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単核 RNA シーケンス

単一細胞捕捉およびハイスループットシークエンシングと組み合わせた個別ライブラリー構築技術の進歩により、細胞ごとの遺伝子発現研究が可能になります。これにより、複雑な細胞集団に対するより深く完全なシステム分析が可能になり、すべての細胞の平均を取ることで不均一性をマスキングすることが大幅に回避されます。

ただし、一部の細胞は単細胞懸濁液にするのに適していないため、組織からの核抽出という他のサンプル前処理方法が必要です。つまり、組織または細胞から核を直接抽出し、単細胞懸濁液を調製して単核懸濁液を調製します。細胞の配列決定。

BMK は、10x Genomics ChromiumTM ベースの単一細胞 RNA シーケンスサービスを提供します。このサービスは、免疫細胞の分化、腫瘍の不均一性、組織発生などの疾患関連の研究で広く使用されています。

空間トランスクリプトームチップ: 10× ゲノミクス

プラットフォーム: Illumina NovaSeq プラットフォーム

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サービス内容

バイオインフォマティクス

デモの結果

技術原理

核の単離は、二重交差を備えた 8 チャネルのマイクロ流体システムで構成される 10× Genomics ChromiumTM によって実現されます。このシステムでは、バーコードとプライマー、酵素、および単一の核を備えたゲルビーズがナノリットルサイズの油滴にカプセル化され、ゲルビーズインエマルジョン（GEM）が生成されます。GEM が形成されると、各 GEM で細胞の溶解とバーコードの解放が実行されます。mRNA は、10x バーコードと UMI を使用して cDNA 分子に逆転写され、さらに標準的なシーケンシングライブラリー構築が行われます。

単一細胞懸濁液の調製に適さない組織

細胞・組織	理由
新鮮でない冷凍組織	新しい組織または長期間保存された組織を取得できない
筋細胞、巨核球、脂肪…	セルの直径が大きすぎて機器に入ることができません
肝臓…	壊れやすい、単一細胞を区別できない
神経細胞、脳…	より敏感でストレスを受けやすいため、シーケンス結果が変化します
膵臓、甲状腺…	内因性酵素が豊富で、単一細胞懸濁液の生成に影響を与えます。

単核 vs 単細胞

単核	単細胞
無制限のセル直径	セル直径：10～40μm
材料は凍結組織でもよい	材料は新鮮な組織でなければなりません
凍結細胞の低ストレス	酵素処理は細胞ストレス反応を引き起こす可能性がある
赤血球を除去する必要はありません	赤血球を除去する必要がある
核は生体情報を表現する	細胞全体が生体情報を表現する