ØSuure kogemusega: BMK-s on töödeldud üle 200 000 proovi, mis hõlmavad erinevaid proovitüüpe, sealhulgas rakukultuuri, kudesid, kehavedelikke jne, ning suletud üle 7000 mRNA-Seq projekti, mis hõlmavad erinevaid uurimisvaldkondi.
ØRange kvaliteedikontrollisüsteem. Kvaliteetsete tulemuste saamiseks jälgitakse hoolikalt kõiki põhilisi kvaliteedikontrolli punkte, sealhulgas proovide ettevalmistamist, raamatukogu ettevalmistamist, järjestamist ja bioinformaatika.
ØFunktsiooni annotatsiooni ja rikastamise uuringute jaoks on saadaval mitu andmebaasi, et täita erinevaid uurimiseesmärke.
ØMüügijärgsed teenused: müügijärgsed teenused, mis kehtivad 3 kuud pärast projekti lõppu, sealhulgas projekti järelkontroll, tõrkeotsing, tulemuste küsimused ja vastused jne.
Raamatukogu | Järjestusstrateegia | Soovitatavad andmed | Kvaliteedi kontroll |
Polü A rikastatud | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nukleotiidid:
Puhtus | Terviklikkus | Summa |
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Geelil näidatud valgu- või DNA-saaste on piiratud või puudub üldse. | Taimedele: RIN≥6,5;loomadele: RIN≥7;28S/18S≥1,0;piiratud või puudub algtaseme tõus | Konts.≥30 ng/μl;Maht ≥ 10 μl;Kokku ≥ 1,5 μg |
Kude: kaal (kuiv):≥1 g
*Kudede puhul, mis on väiksemad kui 5 mg, soovitame saata kiirkülmutatud (vedelas lämmastikus) koeproov.
Rakkude suspensioon:Rakkude arv = 3 × 106- 1 × 107
*Soovitame tarnida külmutatud rakulüsaati.Juhul, kui rakkude arv on väiksem kui 5 × 105, on soovitatav kiirkülmutada vedelas lämmastikus, mis on eelistatav mikroekstraktsiooniks.
Vereproovid:Maht≥1 ml
Mikroorganism:Mass ≥ 1 g
Mahuti: 2 ml tsentrifuugitoru (tinafoolium pole soovitatav)
Näidismärgistus: rühm+kordus, nt A1, A2, A3;B1, B2, B3.....
Saadetis:
Bioinformaatika
Eukarüootne mRNA sekveneerimise analüüsi töövoog
Bioinformaatika
ØToorandmete kvaliteedi kontroll
ØVõrdlusgenoomi joondamine
ØTranskriptsiooni struktuuri analüüs
ØEkspressiooni kvantifitseerimine
ØDiferentsiaalväljenduse analüüs
ØFunktsiooni annotatsioon ja rikastamine
1.mRNA andmete küllastuskõver
2.Diferentsiaalekspressiooni analüüs - Vulkaani graafik
3.KEGG-i annotatsioon DEG-de kohta
4.GO klassifikatsioon DEG-de järgi