-
ஜீனோம்-வைட் அசோசியேஷன் பகுப்பாய்வு
ஜீனோம்-வைட் அசோசியேஷன் ஸ்டடி (GWAS) குறிப்பிட்ட பண்புகளுடன் (பினோடைப்) தொடர்புடைய மரபணு மாறுபாடுகளை (மரபணு வகை) அடையாளம் காண்பதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது.GWAS ஆய்வு மரபணு குறிப்பான்கள் அதிக எண்ணிக்கையிலான தனிநபர்களின் முழு மரபணுவையும் ஆராய்கிறது மற்றும் மக்கள்தொகை மட்டத்தில் புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வு மூலம் மரபணு வகை-பினோடைப் சங்கங்களை முன்னறிவிக்கிறது.மனித நோய்கள் மற்றும் விலங்குகள் அல்லது தாவரங்களின் சிக்கலான குணநலன்கள் மீதான செயல்பாட்டு மரபணுச் சுரங்கம் பற்றிய ஆராய்ச்சியில் இது பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது.
-
சிங்கிள் நியூக்ளியஸ் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை
ஒற்றை செல் பிடிப்பு மற்றும் தனிப்பட்ட நூலக கட்டுமான நுட்பத்தின் முன்னேற்றம், உயர்-செயல் வரிசைமுறையுடன் இணைந்து செல்-மூலம்-செல் அடிப்படையில் மரபணு வெளிப்பாடு ஆய்வுகளை அனுமதிக்கிறது.இது சிக்கலான செல் மக்கள்தொகையில் ஆழமான மற்றும் முழுமையான கணினி பகுப்பாய்வை செயல்படுத்துகிறது, இதில் அனைத்து செல்களின் சராசரியை எடுத்துக்கொள்வதன் மூலம் அவற்றின் பன்முகத்தன்மையை மறைப்பதை இது பெரும்பாலும் தவிர்க்கிறது.
இருப்பினும், சில செல்கள் ஒற்றை செல் இடைநிறுத்தம் செய்யப்படுவதற்கு ஏற்றதாக இல்லை, எனவே மற்ற மாதிரி தயாரிப்பு முறைகள் தேவை - திசுக்களில் இருந்து அணுக்கரு பிரித்தெடுத்தல், அதாவது, அணுக்கரு நேரடியாக திசுக்கள் அல்லது கலத்திலிருந்து பிரித்தெடுக்கப்பட்டு ஒற்றை-கரு இடைநீக்கமாக தயாரிக்கப்படுகிறது. செல் வரிசைமுறை.
BMK 10× Genomics Chromium TM அடிப்படையிலான ஒற்றை செல் RNA வரிசைமுறை சேவையை வழங்குகிறது.நோயெதிர்ப்பு உயிரணு வேறுபாடு, கட்டி பன்முகத்தன்மை, திசு வளர்ச்சி போன்ற நோய் தொடர்பான ஆய்வுகளில் இந்த சேவை பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது.
ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சிப்: 10× ஜீனோமிக்ஸ்
இயங்குதளம்: இல்லுமினா நோவாசெக் இயங்குதளம்
-
தாவர/விலங்கு முழு ஜீனோம் வரிசைமுறை
முழு மரபணு மறு வரிசைமுறை, WGS என்றும் அழைக்கப்படுகிறது, இது ஒற்றை நியூக்ளியோடைடு பாலிமார்பிசம் (SNP), செருகல் நீக்கம் (InDel), கட்டமைப்பு மாறுபாடு (SV) மற்றும் நகல் எண் மாறுபாடு (CNV) உட்பட முழு மரபணுவின் பொதுவான மற்றும் அரிதான பிறழ்வுகளை வெளிப்படுத்த உதவுகிறது. )SV க்கள் SNP களை விட மாறுபாட்டின் ஒரு பெரிய பகுதியை உருவாக்குகின்றன மற்றும் மரபணுவில் அதிக தாக்கத்தை ஏற்படுத்துகின்றன, இது உயிரினங்களில் குறிப்பிடத்தக்க தாக்கத்தை ஏற்படுத்துகிறது.நீண்ட வாசிப்பு ஒத்திசைவு பெரிய துண்டுகள் மற்றும் சிக்கலான மாறுபாடுகளை மிகவும் துல்லியமாக அடையாளம் காண அனுமதிக்கிறது, ஏனெனில் நீண்ட வாசிப்புகள் சிக்கலான பகுதிகளான டேன்டெம் ரிபீட்ஸ், ஜிசி/ஏடி நிறைந்த பகுதிகள் மற்றும் ஹைப்பர்-வேரியபிள் பகுதிகள் மூலம் குரோமோசோமால் கிராஸிங்கை மிகவும் எளிதாக்குகிறது.
இயங்குதளம்: இல்லுமினா, பேக்பியோ, நானோபூர்
-
BMKMANU S1000 ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்
நோயெதிர்ப்பு ஊடுருவல், கரு வளர்ச்சி போன்ற பல்வேறு உயிரியல் செயல்முறைகளில் உயிரணுக்களின் இடஞ்சார்ந்த அமைப்பு முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது. இடஞ்சார்ந்த டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை, இடஞ்சார்ந்த நிலை பற்றிய தகவலைத் தக்கவைத்துக்கொள்வதன் மூலம் மரபணு வெளிப்பாடு விவரக்குறிப்பைக் குறிக்கிறது, டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்-நிலை திசு கட்டமைப்பில் சிறந்த நுண்ணறிவுகளை வழங்குகிறது.தொழில்நுட்பத்தின் வளர்ச்சியுடன், அதி-தெளிவான திசு உருவவியல் மற்றும் இடஞ்சார்ந்த மூலக்கூறு வெளிப்பாட்டின் உண்மையான கட்டமைப்பு வேறுபாடு ஆகியவை உயர் தெளிவுத்திறனுடன் ஆய்வு செய்யப்பட வேண்டும்.BMKGENE ஆனது மாதிரிகள் முதல் உயிரியல் நுண்ணறிவு வரை விரிவான, ஒரு-நிறுத்த இடஞ்சார்ந்த டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை சேவையை வழங்குகிறது.
ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் தொழில்நுட்பங்கள், மரபணு வெளிப்பாடு சுயவிவரத்தை பன்முக மாதிரிகளில் இடஞ்சார்ந்த உள்ளடக்கத்துடன் தீர்ப்பதன் மூலம் பல்வேறு ஆராய்ச்சி அரங்கில் புதிய முன்னோக்குகளை மேம்படுத்தியது.
ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சிப்: BMKMANU S1000
இயங்குதளம்: இல்லுமினா நோவாசெக் இயங்குதளம்
-
10x ஜெனோமிக்ஸ் விசியம் ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்
விசியம் ஸ்பேஷியல் ஜீன் எக்ஸ்பிரஷன் என்பது மொத்த எம்ஆர்என்ஏ அடிப்படையில் திசுக்களை வகைப்படுத்துவதற்கான ஒரு முக்கிய இடஞ்சார்ந்த டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை தொழில்நுட்பமாகும்.இயல்பான வளர்ச்சி, நோய் நோயியல் மற்றும் மருத்துவ மொழிபெயர்ப்பு ஆராய்ச்சி பற்றிய புதிய நுண்ணறிவுகளைக் கண்டறிய, முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோமையும் உருவவியல் சூழலுடன் வரைபடமாக்குங்கள்.BMKGENE ஆனது மாதிரிகள் முதல் உயிரியல் நுண்ணறிவு வரை விரிவான, ஒரு-நிறுத்த இடஞ்சார்ந்த டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை சேவையை வழங்குகிறது.
ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் தொழில்நுட்பங்கள், மரபணு வெளிப்பாடு சுயவிவரத்தை பன்முக மாதிரிகளில் இடஞ்சார்ந்த உள்ளடக்கத்துடன் தீர்ப்பதன் மூலம் பல்வேறு ஆராய்ச்சி அரங்கில் புதிய முன்னோக்குகளை மேம்படுத்துகின்றன..
ஸ்பேஷியல் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சிப்: 10x ஜெனோமிக்ஸ் விசியம்
நடைமேடை:Illumina NovaSeq இயங்குதளம்
-
முழு நீள mRNA வரிசைமுறை-நானோபூர்
ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையானது விரிவான டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்விற்கு ஒரு விலைமதிப்பற்ற கருவியாக இருந்து வருகிறது.சந்தேகத்திற்கு இடமின்றி, பாரம்பரிய குறுகிய வாசிப்பு வரிசைமுறை இங்கு பல முக்கியமான வளர்ச்சியை அடைந்தது.ஆயினும்கூட, இது பெரும்பாலும் முழு நீள ஐசோஃபார்ம் அடையாளங்கள், அளவு, PCR சார்பு ஆகியவற்றில் வரம்புகளை எதிர்கொள்கிறது.
நானோபோர் சீக்வென்சிங் மற்ற வரிசைமுறை தளங்களில் இருந்து தன்னை வேறுபடுத்திக் கொள்கிறது, இதில் நியூக்ளியோடைடுகள் டிஎன்ஏ தொகுப்பு இல்லாமல் நேரடியாக படிக்கப்படுகின்றன மற்றும் பல்லாயிரக்கணக்கான கிலோபேஸ்களில் நீண்ட வாசிப்பை உருவாக்குகின்றன.இது முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளை நேரடியாகப் படிக்கவும், ஐசோஃபார்ம்-நிலை ஆய்வுகளில் உள்ள சவால்களைச் சமாளிக்கவும் உதவுகிறது.
