ʻO ke kaʻina hana bisulfite genome holoʻokoʻa
Pono lawelawe
● Paena piha: hāʻawi i ka lawelawe maikaʻi loa mai ka hoʻoheheʻe ʻana i ka laʻana, ke kūkulu hale waihona puke, ka hoʻonohonoho ʻana i ka loiloi bioinformatics.
● Pono kiʻekiʻe: Hiki i ka ʻenehana hoʻololi hoʻololi methylation makua ke nānā pono i ke kūlana methylation o kahi kumu C hoʻokahi.
● Ka uhi ākea: ʻike ʻia nā paena methylation ma ka pae genome-ākea.
● Hoʻoponopono hou maikaʻi: ka hana paʻa, kūpono no ka hoʻohālikelike hoʻohālikelike ma waena o nā laʻana he nui.
Hōʻike Laʻana
|
Papahana
|
Heluhelu Length
|
Hoʻolālā Sequencing
|
| ʻIlumina | PE 150 | 30X, ʻekolu hoʻopiʻi biological, me ka genome kuhikuhi kiʻekiʻe |
Nā Koina Laʻana
|
ʻAno Laʻana
|
Ka nui (μg)
|
Conc.(ng/μl)
|
Volume (μl)
|
Maemae
|
| gDNA | ≥ 2 | ≥ 20
| ≥ 20
| Hoʻohaʻahaʻa palena ʻia a me ka hoʻohaumia ʻana
|
Holo Hana Hana
Hāʻawi laʻana
Ka unuhi ʻana o DNA
Kūkulu hale waihona puke
Ke kaʻina ʻana
ʻIkepili ʻikepili
Hāʻawi ʻikepili
Bioinformatics
1.Genome-ākea DNA methylation mahele
2.Annotation ma ka ʻāina CGI kiʻekiʻe-methylated
