அதிக செயல்திறன் வரிசைமுறைப்படுத்தல் (ATAC-seq) மூலம் டிரான்ஸ்போசேஸ்-அணுகக்கூடிய குரோமாடினுக்கான பகுப்பாய்வு
சேவை அம்சங்கள்
● டிஎன்ஏ-புரத இடைவினைகளைப் பாதுகாப்பதற்காக, இந்தச் சேவைக்கு பிரித்தெடுக்கப்பட்ட நியூக்ளிக் அமிலங்களுக்குப் பதிலாக திசு மாதிரிகள் தேவைப்படுகின்றன.
● ATAC முறையானது திசுக்களைப் பிரித்தல், அதனைத் தொடர்ந்து உட்கருக்களைப் பிரித்தெடுத்தல், Tn5 சிகிச்சை மற்றும் தூய்மைப்படுத்தல், PCR பெருக்கம், அளவுத் தேர்வு மற்றும் வரிசைப்படுத்துதல் ஆகியவற்றை உள்ளடக்கியுள்ளது.
● இல்லுமினா நோவாசீக்-இல் வரிசைப்படுத்துதல்
சேவை நன்மைகள்
●அதிக உணர்திறன்:லைப்ரரி தயாரிப்பு மற்றும் வரிசைப்படுத்துதலுக்கு, குறைந்த தொடக்க செல் எண்ணிக்கையே போதுமானது.
●மிகவும் தகவல் தரும் நுட்பம்: திறந்த குரோமாட்டின் மற்றும் படியெடுத்தல் காரணி பிணைப்புத் தளங்கள் போன்ற செயல்படும் ஒழுங்குமுறை கூறுகளின் மரபணு இருப்பிடங்களை ஒரே நேரத்தில் வெளிப்படுத்துகிறது.
●நல்ல பரிசோதனை மறுஉற்பத்தித்திறன்தொழில்நுட்ப நகல்கள் சிறந்த மீள்நிகழ்வுத்தன்மையைக் காட்டுகின்றன.
●விரிவான நிபுணத்துவம்நூற்றுக்கணக்கான ATAC வரிசைப்படுத்தல் திட்டங்களை வெற்றிகரமாக முடித்த அனுபவத்துடன், BMKGENE நிறுவனம் ஒரு தசாப்தத்திற்கும் மேலான அனுபவம், உயர் திறன்கொண்ட பகுப்பாய்வுக் குழு, விரிவான உள்ளடக்கம் மற்றும் சிறந்த விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவை வழங்குகிறது.
●டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ் பகுப்பாய்வுடன் இணைவதற்கான வாய்ப்புATAC seq-ஐ, RNA-seq போன்ற பிற ஓமிக்ஸ் தரவுகளுடன் ஒருங்கிணைந்த பகுப்பாய்வு செய்ய இது வழிவகுக்கிறது.
● விரிவான உயிரித் தகவல் பகுப்பாய்வுகுரோமாடினின் திறந்த பகுதிகள் மற்றும் அவற்றின் தொடர்புடைய செயல்பாடுகளை (புரோமோட்டர்கள், UTகள், எக்ஸான்கள், இன்ட்ரான்கள்) அடையாளம் காண்பதற்கு உதவுவது மட்டுமல்லாமல், மாதிரிகளிடையே குரோமாடின் திறந்த பகுதிகளுக்கு இடையிலான வேறுபாடுகளைப் பகுப்பாய்வு செய்யவும் உதவுகிறது.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| நூலகம் | வரிசைப்படுத்தும் உத்தி | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு வெளியீடு | தரக் கட்டுப்பாடு |
| ATAC-வரிசை | இல்லுமினா PE150 | > 20 மில்லியன் வாசிப்புகள் மரபணுத்தொகுதியின் அளவைப் பொறுத்து (மனிதன்: 50 மில்லியன் வாசிப்புகள்) | Q30≥85% |
மாதிரி தேவைகள்
மாதிரிகளின் வகை: திசுக்கள், உயிருள்ள அல்லது உறைந்த செல்கள், இரத்தம்
● அலைபேசி எண்: ≥ 106செல்கள்
● திசு எடை: ≥ 200 மி.கி புதிய திசு
● இரத்தம்: ≥ 4 மிலி
சேவை பணிப்பாய்வு
பரிசோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
டிஎன்ஏ பிரித்தெடுத்தல்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
பின்வரும் பகுப்பாய்வை உள்ளடக்கியது:
● மூலத் தரத்தின் தரக் கட்டுப்பாடு;
● மூல மரபணுத்தொகுதியுடனான பொருத்தத்தின் அடிப்படையில் சிகரங்களை அழைத்தல்;
● சிகரத்தின் இருப்பிடத்தின் மீதான மரபணுக் குறிப்புரை;
● மையக்கருப் பகுப்பாய்வு: படியெடுத்தல் காரணி பிணைப்புத் தளங்களை (TFBS) அடையாளம் காணுதல்;
● வேறுபட்ட உச்சப் பகுப்பாய்வு மற்றும் குறிப்புரை.
1. TSS மற்றும் அருகிலுள்ள பகுதிகளில் (±3 kb) ATAC ரீட்களின் பரவல் குறித்த ஹீட்மேப்.
2. வெவ்வேறு மரபணுக்கூறு கூறுகளில் திறந்த குரோமாடின் பகுதியின் பரவல்
3. குழுக்களுக்கு இடையேயான வேறுபட்ட உச்ச அழைப்பு
BMKGene-இன் ATAC வரிசைப்படுத்தல் சேவைகளால் சாத்தியமாக்கப்பட்ட ஆராய்ச்சி முன்னேற்றங்களை, கவனமாகத் தொகுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் அறிந்துகொள்ளுங்கள்.
ஃபூ, ஏ.மற்றும் பலர்.(2023) 'பாகற்காய் (Momordica charantia L. var. abbreviata Ser.)-இன் டெலோமியர்-டு-டெலோமியர் மரபணுத்தொகுப்பு ஒருங்கிணைப்பு, பழத்தின் வளர்ச்சி, அமைப்பு மற்றும் பழுக்கும் மரபியல் பண்புகளை வெளிப்படுத்துகிறது',தோட்டக்கலை ஆராய்ச்சி, 10(1). doi: 10.1093/HR/UHAC228.
கோங், பி.மற்றும் பலர்.(2023) 'கிளியோமாவில் ஒரு புற்று மரபணுவாக சுரப்பு கைனேஸ் FAM20C இன் புறமரபணு மற்றும் படியெடுத்தல் செயல்பாடு',மரபியல் மற்றும் மரபணுவியல் இதழ், 50(6), பக். 422–433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
அவர், ஒய்.மற்றும் பலர்.(2023) 'பியூட்டிரேட், c-Fos-சார்ந்த xCT ஒடுக்கத்தைத் தூண்டுவதன் மூலம் பெருங்குடல் புற்றுநோயில் ஃபெரோப்டோசிஸ் எதிர்ப்பை மாற்றியமைக்கிறது',ரெடாக்ஸ் உயிரியல், 65, ப. 102822. doi: 10.1016/J.REDOX.2023.102822.
