Lange niet-coderende sequencing-Illumina
Servicevoordelen
●Gezamenlijke analyse van mRNA en lncRNA: door de kwantificering van mRNA-transcripten te combineren met de studie van lncRNA en hun doelwitten, is het mogelijk een diepgaand overzicht te krijgen van het regulerende mechanisme dat ten grondslag ligt aan de cellulaire respons.
●Uitgebreide expertise: Ons team brengt een schat aan ervaring met zich mee voor elk project, met een trackrecord in het verwerken van meer dan 23.000 monsters bij BMK, verspreid over verschillende monstertypen en lncRNA-projecten.
●Strenge kwaliteitscontrole: We implementeren kerncontrolepunten in alle stadia, van monster- en bibliotheekvoorbereiding tot sequencing en bio-informatica. Deze nauwgezette monitoring garandeert de levering van resultaten van consistent hoge kwaliteit.
●Ondersteuning na verkoop: Onze inzet gaat verder dan de voltooiing van het project met een after-sales serviceperiode van 3 maanden. Gedurende deze tijd bieden we projectopvolging, hulp bij het oplossen van problemen en vraag- en antwoordsessies om eventuele vragen met betrekking tot de resultaten te beantwoorden.
Monstervereisten en levering
| Bibliotheek | Platform | Aanbevolen gegevens | Gegevens kwaliteitscontrole |
| rRNA-uitgeputte directionele bibliotheek | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30≥85% |
Nucleotiden:
| Conc. (ng/μl) | Hoeveelheid (μg) | Zuiverheid | Integriteit |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Beperkte of geen eiwit- of DNA-verontreiniging weergegeven op de gel. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; beperkte of geen basislijnhoogte |
● Planten:
Wortel, stengel of bloemblad: 450 mg
Blad of zaad: 300 mg
Vruchten: 1,2 gram
● Dier:
Hart of darm: 450 mg
Ingewanden of hersenen: 240 mg
Spier: 600 mg
Botten, haar of huid: 1,5 g
● Geleedpotigen:
Insecten: 9g
Schaaldieren: 450 mg
● Volbloed:2 buizen
● Cellen: 106 cellen
● Serum en plasma: 6 ml
Aanbevolen monsterlevering
Verpakking: centrifugebuisje van 2 ml (aluminiumfolie wordt niet aanbevolen)
Monsterlabeling: groeperen+repliceren, bijvoorbeeld A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Verzending:
1. Droogijs: Monsters moeten in zakken worden verpakt en in droogijs worden begraven.
2. RNAstable buizen: RNA-monsters kunnen worden gedroogd in een RNA-stabilisatiebuis (bijv. RNAstable®) en bij kamertemperatuur worden verzonden.
Servicewerkstroom
Experimentontwerp
Levering van monsters
RNA-extractie
Bouw van bibliotheek
Sequencing
Gegevensanalyse
After-sales diensten
Bio-informatica
Differentiële genexpressie (DEG's) analyse
Kwantificering van lncRNA-expressie – clustering
Verrijking van lncRNA-doelgenen
Gezamenlijke mRNA- en lncRNA-positieanalyse – Circos-plot (middelste cirkel is mRNA en binnenste cirkel is lncRNA)
Ontdek de vooruitgang die wordt mogelijk gemaakt door de lncRNA-equencing-diensten van BMKGene via een samengestelde verzameling publicaties.
Ji, H. et al. (2020) 'Identificatie, functionele voorspelling en belangrijke lncRNA-verificatie van koudestress-gerelateerde lncRNA's in de lever van ratten', Scientific Reports 2020 10:1, 10(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Integratieve transcriptomische analyse onthult het immuunmechanisme voor een CyHV-3-resistente gewone karpersoort', Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Multi-Omics op integratie gebaseerde prioritering van concurrerende endogene RNA-regulatienetwerken bij kleincellige longkanker: moleculaire kenmerken en kandidaat-geneesmiddelen', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Genetische dissectie van het gen-co-expressienetwerk dat ten grondslag ligt aan de fotosynthese in Populus', Plant Biotechnology Journal, 18(4), pp. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Een mondiaal regelgevingsnetwerk voor ontregelde genexpressie en abnormale metabolische signalering in immuuncellen in de micro-omgeving van de ziekte van Graves en de schildklierontsteking van Hashimoto', Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
