小さなRNA

スモールRNAは、平均長さ18～30ヌクレオチドの短い非コードRNAであり、miRNA、siRNA、piRNAなどを含み、制御プロセスにおいて重要な役割を果たします。BMKCloud sRNAパイプラインは、miRNA同定のための標準解析とカスタム解析の両方を提供します。リードトリミングと品質管理の後、リードは複数のデータベースとアラインメントされ、sRNAが分類され、miRNAが選別され、参照ゲノムにマッピングされます。miRNAは既知のmiRNAデータベースに基づいて同定され、二次構造、miRNAファミリー、標的遺伝子に関する情報が提供されます。差次的発現解析では、差次的に発現するmiRNAが同定され、対応する標的遺伝子に機能的なアノテーションが付与され、エンリッチメントされたカテゴリが特定されます。