குறிப்பு அல்லாத mRNA வரிசைமுறை-NGS
அம்சங்கள்
● நூலக தயாரிப்புக்கு முன் பாலி mRNA-வைப் பிடிக்கவும்.
● எந்த குறிப்பு மரபணுவையும் சாராதது: டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளின் புதிய அசெம்பிளியை அடிப்படையாகக் கொண்டு, பல தரவுத்தளங்களுடன் (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG) குறிப்பு எழுதப்பட்ட யூனிஜீன்களின் பட்டியலை உருவாக்குகிறது.
● மரபணு வெளிப்பாடு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் கட்டமைப்பின் விரிவான உயிரித் தகவல் பகுப்பாய்வு.
சேவை நன்மைகள்
●விரிவான நிபுணத்துவம்: BMKGENE இல் 600,000 க்கும் மேற்பட்ட மாதிரிகளைச் செயலாக்கிய சாதனைப் பதிவோடு, செல் கலாச்சாரங்கள், திசுக்கள் மற்றும் உடல் திரவங்கள் போன்ற பல்வேறு மாதிரி வகைகளை உள்ளடக்கிய எங்கள் குழு, ஒவ்வொரு திட்டத்திற்கும் ஏராளமான அனுபவத்தைக் கொண்டுவருகிறது. பல்வேறு ஆராய்ச்சி களங்களில் 100,000 க்கும் மேற்பட்ட mRNA-Seq திட்டங்களை நாங்கள் வெற்றிகரமாக முடித்துள்ளோம்.
●கடுமையான தரக் கட்டுப்பாடு: மாதிரி மற்றும் நூலக தயாரிப்பு முதல் வரிசைமுறை மற்றும் உயிர் தகவலியல் வரை அனைத்து நிலைகளிலும் முக்கிய கட்டுப்பாட்டு புள்ளிகளை நாங்கள் செயல்படுத்துகிறோம். இந்த நுணுக்கமான கண்காணிப்பு தொடர்ந்து உயர்தர முடிவுகளை வழங்குவதை உறுதி செய்கிறது.
● விரிவான குறிப்பு: வேறுபட்ட முறையில் வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்களை (DEGs) செயல்பாட்டு ரீதியாகக் குறிப்பிடவும், அதனுடன் தொடர்புடைய செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வைச் செய்யவும், டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பதிலின் அடிப்படையிலான செல்லுலார் மற்றும் மூலக்கூறு செயல்முறைகள் குறித்த நுண்ணறிவுகளை வழங்கவும் பல தரவுத்தளங்களைப் பயன்படுத்துகிறோம்.
●விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவு: எங்கள் உறுதிப்பாடு 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவை காலத்துடன் திட்ட நிறைவுக்கு அப்பால் நீண்டுள்ளது. இந்த நேரத்தில், முடிவுகள் தொடர்பான ஏதேனும் கேள்விகளுக்கு தீர்வு காண திட்ட பின்தொடர்தல், சரிசெய்தல் உதவி மற்றும் கேள்வி பதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
மாதிரி தேவைகள் மற்றும் விநியோகம்
| நூலகம் | வரிசைமுறை உத்தி | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு | தரக் கட்டுப்பாடு |
| பாலி ஏ செறிவூட்டப்பட்டது | இல்லுமினா PE150 டிஎன்பிஎஸ்இக்யூ-டி7 | 6-10 ஜிபி | கே30≥85% |
மாதிரி தேவைகள்:
நியூக்ளியோடைடுகள்:
| சுருக்கம் (ng/μl) | அளவு (μg) | தூய்மை | நேர்மை |
| ≥ 10 ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ஜெல்லில் காட்டப்பட்டுள்ள புரதம் அல்லது டிஎன்ஏ மாசுபாடு குறைவாக உள்ளது அல்லது இல்லை. | தாவரங்களுக்கு: RIN≥4.0; விலங்குகளுக்கு: RIN≥4.5; 5.0≥28எஸ்/18எஸ்≥1.0; அடிப்படை உயரம் குறைவாகவோ அல்லது இல்லாமலோ உள்ளது |
● தாவரங்கள்:
வேர், தண்டு அல்லது இதழ்: 450 மி.கி.
