メタゲノミクス (NGS)

イルミナによるショットガン メタゲノミクスは、複雑なサンプルから DNA を直接配列決定することでマイクロバイオームを研究するための人気のあるツールであり、分類学的および機能的多様性の両方の研究を可能にします。 BMKCloud メタゲノム (NGS) パイプラインは、品質管理とメタゲノム アセンブリから始まり、そこから遺伝子が予測され、複数のデータベースを使用して機能と分類の注釈が​​付けられる非重複データセットにクラスター化されます。この情報は、サンプル内の分類学的多様性 (アルファ多様性) とサンプル間の多様性 (ベータ多様性) を分析するために使用されます。グループ間の差分分析では、パラメトリックテストとノンパラメトリックテストの両方を使用して 2 つのグループ間で異なる OTU と生物学的機能が検出され、相関分析ではこれらの差異が環境要因に関連付けられます。