நடைமேடை：நானோபூர் ப்ரோமேத்யான்
நூலகம்:சிடிஎன்ஏ-பிசிஆர்
-
முழு நீள mRNA வரிசைமுறை -PacBio
டி நோவோமுழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை, என்றும் அறியப்படுகிறதுடி நோவோIso-Seq PacBio சீக்வென்சரின் நன்மைகளை வாசிப்பு நீளத்தில் எடுத்துக்கொள்கிறது, இது எந்த இடைவெளியும் இல்லாமல் முழு நீள சிடிஎன்ஏ மூலக்கூறுகளை வரிசைப்படுத்த உதவுகிறது.இது டிரான்ஸ்கிரிப்ட் அசெம்பிளி படிகளில் ஏற்படும் பிழைகளை முற்றிலும் தவிர்க்கிறது மற்றும் ஐசோஃபார்ம்-நிலை தெளிவுத்திறனுடன் யூனிஜீன் தொகுப்புகளை உருவாக்குகிறது.இந்த யுனிஜீன் தொகுப்புகள், டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்-நிலையில் "குறிப்பு மரபணு" என சக்திவாய்ந்த மரபணு தகவலை வழங்குகிறது.கூடுதலாக, அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறை தரவுகளுடன் இணைந்து, இந்தச் சேவையானது ஐசோஃபார்ம்-நிலை வெளிப்பாட்டின் துல்லியமான அளவீட்டிற்கு அதிகாரம் அளிக்கிறது.
தளம்: PacBio தொடர்ச்சி IIநூலகம்: SMRT மணி நூலகம் -
யூகாரியோடிக் எம்ஆர்என்ஏ சீக்வென்சிங்-இலுமினா
mRNA வரிசைமுறையானது குறிப்பிட்ட நிபந்தனைகளின் கீழ் செல்களில் இருந்து படியெடுக்கப்பட்ட அனைத்து mRNAகளின் விவரக்குறிப்பை செயல்படுத்துகிறது.இது மரபணு வெளிப்பாடு சுயவிவரம், மரபணு கட்டமைப்புகள் மற்றும் சில உயிரியல் செயல்முறைகளின் மூலக்கூறு வழிமுறைகளை வெளிப்படுத்தும் சக்திவாய்ந்த தொழில்நுட்பமாகும்.இன்றுவரை, mRNA வரிசைமுறையானது அடிப்படை ஆராய்ச்சி, மருத்துவ நோயறிதல், மருந்து மேம்பாடு போன்றவற்றில் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது.
இயங்குதளம்: இல்லுமினா நோவாசெக் இயங்குதளம்
-
குறிப்பு அல்லாத mRNA வரிசைமுறை-இல்லுமினா
mRNA வரிசைமுறையானது, சில சிறப்புச் செயல்பாடுகள் செயல்படும் குறிப்பிட்ட காலகட்டத்தில், தூதர் RNA(mRNA) வடிவ யூகாரியோட்டைப் பிடிக்க அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறை நுட்பத்தை (NGS) ஏற்றுக்கொள்கிறது.பிரிக்கப்பட்ட மிக நீளமான டிரான்ஸ்கிரிப்ட் 'யுனிஜீன்' என்று அழைக்கப்பட்டது மற்றும் அடுத்தடுத்த பகுப்பாய்வுக்கான குறிப்பு வரிசையாகப் பயன்படுத்தப்பட்டது, இது குறிப்பு இல்லாமல் உயிரினங்களின் மூலக்கூறு வழிமுறை மற்றும் ஒழுங்குமுறை வலையமைப்பை ஆய்வு செய்வதற்கான ஒரு சிறந்த வழிமுறையாகும்.
டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் டேட்டா அசெம்பிளி மற்றும் யூனிஜீன் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்புக்குப் பிறகு
(1)எஸ்எஸ்ஆர் பகுப்பாய்வு, சிடிஎஸ் கணிப்பு மற்றும் மரபணு அமைப்பு ஆகியவை முன்கூட்டியே உருவாக்கப்படும்.
(2) ஒவ்வொரு மாதிரியிலும் யூனிஜீன் வெளிப்பாட்டின் அளவீடு செய்யப்படும்.
(3) மாதிரிகள் (அல்லது குழுக்கள்) இடையே வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட யூனிஜீன்கள் யூனிஜீன் வெளிப்பாட்டின் அடிப்படையில் கண்டறியப்படும்
(4) வேறுபட்ட வெளிப்படுத்தப்பட்ட யூனிஜீன்களின் கிளஸ்டரிங், செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு செய்யப்படும்
-
நீண்ட குறியீட்டு அல்லாத வரிசைமுறை-இல்லுமினா
நீண்ட குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏக்கள் (எல்என்சிஆர்என்ஏக்கள்) என்பது 200 என்டிக்கு மேல் நீளம் கொண்ட ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகளின் வகையாகும், இவை மிகக் குறைந்த குறியீட்டு திறன் கொண்டவை.எல்என்சிஆர்என்ஏ, குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏக்களில் முக்கிய உறுப்பினராக, முக்கியமாக நியூக்ளியஸ் மற்றும் பிளாஸ்மாவில் காணப்படுகிறது.வரிசைப்படுத்துதல் தொழில்நுட்பம் மற்றும் உயிர் தகவலியல் வளர்ச்சியானது பல நாவல் எல்என்சிஆர்என்ஏக்களை அடையாளம் காணவும், உயிரியல் செயல்பாடுகளுடன் தொடர்புபடுத்தவும் உதவுகிறது.எல்என்சிஆர்என்ஏ எபிஜெனெடிக் ஒழுங்குமுறை, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் ஒழுங்குமுறை மற்றும் பிந்தைய டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் ஒழுங்குமுறை ஆகியவற்றில் பரவலாக ஈடுபட்டுள்ளது என்று திரட்டப்பட்ட சான்றுகள் தெரிவிக்கின்றன.
-
சிறிய ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை-இலுமினா
சிறிய ஆர்என்ஏ என்பது மைக்ரோ ஆர்என்ஏ (மைஆர்என்ஏ), சிறிய குறுக்கீடு ஆர்என்ஏ (சிஆர்என்ஏ) மற்றும் பிவி-இன்டராக்டிங் ஆர்என்ஏ (பிஆர்என்ஏ) உட்பட பொதுவாக 200ன்டிக்கும் குறைவான நீளமுள்ள குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகளின் வகுப்பைக் குறிக்கிறது.
மைக்ரோஆர்என்ஏ (மைஆர்என்ஏ) என்பது சுமார் 20-24ன்டி நீளம் கொண்ட எண்டோஜெனஸ் சிறிய ஆர்என்ஏ வகுப்பாகும், இது உயிரணுக்களில் பல்வேறு முக்கிய ஒழுங்குமுறை பாத்திரங்களை வகிக்கிறது.மைஆர்என்ஏ பல வாழ்க்கை செயல்முறைகளில் ஈடுபட்டுள்ளது, இது திசுக்களை வெளிப்படுத்துகிறது - குறிப்பிட்ட மற்றும் நிலை - குறிப்பிட்ட வெளிப்பாடு மற்றும் பல்வேறு உயிரினங்களில் மிகவும் பாதுகாக்கப்படுகிறது.
-
சர்க்ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை-இல்லுமினா
சர்க்ஆர்என்ஏக்கள் (வட்ட ஆர்என்ஏக்கள்) என்பது 5′ எண்ட் கேப் மற்றும் 3′ எண்ட் பாலி(ஏ) டெயிலுக்குக் குறைவான குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகளின் ஒரு வகுப்பாகும்.சர்க்ஆர்என்ஏக்கள் கோவலன்ட் பிணைப்பால் வட்ட அமைப்பைச் செய்கின்றன, இது ஆர்என்ஏ எக்ஸானூக்லீஸ் செரிமானத்திற்கு எதிரான நிலையாகும்.உயிரினங்களின் வளர்ச்சி மற்றும் வளர்ச்சி மற்றும் வெளிப்புற சூழலுக்கு அவற்றின் எதிர்ப்பில் சர்க்ஆர்என்ஏ முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது.
CircRNA பல செயல்பாடுகளை கொண்டுள்ளது, இது போட்டித்தன்மையுடன் miRNA ஐ பிணைக்கிறது, ceRNA இன் ஒழுங்குமுறை செயல்பாட்டை செயல்படுத்துகிறது, மரபணு வெளிப்பாட்டைக் கட்டுப்படுத்துகிறது.சமீபத்திய ஆண்டுகளில், இது நோய்களின் நிகழ்வு மற்றும் வளர்ச்சியுடன் நெருக்கமாக தொடர்புடையது என்பதும் கண்டறியப்பட்டது, மேலும் நோய் கண்டறிதல் குறிப்பான்கள் மற்றும் பலவற்றின் திசையில் சிறந்த பயன்பாட்டு வாய்ப்புகள் உள்ளன.
