Kleine RNA-sequencing-Illumina
Functies
● Grootteselectie van RNA vóór voorbereiding van de bibliotheek
● Bio-informatica-analyse gericht op miRNA-voorspelling en hun doelwitten
Servicevoordelen
●Uitgebreide bio-informatica-analyse:maakt de identificatie van zowel bekende als nieuwe miRNA's mogelijk, identificatie van miRNA-doelen en bijbehorende functionele annotatie en verrijking met meerdere databases (KEGG, GO)
●Strenge kwaliteitscontrole: we implementeren kerncontrolepunten in alle stadia, van monster- en bibliotheekvoorbereiding tot sequencing en bio-informatica.Deze nauwgezette monitoring garandeert de levering van resultaten van consistent hoge kwaliteit.
●Ondersteuning na verkoop: Onze inzet gaat verder dan de voltooiing van het project met een after-sales serviceperiode van 3 maanden.Gedurende deze tijd bieden we projectopvolging, hulp bij het oplossen van problemen en vraag- en antwoordsessies om eventuele vragen met betrekking tot de resultaten te beantwoorden.
●Uitgebreide expertise: met een staat van dienst in het succesvol afronden van meerdere sRNA-projecten die meer dan 100 soorten in verschillende onderzoeksdomeinen bestrijken, brengt ons team een schat aan ervaring mee naar elk project.
Monstervereisten en levering
| Bibliotheek | Platform | Aanbevolen gegevens | Gegevens kwaliteitscontrole |
| Maat geselecteerd | Illumina SE50 | 10M-20M leest | Q30≥85% |
Voorbeeldvereisten:
Nucleotiden:
| Conc. (ng/μl) | Hoeveelheid (μg) | Puurheid | Integriteit |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Beperkte of geen eiwit- of DNA-verontreiniging weergegeven op de gel. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; beperkte of geen basislijnhoogte |
● Planten:
Wortel, stengel of bloemblad: 450 mg
Blad of zaad: 300 mg
Vruchten: 1,2 gram
● Dier:
Hart of darm: 450 mg
Ingewanden of hersenen: 240 mg
Spier: 600 mg
Botten, haar of huid: 1,5 g
● Geleedpotigen:
Insecten: 9 g
Schaaldieren: 450 mg
● Volbloed: 2 buizen
● Cellen: 106 cellen
● Serum en plasma:6 ml
Aanbevolen monsterlevering
Houder:
Centrifugeerbuisje van 2 ml (aluminiumfolie wordt niet aanbevolen)
Monsterlabeling: groeperen+repliceren, bijvoorbeeld A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Verzending:
1. Droogijs: monsters moeten in zakken worden verpakt en in droogijs worden begraven.
2.RNAstable buizen: RNA-monsters kunnen worden gedroogd in een RNA-stabilisatiebuis (bijv. RNAstable®) en bij kamertemperatuur worden verzonden.
Servicewerkstroom
Experimentontwerp
Levering van monsters
RNA-extractie
Bouw van bibliotheek
Volgorde aanbrengen in
Gegevensanalyse
After-sales diensten
Bio-informatica
Identificatie van miRNA: structuur en diepte
Differentiële expressie van miRNA – hiërarchische clustering
Functionele annotatie van het doelwit van differentieel tot expressie gebrachte miRNA's
Ontdek de onderzoeksvorderingen die worden mogelijk gemaakt door de sRNA-sequencingdiensten van BMCGene via een samengestelde verzameling publicaties.
Chen, H. et al.(2023) 'Virale infecties remmen de biosynthese en fotosynthese van saponine in Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) 'Het plantaardige FYVE-domeinbevattende eiwit FREE1 associeert zich met microprocessorcomponenten om de miRNA-biogenese te onderdrukken', EMBO-rapporten, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) 'Het MicroRNA Ame-Bantam-3p controleert de ontwikkeling van de larvale poppen door zich te richten op de meerdere epidermale groeifactorachtige domeinen 8-gen (megf8) in de honingbij, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Geïntegreerde analyse van MiRNA en genen geassocieerd met vleeskwaliteit onthult dat Gga-MiR-140-5p de intramusculaire vetafzetting bij kippen beïnvloedt', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), pp. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.
