Väike RNA

Väikesed RNA-d on lühikesed mittekodeerivad RNA-d keskmise pikkusega 18–30 nt, sealhulgas miRNA, siRNA ja piRNA, millel on oluline roll regulatiivsetes protsessides. BMKCloud sRNA torujuhe pakub nii standardset kui ka kohandatud analüüsi miRNA tuvastamiseks. Pärast lugemise kärpimist ja kvaliteedikontrolli joondatakse lugemised mitme andmebaasiga, et klassifitseerida sRNA-sid ja valida miRNA-sid ning kaardistada need referentsgenoomi. miRNA-d identifitseeritakse teadaolevate miRNA andmebaaside põhjal, mis annavad teavet sekundaarstruktuuri, miRNA perekonna ja sihtgeenide kohta. Diferentsiaalse ekspressiooni analüüs tuvastab diferentsiaalselt ekspresseeritud miRNA-d ja vastavad sihtgeenid annoteeritakse funktsionaalselt rikastatud kategooriate leidmiseks.