இலை அல்லது விதை: 300 மி.கி.
பழம்: 1.2 கிராம்
● விலங்கு:
இதயம் அல்லது குடல்: 300 மி.கி.
உள்ளுறுப்பு அல்லது மூளை: 240 மி.கி.
தசை: 450 மி.கி.
எலும்புகள், முடி அல்லது தோல்: 1 கிராம்
● கணுக்காலிகள்:
பூச்சிகள்: 6 கிராம்
க்ரஸ்டேசியா: 300 மி.கி.
● முழு இரத்தம்: 1 குழாய்
● செல்கள்: 106 செல்கள்
பரிந்துரைக்கப்பட்ட மாதிரி விநியோகம்
கொள்கலன்: 2 மில்லி மையவிலக்கு குழாய் (டின் ஃபாயில் பரிந்துரைக்கப்படவில்லை)
மாதிரி லேபிளிங்: குழு+பிரதி எ.கா. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
ஏற்றுமதி:
1. உலர் பனிக்கட்டி: மாதிரிகளை பைகளில் அடைத்து உலர் பனிக்கட்டிக்குள் புதைக்க வேண்டும்.
2. RNA நிலைப்படுத்தக்கூடிய குழாய்கள்: RNA மாதிரிகளை RNA நிலைப்படுத்தக்கூடிய குழாயில் (எ.கா. RNA நிலைப்படுத்தக்கூடிய®) உலர்த்தி அறை வெப்பநிலையில் அனுப்பலாம்.
சேவை பணி ஓட்டம்
பரிசோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
ஆர்.என்.ஏ பிரித்தெடுத்தல்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
உயிர் தகவலியல்
டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் அசெம்பிளி மற்றும் யூனிஜீன் தேர்வு
யூனிஜீன் குறிப்பு
உயிரியல் பிரதிகளின் மாதிரி தொடர்பு மற்றும் மதிப்பீடு
வேறுபட்ட முறையில் வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்கள் (DEGகள்)
DEG களின் செயல்பாட்டு குறிப்பு
DEG களின் செயல்பாட்டு செறிவூட்டல்
BMKGene இன் யூகாரியோடிக் NGS mRNA வரிசைமுறை சேவைகள் மூலம் எளிதாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை, தொகுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பு மூலம் ஆராயுங்கள்.
ஷென், எஃப். மற்றும் பலர் (2020) 'அமுர் கேட்ஃபிஷின் (சிலுரஸ் அசோடஸ்) பிறப்புறுப்புக் குழாய்களில் டி நோவோ டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் அசெம்பிளி மற்றும் பாலின-சார்புடைய மரபணு வெளிப்பாடு', ஜெனோமிக்ஸ், 112(3), பக். 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
ஜாங், சி. மற்றும் பலர். (2016) 'வெங்காயத்தில் குமிழ் வீக்கம் மற்றும் வளர்ச்சியின் போது சுக்ரோஸ் வளர்சிதை மாற்றத்தின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு (அல்லியம் செபா எல்.)', தாவர அறிவியலில் எல்லைகள், 7(செப்டம்பர்), ப. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
Zhu, C. et al. (2017) 'சர்கோசிலிக்திஸ் சினென்சிஸின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிற்கான புதிய அசெம்பிளி, குணாதிசயம் மற்றும் குறிப்பு', PLoS ONE, 12(2). doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
ஜூ, எல். மற்றும் பலர். (2021) 'உப்புத்தன்மை அழுத்தத்தின் கீழ் போடோகார்பஸ் மேக்ரோஃபில்லஸின் உப்பு சகிப்புத்தன்மை பற்றிய நுண்ணறிவுகளை டி நோவோ டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு வழங்குகிறது', பிஎம்சி தாவர உயிரியல், 21(1), பக். 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
