生物体の元の位置での遺伝子発現パターンを探索することは、その細胞の種類と機能を理解するために非常に重要です。ただし、現在の空間トランスクリプトーム解析方法には、スループットが低い、解像度が不十分であるなどの制限があります。BMKMANU が開発した BMKMANU S1000 空間チップは、完全な組織切片の in-situ 遺伝子発現情報を細胞以下の解像度で検出でき、組織構造の微妙な解釈を可能にします。
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製品のコンポーネント
BMKMANU S1000 空間チップおよび適合試薬キットには以下が含まれます。
1) 組織最適化キット。組織最適化 (組織透過性の最適な時間の探索) のための試薬が含まれています。
2) 遺伝子発現キット。その後のライブラリー調製および配列決定のために組織切片内の mRNA を捕捉するための試薬が含まれています。
3) スタートアップキット: サーモスタットアダプターとトランスクリプトーム磁気分離器が含まれています。
技術原理
このチップは微小孔とマイクロビーズに基づいており、マイクロビーズ上のオリゴを介して mRNA をその場で捕捉できます。Oligo は、Read1、空間バーコード、UMI、および Poly(dT)VN の 4 つの部分で構成されます。組織がチップに付着すると、透過化酵素によって mRNA が組織から放出されます。ほとんどの mRNA 3' 末端には Poly-A テールがあるため、Poly(dT)VN を備えたオリゴによって捕捉されます。RT-PCR および cDNA 増幅、ライブラリーの調製および配列決定の後、空間バーコードによって空間位置の追跡が行われます。これにより、空間的位置および組織の不均一性における遺伝子発現解析が可能になります。
製品の利点
アプリケーション
腫瘍、疾患、免疫学、発生生物学など、生物学および医学研究のほとんどの分野に適用でき、細胞以下の解像度での空間発現解析により、これらの分野で新たなブレークスルーを達成するのに役立ちます。
●腫瘍と病気:
腫瘍と疾患の空間的不均一性と微環境
腫瘍や病気の発症と進行
腫瘍や病気の治療反応
●発生生物学
臓器の時空間アトラス
発生時の遺伝子調節機構
●ストレス反応
生物的ストレス反応
非生物的ストレス反応
●免疫学
臓器移植における免疫応答
腫瘍と病気の免疫機構
自己免疫疾患の発症機序
●薬剤耐性分析
薬剤耐性のメカニズム
新薬の研究開発
事例とデモデータ
BMKMANU S1000 は、さまざまな組織タイプにわたる数百の症例で性能が検証されています。
