新製品発売 – BMKMANU S1000、細胞内レベルの空間トランスクリプトミクス

生物の本来の場所で遺伝子発現パターンを探索することは、その細胞の種類と機能を理解する上で不可欠です。しかしながら、現在の空間トランスクリプトーム解析法には、スループットの低さや解像度の不足といった限界があります。BMKMANUが開発したBMKMANU S1000空間チップは、完全な組織切片におけるin situ遺伝子発現情報を細胞レベル以下の解像度で検出し、組織構造の微妙な解釈を可能にします。

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製品コンポーネント

BMKMANU S1000 空間チップおよび対応する試薬キットには以下が含まれます。

1) 組織最適化キットには、組織最適化（組織透過化の最適な時期の探索）用の試薬が含まれています。

2) 遺伝子発現キット。組織切片中の mRNA を捕捉し、その後のライブラリ調製および配列決定を行うための試薬が含まれています。

3) スタートアップキット: サーモスタットアダプターとトランスクリプトーム磁気分離器が含まれています。

技術原理

このチップはマイクロポアとマイクロビーズを基盤としており、マイクロビーズ上のオリゴを介してmRNAをin situで捕捉することができます。オリゴは、Read1、空間バーコード、UMI、およびPoly(dT)VNの4つの部分で構成されています。組織をチップに接着すると、mRNAは透過化酵素によって組織から放出されます。ほとんどのmRNAの3'末端はPoly-Aテールを持つため、Poly(dT)VNを含むオリゴによって捕捉されます。RT-PCRとcDNA増幅、ライブラリー調製、シーケンシングの後、空間バーコードを介して空間位置追跡が行われます。これにより、空間的な位置や組織の異質性を考慮した遺伝子発現解析が可能になります。