全トランスクリプトームシーケンス – イルミナ
特徴
● 完全なトランスクリプトームをシーケンスするためのデュアル ライブラリー: rRNA 除去、その後 PE150 ライブラリーの調製、サイズ選択、その後に SE50 ライブラリーの調製
● 個別のバイオインフォマティクス レポートでの mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA の完全なバイオインフォマティクス分析
● ceRNA ネットワーク解析を含む、統合レポートでのすべての RNA 発現の共同解析。
サービスのメリット
●規制ネットワークの詳細な分析: ceRNA ネットワーク解析は、mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA の共同シーケンスと徹底的なバイオインフォマティクス ワークフローによって可能になります。
●包括的な注釈: 私たちは複数のデータベースを使用して、Differently Expressed Genes (DEG) に機能的にアノテーションを付け、対応するエンリッチメント分析を実行して、トランスクリプトーム応答の根底にある細胞および分子プロセスに関する洞察を提供します。
●幅広い専門知識: さまざまな研究領域で 2000 を超えるトランスクリプトーム プロジェクト全体を成功裡に完了させた実績を持つ私たちのチームは、あらゆるプロジェクトに豊富な経験をもたらします。
●厳格な品質管理: サンプルおよびライブラリーの調製からシーケンスおよびバイオインフォマティクスに至るまで、すべての段階にわたってコア管理ポイントを実装します。この細心の注意を払ったモニタリングにより、一貫して高品質の結果が確実に提供されます。
● 包括的な注釈: 私たちは複数のデータベースを使用して、Differently Expressed Genes (DEG) に機能的にアノテーションを付け、対応するエンリッチメント分析を実行して、トランスクリプトーム応答の根底にある細胞および分子プロセスに関する洞察を提供します。
●販売後のサポート: 当社のコミットメントは、プロジェクトの完了を超えて 3 か月のアフターサービス期間まで延長されます。この期間中、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティング支援、結果に関する質問に対処するための Q&A セッションを提供します。
サンプルの要件と納品
| 図書館 | シーケンス戦略 | 推奨されるデータ | 品質管理 |
| rRNAが枯渇した | イルミナPE150 | 16ギガバイト | Q30≧85% |
| 選択したサイズ | イルミナ SE50 | 1,000～2,000万回の読み取り |
サンプル要件:
ヌクレオチド:
| 濃度(ng/μl) | 量（μg） | 純度 | 誠実さ |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5～2.5 ゲル上にタンパク質や DNA の汚染はほとんど見られないか、まったく見られません。 | 植物: RIN≥6.5 動物: RIN≧7.0 5.0≧28S/18S≧1.0; 基準高度が限られているか、基準高度がない |
推奨されるサンプル配信
容器：
2 ml 遠沈管 (錫箔は推奨しません)
ラベル付けのサンプル: グループ + 複製 (A1、A2、A3 など)。B1、B2、B3……
出荷:
1.ドライアイス：サンプルを袋に詰めてドライアイスに埋める必要があります。
2.RNAstable チューブ: RNA サンプルは RNA 安定化チューブ (例: RNAstable®) 内で乾燥し、室温で出荷できます。
サービスのワークフロー
実験計画
サンプル納品
RNA抽出
図書館の建設
シーケンス
データ分析
アフターサービス
バイオインフォマティクス
RNA発現の概要
差次的に発現される遺伝子
ceRNA解析
差次的に発現される miRNA および関連 RNA
厳選された出版物コレクションを通じて、BMKGene の全トランスクリプトーム シーケンス サービスによって促進された研究の進歩を探索してください。
Dai, Y. et al.(2022) 「RNA シーケンスによって特定されたカシン・ベック病における mRNA、lncRNA、および miRNA の包括的な発現プロファイル」、Molecular Omics、18(2)、154–166 ページ。土井: 10.1039/D1MO00370D。
Liu、N.nanら。(2022) 「越冬期間中の長白山のセイヨウアピス セラーナの耐寒性の全長トランスクリプトーム分析。」、Gene、830、pp. 146503–146503。土井：10.1016/J.GENE.2022.146503。
ワン、XJら。(2022) 「小細胞肺癌における競合内因性 RNA 制御ネットワークのマルチオミクス統合に基づく優先順位付け: 分子特性と薬剤候補」、Frontiers in Oncology、12、p.904865.doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX。
Xu、P.ら。(2022) 「lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA 発現プロファイルの統合分析により、ピーナッツのネコブセンチュウに応答する潜在的なメカニズムに対する新たな洞察が明らかになりました」、BMC Genomics、23(1)、1 ～ 12 ページ。土井: 10.1186/S12864-022-08470-3/図/7。
ヤン、Z.ら。(2022) 「全トランスクリプトーム RNA シーケンスは、赤色 LED 照射によるブロッコリーの収穫後の品質の維持に関連する分子機構を強調します。」、Postharvest Biology and Technology、188、p.111878. 土井: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
