ʻO ka hoʻopaʻa ʻana i ka genome holoʻokoʻa i ka maʻi bacteria a me ka fungal
He mea koʻikoʻi nā papahana hoʻonohonoho hou-genome holoʻokoʻa a me ka fungal no ka holomua ʻana i nā genomics microbial ma o ka hiki ke hoʻopau a me ka hoʻohālikelike ʻana i nā genome microbial. Hoʻomaʻamaʻa kēia i ka ʻenekinia fermentation, ka hoʻonui ʻana i nā kaʻina hana ʻoihana, a me ka ʻimi ʻana i nā ala metabolism lua. Eia kekahi, he mea koʻikoʻi ka hoʻopili hou ʻana o ka fungal a me ka bacteria no ka hoʻomaopopo ʻana i ka hoʻololi ʻana i ke kaiapuni, ka hoʻopaʻa ʻana i nā ʻano, a me ka hōʻike ʻana i ka hoʻomohala genetic evolution, me nā hopena ākea i ka lāʻau lapaʻau, ka mahiʻai, a me ka ʻepekema kaiapuni.
Pono lawelawe
●Hoʻopili ʻia ka ʻikepili Bioinformatic i nā kelepona ʻokoʻa:Hāʻawi i nā ʻike hana i nā genomes i hoʻonohonoho hou ʻia.
● ʻIke Nui: Me nā kaukani o ka microbial re-sequencing papahana i hana ʻia i kēlā me kēia makahiki, lawe mākou i ʻoi aku o ka ʻumi makahiki o ka ʻike, kahi hui loiloi mākaukau loa, ʻike kikoʻī, a me ke kākoʻo maikaʻi loa ma hope o ke kūʻai aku.
●Kākoʻo ma hope o ke kūʻai ʻana:ʻO kā mākou kūpaʻa e ʻoi aku ma mua o ka hoʻopau ʻana o ka papahana me kahi 3 mau mahina ma hope o ke kūʻai aku ʻana. I kēia manawa, hāʻawi mākou i ka hahai ʻana o ka papahana, kōkua hoʻoponopono, a me nā hālāwai Q&A e hoʻoponopono i nā nīnau pili i nā hopena.
Nā kikoʻī lawelawe
| Anuu hoʻonohonoho | Hoʻolālā Sequencing | Manaʻo ʻia ka ʻikepili | Ka hoomalu maikai |
| ʻO Illumina NovaSeq | PE150 | Ka hohonu o 100x | Q30≥85% |
Nā Koina Laʻana
| Hoʻopaʻa (ng/µL) | huina nui (ng) | Volume (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Huakaʻi: ≥1x107 nā pūnaewele
ʻO nā mea ʻala unicellular: ≥5x106-1x107 nā pūnaewele
ʻO nā mea haʻahaʻa Macro: ≥4g
Holo Hana Hana
Hāʻawi laʻana
Kūkulu hale waihona puke
Ke kaʻina ʻana
ʻIkepili ʻikepili
Nā lawelawe ma hope o ke kūʻai aku
Loaʻa i ka ʻikepili ma lalo nei:
- Ke Kaʻina Manaʻo Kūlana ʻIkepili
- Hoʻolikelike i ka Genome Reference
- Kāhea ʻokoʻa: SNP a me InDel
- Hōʻike ʻokoʻa
Kāhea ʻokoʻa: nā ʻano SNP
Kāhea ʻokoʻa: InDel puʻunaue lōʻihi
E ʻimi i nā holomua i hoʻokō ʻia e ka BMKGene's microbial genome re-sequencing services ma o ka hōʻiliʻili ʻana o nā puke.
Jia, Y. et al. (2023) 'Hoʻohui ʻana i ka Transcriptome a me ka hoʻonohonoho hou ʻana o ka Genome holoʻokoʻa i ka nānā ʻana i nā Genes pale ʻana i ka maʻi no ka Wheat Dwarf Bunt',ʻO ka puke pai honua o ka ʻepekema molecular, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Ampicillin-controlled glucose metabolism manipulate i ka hoʻololi mai ka hoʻomanawanui i ke kū'ē i ka bacteria',Nā holomua ʻepekema, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., he bacteria haloalkaliphilic i hoʻokaʻawale ʻia mai kahi loko soda ma Inner Mongolia Autonomous Region, Kina', Int. ʻO J. Syst. Evol.Microbiol, 72, p. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. a me Wang, G.-H. (2024) 'Genome sequence o Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, kaawale mai Nasonia vitripennis',Nā Hoʻolaha Punawai Microbiology. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
