BMKCloud Log in
条形bänner-03

Tooted

Eukarüootne mRNA sekveneerimine-Illumina

mRNA sekveneerimine võimaldab profileerida kõiki rakkudest transkripteeritud mRNA-sid spetsiifilistes tingimustes.See on võimas tehnoloogia geeniekspressiooniprofiili, geenistruktuuride ja teatud bioloogiliste protsesside molekulaarsete mehhanismide paljastamiseks.Praeguseks on mRNA sekveneerimist laialdaselt kasutatud alusuuringutes, kliinilises diagnostikas, ravimite väljatöötamises jne.

Platvorm: Illumina NovaSeqi platvorm


Teenuse üksikasjad

Bioinformaatika

Demo tulemused

Eelised

● Suure kogemusega: BMK-s on töödeldud üle 200 000 proovi, mis hõlmavad erinevaid proovitüüpe, sealhulgas rakukultuuri, koe, kehavedelikku jne, ja üle 7000 mRNA-Seq projekti, mis hõlmavad erinevaid uurimisvaldkondi, on suletud.

● Range kvaliteedikontrolli süsteem: kvaliteetsete tulemuste saamiseks jälgitakse hoolikalt kõiki põhilisi kvaliteedikontrolli punkte, sealhulgas proovide ettevalmistamist, raamatukogu ettevalmistamist, järjestamist ja bioinformaatikat.

● Funktsiooni annotatsiooni ja rikastamise uuringute jaoks on saadaval mitu andmebaasi, et täita erinevaid uurimiseesmärke.

● Müügijärgsed teenused: müügijärgsed teenused, mis kehtivad 3 kuud pärast projekti lõppu, sealhulgas projekti järelkontroll, tõrkeotsing, tulemuste küsimused ja vastused jne.

Näidisnõuded ja kohaletoimetamine

Raamatukogu Järjestusstrateegia Soovitatavad andmed Kvaliteedi kontroll
Polü A rikastatud Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Näidisnõuded:

Nukleotiidid:

Kontsentr. (ng/μl)

Kogus (μg)

Puhtus

Terviklikkus

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280 = 1,7-2,5

OD260/230 = 0,5-2,5

Geelil näidatud valgu- või DNA-saaste on piiratud või puudub üldse.

Taimedele: RIN≥6,5;

Loomadele: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

algtaseme tõus on piiratud või puudub

Kude: kaal (kuiv):≥1 g
*Kudede puhul, mis on väiksemad kui 5 mg, soovitame saata kiirkülmutatud (vedelas lämmastikus) koeproov.

Rakkude suspensioon:Rakkude arv = 3 × 106- 1 × 107
*Soovitame tarnida külmutatud rakulüsaati.Kui selle rakkude arv on väiksem kui 5 × 105.

Vereproovid:Maht≥1 ml

Mikroorganism:Mass ≥ 1 g

Soovitatav näidiste kohaletoimetamine

Mahuti: 2 ml tsentrifuugitoru (tinafoolium pole soovitatav)

Näidismärgistus: rühm+kordus nt A1, A2, A3;B1, B2, B3.....

Saadetis:

  1. Kuivjää: proovid tuleb pakkida kottidesse ja matta kuiva jää sisse.
  2. RNA-stabiilsed torud: RNA proove saab kuivatada RNA stabiliseerimiskatsutis (nt RNAstable®) ja tarnida toatemperatuuril.

Teeninduse töövoog

QC näidis

Katsekujundus

proovi kohaletoimetamine

Näidiste kohaletoimetamine

Pilootkatse

RNA ekstraheerimine

Raamatukogu ettevalmistamine

Raamatukogu ehitus

Järjestus

Järjestus

Andmete analüüs

Andmete analüüs

Müügijärgsed teenused

Müügijärgsed teenused


  • Eelmine:
  • Järgmine:

  • Bioinformaatika

    wps_doc_10

    Eukarüootne mRNA sekveneerimise analüüsi töövoog

    Bioinformaatika

    ØToorandmete kvaliteedi kontroll

    ØVõrdlusgenoomi joondamine

    ØÄrakirja struktuuri analüüs

    ØEkspressiooni kvantifitseerimine

    ØDiferentsiaalväljenduse analüüs

    ØFunktsiooni annotatsioon ja rikastamine

    1.mRNA andmete küllastuskõver

    3(1)

    2.Diferentsiaalekspressiooni analüüs - Vulkaani graafik

    4(1)

    3.KEGG-i annotatsioon DEG-de kohta

    5(1)

    4.GO klassifikatsioon DEG-de järgi

    6(1)

    saada hinnapakkumist

    Kirjutage oma sõnum siia ja saatke see meile

    Saada meile oma sõnum: