条形 Banner-03

Producten

DNA/RNA -sequencing - nanopore sequencer

ONT-sequencing is een real-time elektrische signaalsequencingtechnologie van enkele molecule op basis van nanoporiën, het sequencingprincipe van elk platform is hetzelfde. Dubbelstrengs DNA/RNA zal binden aan nanoporeus eiwit ingebed in de biofilm en ontspannen onder de leiding van motorische eiwit, onder werking van spanningsverschil van beide zijden van de biofilm, DNA/RNA-strengen passeren door het nanopore kanaaleiwit op een bepaald tarief. Vanwege de verschillen van de chemische eigenschappen van de verschillende basen op de DNA/RNA -streng, wanneer een enkele basis of DNA -molecuul door het nanoporiekanaal passeert, zal dit de verandering van verschillende elektrische signalen veroorzaken. Door te detecteren en overeen te komen met deze signalen, kunnen de overeenkomstige basistypen worden berekend en kan de realtime detectie van de reeks worden voltooid.


Servicegegevens

Demo -resultaat

Servicegegevens functies

Platform

Bibliotheekmaat

Theoretische gegevensopbrengst (per cel)

Enkele base nauwkeurigheid

Toepassingen

Nanopore

8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, cDNA-PCR

70-90 GB/cel

85-92%

SV-oproepen, de novo, volledige sequencing, iso-seq, gen-annotatie, detectie van DNA-methylatie

Servicevoordelen

● Meer dan 5 jaar ervaring op het Pacbio -sequencingplatform met duizenden gesloten projecten met verschillende soorten.
● BMKGENE is een officiële partner van Oxford Nanopore, met RNA/DNA -certificering met dubbele platform.
● Er zijn reguliere modellen van sequencers met volledige apparatuur en voldoende sequencing -doorvoer.
● Op basis van het Nanopore -platform zijn meer dan 10 onderzoekers van dieren- en fabriek Denovo gepubliceerd in internationaal gerenommeerde tijdschriften.

Voorbeeldvereisten


Monstertype

Hoeveelheid

Concentrtie (Qubbit ®)

Volume

Zuiverheid

Anderen

Genomisch DNA

Afhankelijk van gegevensvereiste

 ≥20ng/μl

≥15 ul

OD260/280 = 1.7-2.2;

OD260/230 ≥1,5 ;

Duidelijke piek bij 260 nm, geen verontreinigingen

Concentratie moet worden gemeten door qubit en qubit/nanopore ≤ 2

Totaal RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15 ul

OD260/280 = 1.7-2.5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ; Geen verontreinigingen

RIN -waarde ≥7,5

 

Serviceworkflow

monsterbereiding

Monsterbereiding

Bibliotheekvoorbereiding

Bibliotheekconstructie

Volgorde

Volgorde

Gegevensanalyse

Gegevensanalyse

Voorbeeld QC

Projectlevering


  • Vorig:
  • Volgende:

  • Gegevenskwaliteitsbeoordeling van DNA -monster

    Tabel 1. Statistieken over schone gegevens.

    BMKID

    rawseqnum

    rawsumbase

    schoonmaak

    Cleansumbase

    Cleann50Len

    Cleann90Len

    Cleanmeanlen

    CleanMaxlen

    schoonmaak

    DNA_BMK01

    1.218,239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28,014

    15,764

    23.090

    143,181

    9

    Gegevenskwaliteitsbeoordeling van RNA -steekproef

    Tabel 1. Statistieken over schone gegevens.

    Bestandsnaam

    ClientId

    Leesnum

    Basenum

    N50

    Gemiddelde lengte

    Maximale lengte

    Meanqscore

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047,230.083

    398

    452

    129,227

    Q12

    Figuur 1. Leeslengteverdeling lees

    A3

    Figuur 2. Kwaliteitsscore verdeling van schone gegevens

    A4

    Figuur 3. Lengte en kwaliteitsscore verdeling van schone gegevens

    A5

    Krijg een citaat

    Schrijf hier uw bericht en stuur het naar ons

    Stuur uw bericht naar ons: