Explorar los patrones de expresión genética en la ubicación original de un organismo es crucial para comprender los tipos y funciones de sus células.Sin embargo, los métodos actuales de análisis del transcriptoma espacial tienen limitaciones, como un bajo rendimiento o una resolución insuficiente.El chip espacial BMKMANU S1000, desarrollado por BMKMANU, puede detectar información de expresión genética in situ en secciones de tejido completas con resolución subcelular, lo que permite una interpretación matizada de la estructura del tejido.
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Componentes del producto
El chip espacial BMKMANU S1000 y el kit de reactivos correspondiente incluyen:
1) Kit de optimización de tejidos, que contiene reactivos para la optimización de tejidos (tiempo óptimo de exploración para la permeabilización de los tejidos).
2) Kit de expresión genética, que contiene reactivos para capturar ARNm en cortes de tejido para su posterior preparación y secuenciación de la biblioteca.
3) Kit de Inicio: Incluye un adaptador termostático y un separador magnético transcriptoma.
Principio técnico
El chip se basa en microporos y microperlas, y el ARNm se puede capturar in situ a través de Oligo en las microperlas.Oligo se compone de cuatro partes: Read1, Spatial Barcode, UMI y Poly(dT)VN.Una vez que el tejido se une al chip, una enzima de permeabilización libera ARNm del tejido.Dado que la mayoría de los extremos 3' del ARNm tienen una cola Poly-A, Oligo los captura con Poly (dT) VN.Después de la RT-PCR y la amplificación del ADNc, la preparación de la biblioteca y la secuenciación, se logra el seguimiento de la posición espacial mediante el código de barras espacial.Esto permite el análisis de la expresión génica en ubicaciones espaciales y la heterogeneidad del tejido.
Ventajas del producto
Aplicaciones
Se puede aplicar a la mayoría de las áreas de la investigación biológica y médica, incluidos tumores, enfermedades, inmunología y biología del desarrollo, lo que ayuda a lograr nuevos avances en estos campos con el análisis de expresión espacial con resolución subcelular.
●Tumor y enfermedad:
Heterogeneidad espacial y microambiente de tumores y enfermedades.
Inicio y desarrollo de tumores y enfermedades.
Respuesta al tratamiento de tumores y enfermedades.
●Biología del desarrollo
Atlas espaciotemporal de órganos.
Mecanismos de regulación genética durante el desarrollo.
●Respuesta al estrés
Respuesta al estrés biótico
Respuesta al estrés abiótico
●Inmunología
Respuesta inmune en el trasplante de órganos.
Mecanismos inmunológicos de tumores y enfermedades.
Patogenia de las enfermedades autoinmunes.
●Análisis de resistencia a los medicamentos
Mecanismos de resistencia a los medicamentos.
Investigación y desarrollo de nuevos fármacos.
Casos y datos de demostración
El rendimiento de BMKMANU S1000 ha sido verificado en cientos de casos en diferentes tipos de tejidos.
