BMKCloud Log in
Ik ben banner-03

Producten

DNA/RNA-sequencing – Nanopore-sequencer

ONT-sequencing is een real-time elektrische signaalsequencing-technologie met één molecuul, gebaseerd op nanoporiën. Het sequencing-principe van elk platform is hetzelfde.Dubbelstrengig DNA/RNA zal binden aan nanoporeus eiwit dat in de biofilm is ingebed en zich afwikkelen onder leiding van motoreiwit. Onder invloed van het spanningsverschil aan beide zijden van de biofilm passeren DNA/RNA-strengen het nanoporiekanaaleiwit met een bepaalde snelheid. tarief.Vanwege de verschillen in de chemische eigenschappen van de verschillende basen op de DNA/RNA-streng, zal wanneer een enkele base of DNA-molecuul door het nanoporiekanaal gaat, de verandering van verschillende elektrische signalen veroorzaken.Door deze signalen te detecteren en ermee te corresponderen, kunnen de overeenkomstige basistypen worden berekend en kan de realtime detectie van de reeks worden voltooid.


Servicedetails

Demoresultaat

Servicedetails Kenmerken

Platform

Bibliotheekgrootte

Theoretische gegevensopbrengst (per cel)

Nauwkeurigheid op één basis

Toepassingen

Nanoporie

8Kb, 10kb, 20kb, ultralang, cDNA-PCR

70-90 Gb/cel

85-92%

SV-oproep, De novo, Volledige sequencing, Iso-Seq, Genannotatie, Detectie van DNA-methylatie

Servicevoordelen

● Meer dan 5 jaar ervaring met het PacBio-sequencingplatform met duizenden gesloten projecten met verschillende diersoorten.
● BMKGENE is een officiële partner van Oxford Nanopore, met dual-platform RNA/DNA-certificering.
● Er zijn mainstream-modellen van sequencers met complete uitrusting en voldoende sequencing-doorvoer.
● Op basis van het Nanopore-platform zijn meer dan 10 dier- en plantenonderzoeken van Denovo gepubliceerd in internationaal gerenommeerde tijdschriften.

Voorbeeldvereisten


Voorbeeldtype

Hoeveelheid

Concentratie(Qubit ®)

Volume

Puurheid

Anderen

Genomisch DNA

Afhankelijk van de gegevensvereiste

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Duidelijke piek bij 260 nm, geen verontreinigingen

Concentratie moet worden gemeten met Qubit en Qubit/Nanopore ≤ 2

Totaal RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; geen verontreinigingen

RIN-waarde ≥7,5

 

Serviceworkflow

voorbereiding van het monster

Monstervoorbereiding

Voorbereiding bibliotheek

Bouw van bibliotheek

Volgorde aanbrengen in

Volgorde aanbrengen in

Gegevensanalyse

Gegevensanalyse

Voorbeeld-QC

Projectoplevering


  • Vorig:
  • Volgende:

  • Gegevenskwaliteitsbeoordeling van DNA-monster

    Tabel 1. Statistieken over schone data.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    schoonN50Len

    schoonN90Len

    schoonBetekenisLen

    schoonMaxLen

    schoonGemiddelde kwaliteit

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Gegevenskwaliteitsbeoordeling van RNA-monster

    Tabel 1. Statistieken over schone data.

    Bestandsnaam

    Klant identificatie

    LeesNum

    BasisNum

    N50

    Gemiddelde lengte

    Maximale lengte

    Gemiddelde Q-score

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Figuur 1. Lees de lengteverdeling

    A3

    Figuur 2. Verdeling van de kwaliteitsscore van schone data

    A4

    Figuur 3. Verdeling van de lengte en kwaliteitsscore van schone gegevens

    A5

    ontvang een offerte

    Schrijf hier uw bericht en stuur het naar ons

    Stuur uw bericht naar ons: