page_head_bg

Tooted

Eukarüootne mRNA sekveneerimine - Illumina

mRNA sekveneerimine võimaldab profileerida kõiki rakkudest transkripteeritud mRNA-sid spetsiifilistes tingimustes.See on võimas tehnoloogia geeniekspressiooniprofiili, geenistruktuuride ja teatud bioloogiliste protsesside molekulaarsete mehhanismide paljastamiseks.Praeguseks on mRNA sekveneerimist laialdaselt kasutatud alusuuringutes, kliinilises diagnostikas, ravimite väljatöötamises jne.

Platvorm: Illumina NovaSeq 6000


Teenuse üksikasjad

Bioinformaatika

Demo tulemused

Eelised

ØSuure kogemusega: BMK-s on töödeldud üle 200 000 proovi, mis hõlmavad erinevaid proovitüüpe, sealhulgas rakukultuuri, kudesid, kehavedelikke jne, ning suletud üle 7000 mRNA-Seq projekti, mis hõlmavad erinevaid uurimisvaldkondi.

ØRange kvaliteedikontrollisüsteem. Kvaliteetsete tulemuste saamiseks jälgitakse hoolikalt kõiki põhilisi kvaliteedikontrolli punkte, sealhulgas proovide ettevalmistamist, raamatukogu ettevalmistamist, järjestamist ja bioinformaatika.

ØFunktsiooni annotatsiooni ja rikastamise uuringute jaoks on saadaval mitu andmebaasi, et täita erinevaid uurimiseesmärke.

ØMüügijärgsed teenused: müügijärgsed teenused, mis kehtivad 3 kuud pärast projekti lõppu, sealhulgas projekti järelkontroll, tõrkeotsing, tulemuste küsimused ja vastused jne.

Näidisnõuded ja kohaletoimetamine

Raamatukogu Järjestusstrateegia Soovitatavad andmed Kvaliteedi kontroll
Polü A rikastatud Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Näidisnõuded:

Nukleotiidid:

Puhtus Terviklikkus Summa
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Geelil näidatud valgu- või DNA-saaste on piiratud või puudub üldse. Taimedele: RIN≥6,5;loomadele: RIN≥7;28S/18S≥1,0;piiratud või puudub algtaseme tõus Konts.≥30 ng/μl;Maht ≥ 10 μl;Kokku ≥ 1,5 μg

Kude: kaal (kuiv):≥1 g
*Kudede puhul, mis on väiksemad kui 5 mg, soovitame saata kiirkülmutatud (vedelas lämmastikus) koeproov.

Rakkude suspensioon:Rakkude arv = 3 × 106- 1 × 107
*Soovitame tarnida külmutatud rakulüsaati.Juhul, kui rakkude arv on väiksem kui 5 × 105, on soovitatav kiirkülmutada vedelas lämmastikus, mis on eelistatav mikroekstraktsiooniks.

Vereproovid:Maht≥1 ml

Mikroorganism:Mass ≥ 1 g

Soovitatav näidiste kohaletoimetamine

Mahuti: 2 ml tsentrifuugitoru (tinafoolium pole soovitatav)

Näidismärgistus: rühm+kordus, nt A1, A2, A3;B1, B2, B3.....

Saadetis:

  1. Kuivjää: proovid tuleb pakkida kottidesse ja matta jäässe.
  2. RNA-stabiilsed torud: RNA proove saab kuivatada RNA stabiliseerimiskatsutis (nt RNAstable®) ja tarnida toatemperatuuril.

Teeninduse töövoog

logo_01

Katsekujundus

logo_02

Näidiste kohaletoimetamine

logo_03

RNA ekstraheerimine

logo_04

Raamatukogu ehitus

logo_05

Järjestus

logo_06

Andmete analüüs

logo_07

Müügijärgsed teenused


  • Eelmine:
  • Järgmine:

  • Bioinformaatika

    2(1)

    Eukarüootne mRNA sekveneerimise analüüsi töövoog

    Bioinformaatika

    ØToorandmete kvaliteedi kontroll

    ØVõrdlusgenoomi joondamine

    ØTranskriptsiooni struktuuri analüüs

    ØEkspressiooni kvantifitseerimine

    ØDiferentsiaalväljenduse analüüs

    ØFunktsiooni annotatsioon ja rikastamine

    1.mRNA andmete küllastuskõver

    3(1)

    2.Diferentsiaalekspressiooni analüüs - Vulkaani graafik

    4(1)

    3.KEGG-i annotatsioon DEG-de kohta

    5(1)

    4.GO klassifikatsioon DEG-de järgi

    6(1)

    saada hinnapakkumist

    Kirjutage oma sõnum siia ja saatke see meile

    Saada meile oma sõnum: