किसी जीव के मूल स्थान पर जीन अभिव्यक्ति पैटर्न की खोज करना उसकी कोशिकाओं के प्रकार और कार्यों को समझने के लिए महत्वपूर्ण है।हालाँकि, वर्तमान स्थानिक प्रतिलेख विश्लेषण विधियों में कम थ्रूपुट या अपर्याप्त रिज़ॉल्यूशन जैसी सीमाएँ हैं।BMKMANU द्वारा विकसित BMKMANU S1000 स्थानिक चिप, उपकोशिकीय रिज़ॉल्यूशन पर संपूर्ण ऊतक अनुभागों में इन-सीटू जीन अभिव्यक्ति जानकारी का पता लगा सकती है, जिससे ऊतक संरचना की सूक्ष्म व्याख्या संभव हो पाती है।
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उत्पाद घटक
BMKMANU S1000 स्थानिक चिप और मिलान अभिकर्मक किट में शामिल हैं:
1) ऊतक अनुकूलन किट, जिसमें ऊतक अनुकूलन के लिए अभिकर्मक शामिल हैं (ऊतक पारगम्यता के लिए इष्टतम समय अन्वेषण)।
2) जीन एक्सप्रेशन किट, जिसमें बाद की लाइब्रेरी तैयारी और अनुक्रमण के लिए ऊतक स्लाइस में एमआरएनए कैप्चर करने के लिए अभिकर्मक शामिल हैं।
3) स्टार्टअप किट: एक थर्मोस्टेटिक एडॉप्टर और एक ट्रांसक्रिप्टोम चुंबकीय विभाजक शामिल है।
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तकनीकी सिद्धांत
चिप माइक्रोप्रोर्स और माइक्रोबीड्स पर आधारित है, और एमआरएनए को माइक्रोबीड्स पर ओलिगो के माध्यम से सीटू में कैप्चर किया जा सकता है।ओलिगो चार भागों से बना है: रीड1, स्थानिक बारकोड, यूएमआई, और पॉली(डीटी)वीएन।ऊतक को चिप से जोड़ने के बाद, एक पारगम्यीकरण एंजाइम द्वारा ऊतक से एमआरएनए छोड़ा जाता है।चूंकि अधिकांश एमआरएनए 3' सिरों में पॉली-ए पूंछ होती है, इसलिए उन्हें पॉली (डीटी) वीएन के साथ ओलिगो द्वारा पकड़ लिया जाता है।आरटी-पीसीआर और सीडीएनए प्रवर्धन, पुस्तकालय की तैयारी और अनुक्रमण के बाद, स्थानिक बारकोड के माध्यम से स्थानिक स्थिति का पता लगाया जाता है।यह स्थानिक स्थानों और ऊतक विविधता में जीन अभिव्यक्ति विश्लेषण की अनुमति देता है।
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उत्पाद लाभ
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अनुप्रयोग
इसे ट्यूमर, रोग, प्रतिरक्षा विज्ञान और विकासात्मक जीव विज्ञान सहित जैविक और चिकित्सा अनुसंधान के अधिकांश क्षेत्रों में लागू किया जा सकता है, जिससे उपकोशिकीय रिज़ॉल्यूशन पर स्थानिक अभिव्यक्ति विश्लेषण के साथ इन क्षेत्रों में नई सफलताएं प्राप्त करने में मदद मिलती है।
●ट्यूमर और रोग:
ट्यूमर और रोगों की स्थानिक विविधता और सूक्ष्म वातावरण
ट्यूमर और बीमारियों की शुरुआत और विकास
ट्यूमर और रोगों की उपचार प्रतिक्रिया
●विकासात्मक जीवविज्ञान
अंगों का स्पैटिओटेम्पोरल एटलस
विकास के दौरान जीन नियामक तंत्र
●तनाव प्रतिक्रिया
जैविक तनाव प्रतिक्रिया
अजैविक तनाव प्रतिक्रिया
●इम्यूनोलॉजी
अंग प्रत्यारोपण में प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया
ट्यूमर और रोगों की प्रतिरक्षा तंत्र
ऑटोइम्यून रोगों का रोगजनन
●दवा प्रतिरोध विश्लेषण
दवा प्रतिरोध के तंत्र
नई दवाओं का अनुसंधान एवं विकास
मामले और डेमो डेटा
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BMKMANU S1000 को विभिन्न प्रकार के ऊतकों में सैकड़ों मामलों में प्रदर्शन-सत्यापित किया गया है।
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