小型RNA

小型RNAは、miRNA、siRNA、piRNAなどを含む、平均長18～30ヌクレオチドの短い非コードRNAであり、調節プロセスにおいて重要な役割を果たします。BMKCloud sRNAパイプラインは、miRNA同定のための標準およびカスタム解析の両方を提供します。リードのトリミングと品質管理の後、リードは複数のデータベースに対してアライメントされ、sRNAの分類とmiRNAの選択が行われ、参照ゲノムにマッピングされます。miRNAは既知のmiRNAデータベースに基づいて同定され、二次構造、miRNAファミリー、および標的遺伝子に関する情報が提供されます。差次的発現解析により、差次的発現miRNAが同定され、対応する標的遺伝子に機能アノテーションが付けられ、濃縮されたカテゴリが特定されます。