ØZeer ervaren: meer dan 200.000 monsters zijn verwerkt in BMK voor verschillende soorten monsters, waaronder celcultuur, weefsel, lichaamsvloeistof, enz. en er zijn meer dan 7.000 mRNA-Seq-projecten gesloten die verschillende onderzoeksgebieden bestrijken.
ØStrikt kwaliteitscontrolesysteem: de belangrijkste kwaliteitscontrolepunten door alle stappen, inclusief monstervoorbereiding, bibliotheekvoorbereiding, sequencing en bio-informatica, worden nauwlettend gevolgd om resultaten van hoge kwaliteit te leveren.
ØMeerdere databases beschikbaar voor functieannotatie en verrijkingsstudies om verschillende onderzoeksdoelen te bereiken.
ØAfter-sales services: After-sales services geldig voor 3 maanden na voltooiing van het project, inclusief projectopvolging, probleemoplossing, resultaten Q&A, enz.
Bibliotheek | Sequentiestrategie | Gegevens aanbevolen | Kwaliteitscontrole |
Poly A verrijkt | Illumina PE150 | 6 GB | Q30≥85% |
Nucleotiden:
Zuiverheid | Integriteit | Hoeveelheid |
OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5Beperkte of geen eiwit- of DNA-contaminatie getoond op gel. | Voor planten: RIN≥6.5;Voor dieren: RIN≥7;28S/18S≥1.0;beperkte of geen baseline verhoging | Conc.≥30 ng/μl;Volume ≥ 10 l;Totaal ≥ 1,5 g |
Weefsel: Gewicht (droog):≥1 g
*Voor weefsel kleiner dan 5 mg raden we aan om een ingevroren (in vloeibare stikstof) weefselmonster op te sturen.
Celsuspensie:Aantal cellen = 3×106- 1×107
*We raden aan om bevroren cellysaat te verzenden.In het geval dat het celgetal kleiner is dan 5 × 105, wordt flash-bevroren in vloeibare stikstof aanbevolen, wat de voorkeur heeft voor micro-extractie.
Bloedstalen:Volume≥1 ml
Micro-organisme:Massa ≥ 1 g
Container: centrifugebuisje van 2 ml (tinfolie wordt niet aanbevolen)
Sample labeling: Groep+repliceren bijv. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Verzending:
Bio-informatica
eukaryotisch workflow voor mRNA-sequencinganalyse
Bio-informatica
ØKwaliteitscontrole van onbewerkte gegevens
ØReferentie genoom uitlijning
ØAnalyse van transcriptiestructuur
ØExpressie kwantificering
ØDifferentiële expressie analyse
ØFunctieannotatie en verrijking
1.mRNA-gegevensverzadigingscurve
2.Differentiële expressieanalyse-vulkaanplot
3.KEGG-annotatie op DEG's
4.GO-classificatie op DEG's