்புத்தன்மை அழுத்தத்தின் கீழ் போடோகார்பஸ் மேக்ரோஃபில்லஸின் உப்பு சகிப்புத்தன்மை பற்றிய நுண்ணறிவுகளை டி நோவோ டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு வழங்குகிறது', பிஎம்சி தாவர உயிரியல், 21(1), பக். 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
