lncrna

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長い非コーディングRNA(LNCRNA)は、コード能力が低いが重要な調節機能を備えた200を超えるヌクレオチドを超えるRNAです。 Bmkcloud lncrnaパイプラインは、LNCRNAとmRNAの発現を一緒に分析することにより、高品質の適切な注釈付き参照ゲノムでrRNA枯渇ライブラリを分析するように設計されています。読み取りのトリミングと品質制御の後、読み取りは参照ゲノムに合わせて転写産物を組み立て、その後の遺伝子構造分析により、代替のスプライシングと新規遺伝子が明らかになります。転写産物はmRNAまたはlNCRNAとして特定され、微分発現解析により、微分発現されたLNCRNA、その標的、および微分発現遺伝子(deg)が識別されます。 degと差次的に発現したlncRNAターゲットの両方に、濃縮された機能カテゴリを見つけるために機能的に注釈が付けられます。

 

バイオインフォマティクス

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